Согласно разъяснениям Минфина России до 1 апреля 2012 г. наравне с новой формой можно применять и прежнюю форму счета-фактуры (Письмо от 31.01.2012 N 03-07-15/11 (направлено для сведения и использования в работе Письмом ФНС России от 01.02.2012 N ЕД-4-3/1547@)).
Согласно п. 3 ст. 168 НК РФ счет-фактура выставляется не позднее пяти дней со дня отгрузки товаров, оказания услуг.
По данному вопросу существует две точки зрения.
Согласно официальной позиции при оказании услуг в течение длительного времени счет-фактура выставляется не позднее пяти дней со дня окончания налогового периода. Кроме того, организации, осуществляющие непрерывные долгосрочные поставки в адрес одного и того же покупателя, могут выставлять счет-фактуру один раз в течение налогового периода одновременно с платежно-расчетными документами. Имеются судебные решения и работы авторов, подтверждающие данный подход.
Вместе с тем есть работа автора, в которой отмечается, что если услуги оказываются помесячно, то покупатель не вправе применить вычет по счету-фактуре, выставленному по окончании налогового периода.
Подробнее см. документы
Позиция 1. Выставление счета-фактуры по окончании налогового периода правомерно
Письмо Минфина России от 25.06.2008 N 07-05-06/142
Разъяснено, что при оказании услуг в течение длительного периода счет-фактура выставляется не позднее пяти дней со дня окончания квартала.
Письмо Минфина России от 18.04.2005 N 03-04-11/81
Разъяснения финансового ведомства касаются тех случаев, когда налоговым периодом являлся месяц. Минфин указывает, что выставление одного счета-фактуры после окончания договора аренды банковских ячеек, заключенного на срок более чем один месяц, не противоречит действующему законодательству по НДС.
Аналогичные выводы содержит...
Постановление ФАС Московского округа от 19.09.2006, 26.09.2006 N КА-А40/8823-06 по делу N А40-85035/05-140-576
Постановление ФАС Центрального округа от 29.07.2008 по делу N А68-АП-910/18-05-7643/06-326/18 (Определением ВАС РФ от 19.12.2008 N ВАС-15473/08 отказано в передаче данного дела в Президиум ВАС РФ)
Суд признал правомерность выставления счетов-фактур по окончании поставки, которая производилась в течение налогового периода (одного месяца). Право на выставление счетов-фактур после окончания периода обусловлено спецификой договора (непрерывностью и долгосрочностью поставки электроэнергии).
Аналогичные выводы содержит...
Постановление ФАС Поволжского округа от 16.05.2006 по делу N А12-28393/05-С51
Статья: Особенности учета и налогообложения отдельных операций в издательской деятельности (Начало) ("Все о налогах", 2006, N 4)
Автор рассматривает ситуацию, когда налоговым периодом являлся квартал. По его мнению, если в адрес одного и того же покупателя в течение месяца несколько раз осуществляется отгрузка, выставление счета-фактуры покупателю по всем отгрузкам единовременно может производиться не позднее 5-го числа месяца, следующего за истекшим месяцем.
Аналогичные выводы содержит...
Статья: Счета-фактуры: практика применения ("Бухгалтерское приложение к газете "Экономика и жизнь", 2005, N 42)
Статья: Что нужно знать о счете-фактуре продавцу и покупателю ("Российский налоговый курьер", 2005, N 21)
Статья: Что ни строчка, то загадка ("Учет. Налоги. Право", 2005, N 33)
Позиция 2. При помесячном оказании услуг выставление счета-фактуры по окончании налогового периода неправомерно
Консультация эксперта, 2008
Автор указывает, что на основании счета-фактуры, выставленного за налоговый период - квартал, при условии помесячного оказания услуг организация не сможет принять НДС к вычету.