Налоговый кодекс РФ не содержит разъяснений по данному вопросу.
По данному вопросу есть две точки зрения.
Официальная позиция, выраженная Минфином России, заключается в том, что расходы на выплату стипендии по ученическому договору можно учесть на основании пп. 49 п. 1 ст. 264 НК РФ при условии их соответствия критериям, установленным п. 1 ст. 252 НК РФ.
В то же время есть Письмо Минфина России, согласно которому налогоплательщик не вправе включить в расходы выплаченную по ученическому договору стипендию на основании п. 3 ст. 264 НК РФ.
Судебной практики нет.
Подробнее см. документы
Позиция 1. Расходы на выплату стипендии по ученическому договору соискателю, принятому на работу после обучения, можно учесть на основании пп. 49 п. 1 ст. 264 НК РФ
Письмо Минфина России от 08.06.2012 N 03-03-06/1/297
Разъяснено, что в случае принятия учащихся в штат организации по окончании обучения затраты на выплату им стипендии учитываются в прочих расходах, связанных с производством и реализацией, при условии их соответствия требованиям ст. 252 НК РФ.
Аналогичные выводы содержит...
Письмо Минфина России от 07.05.2008 N 03-04-06-01/123
Письмо Минфина России от 13.02.2007 N 03-03-06/1/77
КонсультантПлюс: Практический комментарий основных изменений налогового законодательства с 2009 года
Автор считает, что затраты на выплату стипендий по ученическим договорам физическим лицам, которые будут приняты в штат после окончания обучения и отработают у налогоплательщика не менее года, уменьшают налогооблагаемую прибыль как прочие расходы.
Аналогичные выводы содержит...
Обзор: Новые документы для бухгалтера. Выпуск от 06.05.2009
Обзор: Новые документы для бухгалтера. Выпуск от 09.03.2007
Авторы указывают, что расходы на обучение кандидатов изначально направлены на получение дохода и могут признаваться для целей налогообложения.
Статья: Комментарий к Письму Минфина России от 30.11.2006 N 03-03-04/2/252 "Налоговый учет затрат на подготовку и переподготовку кадров" ("Нормативные акты для бухгалтера", 2007, N 1)
По мнению автора, при надлежащем документальном подтверждении и обосновании стипендий, которые выплачены соискателям, их можно отнести к расходам на подбор персонала или иным расходам.
Позиция 2. Расходы на выплату стипендии по ученическому договору соискателю, принятому на работу после обучения, не учитываются в соответствии с п. 3 ст. 264 НК РФ
Письмо Минфина России от 17.04.2009 N 03-03-06/1/257
Финансовое ведомство разъясняет, что стипендия, выплачиваемая физическому лицу, к затратам на обучение не относится. Значит, она не учитывается в составе прочих расходов, связанных с производством и (или) реализацией, в соответствии с п. 3 ст. 264 НК РФ.