Налоговый кодекс РФ не содержит разъяснений по данному вопросу.
По данному поводу существует две точки зрения.
Официальной позиции нет.
Есть судебные решения, согласно которым транзитное движение товаров свидетельствует о получении налогоплательщиком необоснованной налоговой выгоды.
Однако в некоторых решениях указано, что транзитное движение товаров не свидетельствует о нереальности сделки и не является признаком недобросовестности.
Подробнее см. документы
Позиция 1. Транзитное движение товаров является признаком получения необоснованной налоговой выгоды (недобросовестности)
Постановление ФАС Поволжского округа от 30.04.2008 N А12-9146/07
Суд указал, что транзитное движение товаров от субпоставщика напрямую к покупателю является признаком получения необоснованной налоговой выгоды.
Позиция 2. Транзитное движение товаров не является признаком получения необоснованной налоговой выгоды (недобросовестности)
Постановление ФАС Московского округа от 08.08.2011 N КА-А40/8434-11 по делу N А40-134895/10-76-799
Суд указал, что транзитная схема поставки товаров не является основанием для отказа в применении заявителем налоговых вычетов в связи с отсутствием нарушения налогового законодательства или проявления недобросовестности.
Аналогичные выводы содержит...
Постановление ФАС Московского округа от 05.03.2010 N КА-А40/1569-10 по делу N А40-59609/09-116-375
Постановление ФАС Центрального округа от 08.04.2008 по делу N А62-3976/2007 (Определением ВАС РФ от 08.09.2008 N 9934/08 отказано в передаче данного дела в Президиум ВАС РФ)
Суд указал, что использование транзитной схемы движения товара само по себе не является доказательством недобросовестности налогоплательщика, поэтому не может служить основанием для отказа в применении налоговых вычетов.
Постановление ФАС Центрального округа от 30.10.2008 N А62-1602/2008
Суд указал, что доводы инспекции о наличии транзитной схемы движения товара, об отсутствии складских помещений не свидетельствуют о недобросовестности общества. Транспортировка товара от отправителя напрямую к конечному покупателю, минуя склад экспортера, соответствует воле сторон по договору, является общераспространенной практикой и направлена на снижение издержек.
Постановление ФАС Северо-Кавказского округа от 14.03.2006 N Ф08-791/2006-349А по делу N А32-21757/2005-5/126
Суд сделал вывод, что если налогоплательщик не может представить копии железнодорожных накладных ввиду отсутствия их у него, поскольку он не является грузоотправителем и грузополучателем товара, при том что счета-фактуры были поданы, а также факт оплаты товара подтвержден платежными поручениями, то это не свидетельствует о получении необоснованной налоговой выгоды.