Ихтиофауна Байкала весьма разнообразна и в настоящее время представлена 55 видами и подвидами из 15 семейств. Большинство видов не являются промысловыми.
Многие представители ихтиофауны Байкала эндемичны. Главным образом это различные виды семейства глубинных широколобок. К категории редких и исчезающих отнесены байкальский осетр и даватчан (Красная книга России), таймень и ленок (Красные книги Бурятии и Иркутской области), а также елохинская и карликовая широколобки (Красная книга Иркутской области).
Промыслом в настоящее время охватываются 13 видов рыб, среди которых акклиматизированные в бассейне Байкала амурский сазан, амурский сом и лещ. На основании мониторинговых исследований ОАО "Востсибрыбцентр" (до 2006 г. – ФГУП "Востсибрыбцентр") ежегодно оценивает состояние запасов водных биоресурсов, определяет общие допустимые уловы (ОДУ) рыбы и нерпы. Вылов (добыча) водных биоресурсов в оз. Байкал в 2007 г. был регламентирован
следующими нормативными документами:
· приказ Росприроднадзора от 27.12.2006 г. № 530 «Об утверждении заключения экспертной комиссии государственной экологической экспертизы материалов, обосновывающих общие допустимые уловы рыбы и нерпы в озере Байкал на 2007 год»;
· приказ ФГУ "Забайкальский национальный парк" от 12.05.2006 № 37 "Об утверждении Положения об охране водных биоресурсов и порядке рыболовства в акватории оз. Байкал и других водоемах ФГУ "Забайкальский национальный парк".
Байкальский омуль – основной промысловый вид, относится к озерно-речным проходным сиговым, нагуливается в оз. Байкал, на нерест идет во впадающие в него реки.
Представлен тремя морфо-экологическими группами (пелагической, придонно-глубоководной, прибрежной), разделение которых обусловлено геологическими процессами возникновения Байкала, приведшими к возможности освоения омулем кормовой базы пелагиали открытого Байкала, батиальной части, а также прибрежной отмели в пределах свала глубин.
Численность нерестовых стад омуля. Общая численность нерестовых стад омуля, заходящих в основные реки для воспроизводства, за последние 50 лет колебалась в пределах 3,0–7,6 млн. экз. По численности выделяются нерестовые стада рек Верхняя Ангара (1,3-3,9 млн. экз.) и Селенга (0,7-3,7 млн. экз.). В реку Баргузин заходит 0,1-0,6 млн. экз. производителей омуля. Количество омуля, заходящего на нерест в речки Посольского сора и полностью переведенного на искусственное воспроизводство, составляет 0,1-0,7 млн. экз. Численность производителей омуля, заходящих на нерест в речки Чивыркуйского залива, рр. Кичера, Кика, Турка, и некоторых других популяций малых рек Байкала (менее 0,05 млн. экз.) незначительна, и какой-либо заметной роли в формировании промысловых стад не играет. Однако, роль малых рек очевидна в сохранении разнокачественности популяций омуля.
В 2007 г. количество производителей омуля, зашедших в реки составило 4,1 млн. экз., что ниже среднемноголетнего уровня (5,0 млн. экз).
Численность пелагического омуля, заходящего в р. Селенгу с 2000 г. остается на уровне 1,0 млн. экз. (0,7-0,9 млн. экз. в 2001-2002 гг. и 1,0-1,3 млн. экз. в 2004-2007 гг.), за исключением 2003 г., когда было учтено более 2,6 млн. экз. В 2007 г. воспроизводственный потенциал прибрежного омуля в р. Верхняя Ангара, остался на удовлетворительном уровне, и составил 2,8 млн. экз., в 2000-2006 гг. – 2,2-3,9 млн. экз. Численность омуля, нерестящегося в р. Баргузин и его притоке р. Ине в 2007 г. осталась на низком уровне – 0,165 млн. экз., но при этом находилась в пределах межгодовых колебаний. В 2007 г. зафиксирована самая низкая за последние 17 лет численность производителей придонно-глубоководного омуля в речках Посольского сора – всего 0,07 млн. экз., обусловленнаобщим падением его запасов.
