Налоговый кодекс РФ не содержит разъяснений по данному вопросу.
Согласно официальной позиции, если объем груза, отправленного на экспорт, уменьшился вследствие его естественной убыли, ставка 0 процентов применяется ко всему экспортному товару. Есть судебные решения, подтверждающие данный подход.
Подробнее см. документы
Письмо Минфина России от 26.10.2004 N 03-04-08/94
Финансовое ведомство разъяснило, что в отношении экспортируемых товаров, по которым выявлены потери от недостачи и (или) порчи при транспортировке в пределах норм естественной убыли, ставка НДС 0 процентов и, соответственно, вычеты по товарам (работам, услугам), используемым при реализации указанных товаров, применяются в полном объеме.
Аналогичные выводы содержит...
Постановление ФАС Западно-Сибирского округа от 14.03.2007 N Ф04-1399/2007(32400-А27-25) по делу N А27-14544/2006-2
Постановление ФАС Московского округа от 09.06.2009 N КА-А40/4729-09 по делу N А40-44894/08-143-168
Постановление ФАС Московского округа от 29.10.2009 N КА-А40/11470-09-П по делу N А40-24958/08-109-55
Суд установил, что отгрузка меньшего количества товара, чем было приобретено налогоплательщиком для реализации, произошла в результате нормативных потерь при прокачке нефти по трубопроводу и не превысила норм естественной убыли, поэтому отказ в применении ставки 0 процентов был признан неправомерным.
Аналогичные выводы содержит...
Постановление ФАС Московского округа от 31.01.2006, 24.01.2006 N КА-А40/14236-05 по делу N А40-29439/05-139-226
Постановление ФАС Поволжского округа от 06.02.2007 по делу N А55-11801/06-54
Суд указал на то, что выявленная несущественная разница в весе товара объясняется в том числе естественным изменением массы деревянной тары из-за перемены климатических условий в процессе хранения товара.
Постановление ФАС Уральского округа от 22.08.2007 N Ф09-6633/07-С2 по делу N А07-1078/07
Суд пришел к выводу о том, что в периоде совершения операции в соответствии со ст. 7 Федерального закона от 06.06.2005 N 58-ФЗ применялись Нормы естественной убыли, установленные Приказом Минтопэнерго России от 01.10.1998 N 318, и разница между отгруженным на экспорт и фактически вывезенным количеством товара соответствует данным Нормам.
Аналогичные выводы содержит...
Постановление ФАС Поволжского округа от 03.03.2005 N А57-1510/04-16
Постановление ФАС Уральского округа от 14.11.2007 N Ф09-9368/07-С2 по делу N А07-5923/07
Постановление ФАС Уральского округа от 30.07.2007 N Ф09-5829/07-С2 по делу N А07-1079/07
Постановление ФАС Уральского округа от 25.07.2007 N Ф09-5740/07-С2 по делу N А07-2937/07
Постановление ФАС Уральского округа от 17.04.2007 N Ф09-2662/07-С2 по делу N А07-25568/06
Постановление ФАС Уральского округа от 15.03.2007 N Ф09-1606/07-С2 по делу N А07-21817/06
Постановление ФАС Уральского округа от 05.03.2007 N Ф09-1206/07-С2 по делу N А07-19814/06
Постановление ФАС Уральского округа от 01.02.2007 N Ф09-210/07-С2 по делу N А07-23278/06
Постановление ФАС Уральского округа от 24.10.2005 N Ф09-6091/04-С7
Постановление ФАС Уральского округа от 07.05.2007 N Ф09-2648/07-С2 по делу N А07-23838/06
Суд сделал вывод, согласно которому общество правомерно применило ставку 0 процентов ко всему объему нефтепродуктов, указанному в декларации, так как разница в объеме возникла в результате естественной убыли, связанной с изменениями товара при нормальных условиях его транспортировки и хранения.