3 января 2002 г. зафиксировано летное происшествие (причины и последствия не приводились) с самолетом F/A-18E (165781/NK 200) из эскадрильи VFA-115.
18 октября 2002 г. два F/A-18F (165881/NH 105 и 165889/NH 115) из эскадрильи VFA-41 упали в море в 130 милях юго-западнее г. Монтерей, шт. Калифорния. Самолеты вместе с шестью другими «Супер Хорнетами» этой эскадрильи выполняли плановый тренировочный полет. Поиски членов экипажей, которые велись в течение 33 ч, результатов не дали, глубина моря в районе падения самолетов составляет 3500 м. Рыболовным судном было обнаружено пятно ГСМ примерно в 70 морских милях западнее мыса Сар.
18 февраля 2003 г. F/A-18E из эскадрильи VFA-147 авиакрыла авианосца «Карл Винсон» упал в море на удалении 45 миль от авианосца, летчик катапультировался и был подобран поисково-спасательным вертолетом.
F/A-l8Е "Супер Хорнет"
14 октября 2004 г. при заходе на посадку ночью на авиабазе Пойнт-Мугу, шт. Калифорния, F/A- 18F из эскадрильи VX-9 задел деревья. Посадка была выполнена благополучно, но посторонними предметами были повреждены оба двигателя.
29 января 2005 г. При посадке F/A-18F из эскадрильи VFA-102 на авианосец «Китти Хок», находившийся в 100 милях юго-восточнее г. Йокосука, Япония, произошел обрыв троса аэрофинешера; самолет выкатился за пределы полетной палубы и утонул, оба члена экипажа благополучно катапультировались и были спасены вертолетом; ранения получили шесть человек из палубной команды авианосца.
16 марта 2005 г. F/A-18F из эскадрильи VFA-122 выполнил посадку с зацеплением за аэрофинишер на авиабазе Фаллон, шт. Невада, с невыпущенной основной опорой шасси.
18 июля 2005 г. в районе полигона авиабазы Чайна-Лэйк при отработке маневрирования в тренировочном воздушном бою столкнулись в воздухе F/A-18E и F/A-18F, полет выполнялся с авиабазы Лимур, шт. Калифорния. Члены экипажа F/A-18F катапультировались, но получили серьезные ранения. Летчик F/A-18E при катапультировании погиб, его тело было обнаружено только спустя двое суток после катастрофы.
12 ноября 2006 г. У F/A-18F № 166659 «AD-217» из эскадрильи VFA- 106 на посадке после выполнения демонстрационного полета на авиашоу по случаю «Дня открытых дверей» авиабазы Пенсакола, шт. Флорида, произошел разрыв пневматика колеса правой основной опоры шасси; самолет сошел с ВПП, повреждения от контакта с грунтом получил правый стабилизатор.
7 января 2008 г. При возвращении после боевого вылета в Ирак над северной частью Персидского залива столкнулись и упали в море самолеты F/A-18E (166656/АС-406) из эскадрильи VFA-105 и F/A-18F (166632/АС-100) из эскадрильи VFA-11 3-го палубного авиакрыла, действовавшего в тот период времени с авианосца «Гарри С. Трумен». Все члены экипажей благополучно катапультировались и были спасены вертолетом.
13 августа 2009 г. Пожар в воздухе двигателя на самолете F/A-18F 166463 «NJ-133» из эскадрильи VFA- 122, самолет выполнил посадку на авиабазе Чайна Лэйк, летчики не пострадали.
18 июля 2010 г. Истребители- бомбардировщики F/A-18E эскадрильи VFA-115 166649 «АС-413» и 166651 «АС-401» столкнулись в воздухе над территорией Пакистана после выполнения боевого вылета в Афганистан, оба самолета смогли выполнить посадки на авианосец «Гарри С. Труман». Самолеты направлены на восстановительный ремонт.
12 марта 201 1 г. после выполнения боевого вылета в Афганистан при посадке на авианосец у самолета «Супер Хорнет» загорелись тормоза колес шасси.
Апрель 201 1 г. За несколько секунд до взлета с катапульты авианосца «Джон С. Стеннис», находившегося у берегов Калифорнии, начался пожар правого двигателя самолета «Супер Хорнет»; 1 1 человек палубной команды получили ранения.
6 апреля 201 1 г. в Калифорнии разбился F/A-18F из эскадрильи VFA-122, выполнявший полет с авиабазы Лимур, оба члена экипажа погибли. Самолет упал примерно в 1 км от ВПП авиабазы Лимур. Члены экипажа входили в демонстрационную пилотажную группу авиации Западного побережья (West Cost Demonstration team), полет выполнялся в рамках подготовки к ежегодному авиашоу.