В основном борьба с этими вызовами происходит в рамках ШОС. Но есть и свои органы в СНГ, например АТЦ.
Антитеррористический центр государств — участников Содружества Независимых Государств (АТЦ СНГ), созданный Решением Совета глав государств СНГ от 21 июня 2000 года, является постоянно действующим специализированным отраслевым органом Содружества Независимых Государств и предназначен для обеспечения координации взаимодействия компетентных органов государств — участников СНГ в области борьбы с международным терроризмом и иными проявлениями экстремизма. Образован Решением Совета глав государств-участников СНГ (СГГ СНГ) от 21 июня 2000 года. 1 декабря 2000 года Решением СГГ СНГ утверждено Положение об Антитеррористическом Центре СНГ, установлении численности сотрудников и финансовом обеспечении деятельности.
Руководитель АТЦ СНГ утверждается Решением СГГ СНГ, в настоящее время —— Новиков. АТЦ координирует антитеррористическую деятельность силовых и других соответствующих ведомств стран-участниц и исследует собственно угрозы. Проводятся совместные антитерр. Учения (последнее - "Дон-Антитеррор-2012")
С наркотрафиком, в основном из Афгана идущим, борются пограничники стран СНГ. Есть Совет командующих пограничных войск стран СНГ, там деятельность координируют. Проблема провоза наркотиков через границы тесно связана с проблемой нелегальной миграции – ведь чтобы провезти наркоту, необязательно продумывать хитроумные схемы обмана – можно просто нелегально пересечь границу. С этим тоже борются пограничники.
Основной сухопутный маршрут нелегальной миграции проходит через Таджикистан, Кыргызстан в Казахстан, Россию и далее через Беларусь, Украину, Молдову и северо-западные районы России в страны Западной Европы и Скандинавии. Вместе с тем, приток незаконных мигрантов осуществляется также из Турции и Ирана через территории стран Закавказского региона. Такой миграции способствуют несовершенность миграционного контроля между странами СНГ, чересчур либеральный режим разрешения въезда и так далее.
В 1998 году главы правительств девяти государств - участников СНГ подписали Соглашение о сотрудничестве государств - участников СНГ в борьбе с незаконной миграцией. Однако отсутствие должного механизма реализации Соглашения вынудило создать Совместную комиссию из полномочных представителей правительств государств - участников Соглашения, деятельность которой направлена на эффективное взаимодействие в борьбе с незаконной миграцией.Принята Концепция сотрудничества государств - участников СНГ в противодействии незаконной миграции.По инициативе Совета министров внутренних дел государств - участников СНГ разработана и согласована Программа сотрудничества государств - участников СНГ в борьбе с незаконной миграцией
Каналы нелегальной миграции все чаще используются организованными преступными группировками, а также служат прикрытием для переправки членов международных террористических и экстремистских организаций (то есть все эти “новые вызовы” связаны между собой, если разобраться). С принятием главами государств СНГ в 1996 году Межгосударственной программы совместных мер борьбы с организованной преступностью и иными видами опасных преступлений на территории государств - участников СНГ на период до 2000 года сотрудничество приобрело многоплановый, комплексный, динамичный характер. Реализация данной и последующих программ позволила за эти годы создать серьезную международно-правовую базу сотрудничества в сфере борьбы с терроризмом, преступностью, незаконным оборотом наркотиков, незаконной миграцией, по противодействию преступлениям в сфере экономики, правонарушениям в области интеллектуальной собственности и другим. Принят ряд конвенций, в том числе действует базовый документ - Конвенция о правовой помощи и правовых отношениях по гражданским, семейным и уголовным делам. Общие мероприятия, сотрудничество с ООН. Создан и функционирует специализированный банк данных Бюро по координации борьбы с организованной преступностью и иными опасными видами преступлений на территории государств - участников СНГ. Информационные данные этого банка используются правоохранительными органами государств - участников СНГ.
Важное значение имеет подписание 5 октября 2007 года главами государств в рамках СНГ Договора о противодействии легализации (отмыванию) преступных доходов и финансированию терроризма.
