У прокариот выявлено несколько различных МГЭ: IS-элементы, транспозоны, плазмиды, а также некоторые бактериофаги.
IS-элементы (insertion sequences)
IS-элементы их еще называют инсерционные последовательности чаще состоят из 700 – 1500 пар нуклеотидов. На их концах располагаются инвертированные повторы, необходимые для перемещения, и содержащие обычно 10-40 пар нуклеотидов. В составе IS-элементов содержится один или несколько генов ответственных за их перемещение (транспозицию) по геному. Продуктом этих генов является транспозаза – белок, обеспечивающий перемещение IS-элемента. Транспозиция IS-элементов может происходить двумя способами. При транспозиции IS-элемента по первому способу происходит его удвоение, при этом одна из его копий остается на прежнем месте, а вторая встраивается в новый участок ДНК. Встраивание IS-элемента сопряжено также и с удвоением сайта-мишени, имеющего определенную длину (обычно 5 – 10 пар нуклеотидов) для каждого элемента. Обычно IS-элементы могут интегрировать в различные участки генома бактерий. В тоже время некоторые последовательности ДНК могут оказаться более предпочтительными, чем другие. При втором способе перемещения
происходит вырезание IS-элемента и последующее его встраивание в другой участок генома. IS-элементы при транспозиции могут попасть в регуляторную или кодирующую части гена и вследствие этого его инактивировать, или нарушить его нормальную регуляцию. IS-элементы могут влиять и на экспрессию генов расположенных с ними поблизости.
Транспозоны
Транспозоны (Tn-элементы) обладают теми же характеристиками, что и IS-элементы, но несут дополнительные гены, несвязанные с транспозицией. Такими генами могут быть:
а) гены устойчивости к антибиотикам, позволяющие бактериальной клетке выживать в присутствии соответствующих антибиотиков;
б) гены устойчивости к тяжелым металлам и другим ядам, позволяющие бактерии выживать при их наличии в среде обитания;
в) гены токсинов, снижающие жизнеспособность хозяев;
г) гены, позволяющие бактериям использовать нетрадиционные субстраты;
д) другие гены.
Транспозон может быть организован, так же, как и IS-элемент.
Но в отличие от IS-элементов транспозоны еще несут дополнительные гены, несвязанные с транспозицией. Как и IS-элементы транспозоны ограничены короткими прямыми повторами, возникшими в результате дупликации при его интеграции в геном.
Механизм перемещения Tn-элементов сходен с таковым IS-элементов. Встраивание транспозонов, как и IS-элементов, может происходить в различные районы генома. Однако они могут предпочитать определенные области хромосом для интеграции. Транспозоны способны передавать заключенные в них гены от одних бактерий другим, что может играть важную роль при адаптации бактерий к антибиотикам или продуцирования ими новых токсинов.
Плазмиды
В бактериальных клетках присутствуют внехромосомные факторы наследственности – плазмиды. Они способны переносить генетическую информацию от одной бактерии в другую. Существуют плазмиды, способные обратимо интегрировать в хромосому. Их называют – эписомы. Эписомы, обычно, содержат IS- или Tn-элементы, благодаря которым они могут включаться в состав хромосомы. Размер ДНК плазмид составляет 0,1 – 5 % размера хромосомы. Плазмиды в большинстве случаев кольцевые, ковалентнозамкнутые, суперсперализованные молекулы ДНК. Однако, существуют и линейные плазмиды, у таких плазмид концы защищены белками или соединены ковалентно. Плазмиды несут гены, необязательные для бактерий: гены устойчивости к антибиотикам; гены устойчивости к тяжелым металлам и другим ядам; гены токсинов; гены, позволяющие бактериям использовать нетрадиционные субстраты; другие гены.
Плазмиды для своей репликации используют клеточный репликативный аппарат. Каждая плазмида представляет собой репликон, репликация которого находится под контролем, поэтому каждая плазмида в клетке бактерии представлена определенным числом копий. Различают:
а) однокопийные плазмиды – представлены в клетке одной копией на клетку;
б) мультикопийные плазмиды, присутствуют в клетке обычно в 10 – 20 копиях;
в) плазмиды с ослабленным контролем репликации, они могут накапливаться в клетке до 1000 копий.
Плазмиды могут передаваться от одной бактерии к другой при конъюгации. В связи с этим различают трансмиссивные плазмиды. Эти плазмиды содержат tra-гены.
Плазмиды могут иметь широкий круг хозяев. Их называют космополитными плазмидами. Существуют плазмиды, способныет существовать в клетках грамположительных и грамотрицательных бактерий. Существуют плазмиды, способные существовать как в
прокариотических клетках, так и в клетках дрожжей.