Численность личинок омуля. Общая численность личинок омуля, скатывающихся в Байкал, несмотря на значительные межгодовые колебания и исключая их очень низкую численность в предзапретный период, находится на уровне 2-3 млрд. экз. В период с 2001 г. по 2007 г. численность скатывающихся личинок омуля была достаточно высокой – 3,6 млрд. экз.
К 2007 г. состояние запасов байкальского омуля ОАО «Востсибрыбцентр» оценивало на удовлетворительном уровне, хотя и ниже средних величин, наблюдаемых за два последних десятилетия. Решением экспертной комиссии государственной экологической экспертизы Росприроднадзора (приказ № 530 от 27.12.2006 г.) предлагаемая Востсибрыб центром на 2007 г. величина возможного вылова в 2100 т была утверждена в качестве ОДУ. В пределах акватории национального парка Забайкальский лов омуля проводился в порядке традиционного природопользования.
В 2007 г. по официальным данным добыто 900 т омуля. Фактический вылов омуля, принимая во внимание экспертную оценку неучтенного вылова, был выше статистических данных примерно на 92% и составил не менее 1727 т (в 2006 г. – 2026 т), или 82,2% от утвержденной величины ОДУ. Таким образом, 48% вылова омуля в 2007 г. было незаконным (2006 г. – 44%). Снижения объемов незаконного вылова можно ожидать лишь при усилении контроля над выловом и улучшении социально-экономической обстановки в регионе. Байкальский осетр – наиболее ценный эндемичный представитель ихтиофауны озера. Несмотря на многолетний запрет и проводимые мероприятия по искусственному воспроизводству, не наблюдается заметного увеличения запасов осетра. Основная причина – браконьерский вылов как производителей, так и разновозрастной молоди. Выпускаемая с рыбоводного завода и скатывающаяся по р. Селенге молодь осетра в больших количествах в раннем возрасте (1-3 года) попадает в сетные орудия лова и погибает. Объем искусственного воспроизводства осетра представлен на. Заметное снижение, по сравнению с 2002-2003 гг., количества подрощенной в 2005-2006 гг. молоди осетра обусловлено, прежде всего, проблемами с производителями (перезревание производителей собственного маточного стада, содержащегося в садках на Гусиноозерском осетровом рыбоводном хозяйстве, использующем теплые воды ГРЭС, и недостаточное количество производителей, отловленных в р. Селенге). В 2007 г. Проблема перезревания производителей была частично решена, и на экспериментальном Селенгинском омулево-осетровом рыбоводном заводе (ЭСРЗ) на инкубацию было заложено 2688 тыс. шт. икры байкальского осетра от собственного маточного стада. Но качество полученной икры осталось невысоким, было получено 1575 тыс. шт. личинок, а в р. Селенгу выпущено 1064 тыс. шт. подрощенной молоди осетра. Дальнейшее наращивание объемов выпуска молоди осетра и достижение проектной мощности ЭСРЗ в 2,0 млн. шт. подрощенной молоди возможно после завершения реконструкции завода.
Хариус. В оз. Байкал обитает подвид сибирского хариуса – (черный) байкальский хариус Thymallus arcticus baicalensis Dyb. и его экологическая раса – белый байкальский хариус Thymallus arcticus baicalensis brevipinnis Swet. Таксономический статус байкальского хариуса остается предметом дискуссий ученых.
Байкальская нерпа (Pusa\Phoca sibirica Gm.) – единственное млекопитающее Байкала, эндемик, заселяет всю акваторию водоема. Распространение зависит от сезона года, кочевки носят преимущественно пищевой характер, отчасти обусловлены ледовыми (температурными) условиями. Общая численность популяции долгое время сохранялась очень высокой, но, начиная со вспышки эпизоотии (чума плотоядных) и массовой гибели нерпы в 1987-1989 гг. она, вероятно, начала сокращаться. В 2000-е годы численность оставалась большой (около 100 тыс. голов) и достаточно стабильной, хотя по косвенным данным в настоящее время она несколько сокращается.
