В начале XIX в. началось преподавание восточных языков и востоковедных дисциплин в университетах России. Согласно первому Уставу российских университетов 1804 г., на отделениях словесных наук полагалось иметь кафедру восточных языков. Постепенно центр российского востоковедения начал перемещаться в столицу империи. В 1816 г. действовавший в Санкт-Петербурге Педагогический институт был преобразован в Главный педагогический институт со статусом университета. В 1818 г. два приглашенных из Парижа французских ориенталиста Жан Франсуа Деманж и Франсуа Бернар Шармуа начали преподавать восточные языки на историко-филологическом факультете. Деманж возглавил кафедру арабской словесности, а Шармуа — кафедру персидской словесности. Третьим преподавателем с 1819 г. стал Мирза Джа- фар Топчибашев, который вел занятия по персидскому, турецкому и арабскому языкам
В 1819 г. Александр I своим указом фактически воссоздал Санкт-Петербургский университет. В рамках историко-филологического факультета был создан восточный разряд. Дальнейшее расширение изучения восточных языков в стенах Санкт-Петербургского университета связано с именем О. И. Сенковского, который приступил к преподаванию в 1822 г. В 1839 г. в университете была организована еще одна кафедра — турецкого языка, на которую был приглашен А. О. Мухлинский. А к началу 1850-х гг. в Санкт-Петербургском университете уже существовало шесть востоковедных кафедр: арабская, персидская, турецкая, азербайджанская, армянская и грузинская.
В 1818 г. в Санкт-Петербурге возникло первое специализированное востоковедное учреждение в системе Академии наук. Им стал Азиатский музей, включавший в себя самую большую в Европе коллекцию восточных рукописей и ксилографов, библиотеку с собранием восточных и западноевропейских книг по востоковедению и хранилище восточных монет. Первым директором Азиатского музея был назначен академик Христиан Мартин Френ. После его кончины почти сорок лет (в 18421881 гг.) во главе Азиатского музея стоял Б. А. Дорн. Предполагалось, что Музей станет центром по сбору, хранению и изучению книг на восточных языках, рукописей и других «диковинок», привозимых в Россию из стран Востока. В 1849 г. музей стал издавать специализированный журнал на французском языке «Азиатские записки» (Melanges Asiatiques). Создание Азиатского музея положило начало формированию в России академического научного востоковедения. Вначале Азиатский музей размещался в здании Кунсткамеры, а затем переехал в комплекс зданий Академии наук на Университетской набережной.
В Московском университете первым профессором кафедры восточных языков в 1818 г. стал А. В. Болдырев, прошедший стажировку в ведущих востоковедных центрах Европы (в Геттингене у И. Г. Эйхгорна и в Париже у Сильвестра де Саси). В дальнейшем он прославился как автор первой на русском языке грамматики арабского языка и составитель хрестоматий по арабскому и персидскому языкам. Профессор А. В. Болдырев преподавал в Московском университете арабистику и иранистику, принял участие в создании фонда восточных книг в университетской библиотеке. В 1832 г. он стал деканом словесного отделения, а с 1833 г. — ректором Московского университета. Однако в 1836 г. после публикации «Философического письма» П. Я. Чаадаева он был арестован, исключен из числа университетских преподавателей и провел год в тюрьме. Изгнание А. В. Болдырева из Московского университета пагубно сказалось на судьбе востоковедения в этом учебном заведении, после его увольнения кафедра восточных языков долгие годы оставалась вакантной.
Помимо Санкт-Петербургского и Московского университетов, преподавание восточных языков в Российской империи в начале XIX в. также велось в Дерптском (ныне — Тартуский) и Виленском (ныне — Вильнюсский) университетах. 7 января 1818 г. в Одессе был открыт Ришельевский лицей, приравненный к высшим учебным заведениям. Согласно уставу 1837 г., в него входил Институт восточных языков, просуществовавший до 1854 г.
Важным центром востоковедения в России в XIX в. становится Казанский университет. В 1807 г. там была образована кафедра восточных языков, которую возглавил Христиан Мартин (Христиан Данилович) Френ, получивший востоковедную подготовку в университетах Германии (Росток, Геттинген, Тюбинген). Он организовал преподавание арабского языка. После его отъезда в Петербург эту должность занял Ф. И. Эрдман. В университете началась подготовка по татарскому, турецкому и персидскому языкам.
В 1815 г. Москве был основан Лазаревский институт восточных языков, куда постепенно переместился центр московского востоковедения. Название этого института обусловлено тем, что средства на его организацию (200 тысяч рублей) были пожертвованы богатыми армянскими меценатами братьями Лазаревыми. В XIX в. в стенах Института изучались армянский, грузинский, турецкий, татарский, арабский и персидский языки. С 1850 г. началось преподавание азербайджанского языка. Лазаревский институт готовил своих воспитанников для работы в качестве драгоманов и секретарей в дипломатических представительствах России в странах Ближнего и Среднего Востока.
