ДНК-связывающие белки, участвующие в регуляции транскрипции

В молекулярной биологии и генетики, фактор транскрипции (иногда называют последовательности конкретных ДНК -связывающего фактор) является белок, который связывается со специфическимипоследовательностями ДНК, тем самым контролируя поток (или транскрипцию) генетической информации от ДНК к РНК. Факторы транскрипции выполнять эту функцию в одиночку или с другими белками в комплексе, путем содействия (как активатора), или блокирование (как репрессор) вербовку РНК-полимеразы (фермента, который выполняет транскрипцию генетической информации от ДНК РНК) в специфических генов.

Определяющей чертой транскрипционных факторов является то, что они содержат один или несколько ДНК-связывающие домены (DBDS), которые крепятся к специфических последовательностей ДНК, прилегающей к генов, которые они регулируют. Дополнительные белки, такие как коактиваторов, хроматина ремонтом, гистонов ацетилазы, деацетилазы, киназы и метилазы, в то же время играет решающую роль врегуляции генов, не хватает ДНК-связывающих доменов, и, следовательно, не подпадают под определение факторов транскрипции.

Сохранение в разных организмов

Факторы транскрипции имеют важное значение для регуляции экспрессии генов и, как следствие, найденные во всех живых организмах. Количество факторов транскрипции, найденных в организме увеличивается с размером генома, и больших геномов, как правило, имеют больше факторов транскрипции на геном.

Есть около 2600 белков в человеческом геноме, которые содержат ДНК-связывающие домены, и большинство из них, как предполагается, действовал в качестве транскрипционных факторов, хотя другие исследования показывают, что это будет меньшее количество.

Структура

Принципиальная схема аминокислотной (аминоконце к левой и карбоновой кислоты конца справа) о прототипе транскрипционного фактора, который содержит (1) в ДНК-связывающий домен (DBD), (2) сигнал зондирования домена (SSD), и домен трансактивации (TAD).Порядок размещения и числа доменов могут отличаться в различных типах факторов транскрипции. Кроме того, трансактивации и сигнал зондирования функции часто содержится в том же домене.

Факторы транскрипции имеют модульную структуру и содержать следующие домены:

· ДНК-связывающий домен (DBD), которые придают специфических последовательностей ДНК (энхансерили Promoter: необходимым компонентом всех векторов: используется для привода транскрипцию трансгенных вектора в промоторных последовательностей), прилегающих к регулируемых генов.Последовательности ДНК, которые связываются факторы транскрипции, часто называют чувствительными элементами.

· Транс-активации домена (TAD), которые содержат сайты связывания для других белков, таких кактранскрипции coregulators. Эти сайты связывания часто называют функциями активации (AFS).

· Дополнительный домен чувствительный сигнал (SSD) (например, лиганд-связывающий домен), который воспринимает сигналы от внешних и, в ответ, передает эти сигналы на остальной части комплекса транскрипции, в результате чего вверх или вниз регуляции экспрессии генов. Кроме того, DBD и сигнал зондирования домены могут находиться на отдельных белков, которые связывают в транскрипции комплекса регулировать экспрессию генов.