Динамика возрастной структуры, относительного количества самок в возрастных группах и индексы беременности самок по возрастным группам показывают, что в 2000-х годах в целом процесс «постарения» популяции приостановился, несколько сократилась репродуктивная активность самок всех возрастов (особенно значительно – осенью 2006 года), а также изменился спектр питания и ухудшились показатели линейного и весового роста, упитанности. Эти материалы свидетельствуют о наличии (возникновении) дисбаланса в системе «нерпа-рыба», обусловленным не столько естественным процессом колебания численности популяции нерпы (саморегуляция численности или приведение её в равновесное состояние с емкостью среды), сколько с ухудшением условий питания. Нерпа типичный ихтиофаг и завершает трофическую цепь озера. Поэтому её благосостояние во многом определяется состоянием популяций рыб, служащих её питанием, и одновременно нерпа оказывает огромное влияние как непосредственно на ихтиофауну (регулируя численность пелагических рыб: малая и большая голомянки, бычки - желтокрылка и длиннокрылка, отчасти -омуль), так и опосредовано, высвобождая кормовую базу для сиговых рыб.
Высокая средняя удельная рождаемость в популяции в последние годы (более 20%, за исключением 2006 г.) и значительный экологический потенциал (около 50% численности самок неполовозрелые) позволяют вести строго лимитируемый промысел нерпы, в последние годы - преимущественно для нужд коренного населения.
Величина общего допустимого изъятия (ОДУ) нерпы составляет 5-6 тыс. шт. в год. По заключению государственной экологической экспертизы МПР России ОДУ устанавливается неоправданно ниже: в 2005-2006 г.г. – 3500 шт., в 2007 г. – всего 600 шт., причем уже после сезона добычи. По этой причине в 2007 г. работы с целью изучения состояния популяции нерпы не проводились. Общее изъятие нерпы (промысел, неофициальная добыча, «утечка», потери в результате охоты) составляет не менее 5-6 тыс. в год (экспертная оценка).
В 2000-2007 гг. Институтом геохимии им. А.П. Виноградова СО РАН совместно с Медицинским Университетом г. Гданьска, Польша, проведены исследования содержания химических элементов в байкальской нерпе. С помощью методов ICP-MS и ICP-AES определены концентрации Al, Ba, Cd, Cu, Fe, Mn, Mo, Si, Sr, Zn, Ca, K, Mg, Na и P в печени байкальской нерпы. Исследования показали, что содержание исследованных химических элементов в гидробионтах оз. Байкал находится в пределах нормы, а их накопление, в первую очередь, связано с физиологическими особенностями животных, а не с антропогенным воздействием на водоем.
1. В период с 2004 по 2006 годы наблюдалось снижение общей ихтиомассы байкальского омуля. В 2007 году значение ихтиомассы байкальского омуля составило 21,37 тыс. тонн, что немногим больше чем в 2006 году (21,160 тыс.тонн). Биомасса промысловой части стада снизилась по сравнению с 2006 годом на 200 тонн и составила 8,9 тыс. тонн.
2. По статистическим данным, начиная с 2003 года, вылов рыбы из озера Байкал снижается. В 2007 году из озера Байкал выловлено 1,8 тыс.тонн рыбы, что на 407 тонн
меньше чем в 2006 году. В 2007 году по официальным данным добыто 900 т омуля. Фактический вылов омуля, принимая во внимание экспертную оценку неучтенного вылова, был выше статистических данных примерно на 92%. Незаконный вылов омуля продолжает расти, в 2007 году он составил 48% от всего вылова (в 2006 г. – 44%, 2005 г. – 33%, в 2004 г. – 20%).
3. Несмотря на многолетний запрет и проводимые мероприятия по искусственному воспроизводству, не наблюдается заметного увеличения запасов осетра. Основная причина – браконьерский вылов как производителей, так и разновозрастной молоди.
4. Состояние популяции нерпы, включая уровень химического загрязнения животных и вирусологическую обстановку, относительно благополучное. Необходимо продолжение мониторинга состояния популяции нерпы и проведение регулярного учета численности приплода нерпы.