Налоговый кодекс РФ не содержит ответа на данный вопрос.
По данному вопросу существует две точки зрения.
Официальной позиции нет.
Есть примеры судебных решений, в которых признается неправомерным доначисление НДС на денежные средства, поступившие на расчетный счет, без наличия документов, подтверждающих совершение хозяйственной операции.
Есть судебные решения, согласно которым доначисление НДС на основании сведений о выручке, подтвержденных выпиской банка, признано правомерным.
Подробнее см. документы
Позиция 1. Выписка банка, отражающая поступление средств на расчетный счет налогоплательщика, не является основанием для доначисления НДС
Постановление ФАС Северо-Западного округа от 10.04.2012 по делу N А56-15329/2011
Суд указал, что движение денежных средств по расчетному счету не является доказательством занижения обществом налоговой базы и основанием для доначисления НДС. Инспекция не представила доказательств неполного отражения налогоплательщиком счетов-фактур в книге продаж и неучета реализации в налоговых декларациях.
Постановление ФАС Восточно-Сибирского округа от 06.03.2012 по делу N А78-4488/2011
Суд признал неправомерным доначисление предпринимателю НДС на основании выписки банка о поступлении на счет денежных средств, поскольку инспекция не представила первичных документов, подтверждающих наличие объекта налогообложения по НДС.
Аналогичные выводы содержит...
Постановление ФАС Поволжского округа от 20.10.2009 по делу N А57-16477/2008
Постановление ФАС Западно-Сибирского округа от 08.04.2009 N Ф04-2126/2009(4288-А45-34) по делу N А45-14864/2008-59/315
Суд сделал следующий вывод: выписка банка, в которой отражено движение денежных средств по расчетному счету налогоплательщика, не может служить доказательством того, что эти деньги являются выручкой от реализации. То есть доначисление НДС в данном случае неправомерно.
Аналогичные выводы содержит...
Постановление ФАС Волго-Вятского округа от 21.05.2007 по делу N А17-1874/5-2357/5-2006
Постановление ФАС Восточно-Сибирского округа от 07.07.2008 N А19-18035/07-Ф02-3030/08 по делу N А19-18035/07
Постановление ФАС Дальневосточного округа от 31.01.2008 N Ф03-А80/07-2/3935 по делу N А80-314/2006, А80-339/2006, А80-19/2007
Постановление ФАС Дальневосточного округа от 23.01.2008 N Ф03-А24/07-2/5405 по делу N А24-6085/06-15
Постановление ФАС Западно-Сибирского округа от 29.07.2009 N Ф04-4563/2009(11936-А03-42) по делу N А03-9164/2008
Постановление ФАС Западно-Сибирского округа от 29.04.2009 N Ф04-2493/2009(5379-А45-42) по делу N А45-8653/2008
Постановление ФАС Западно-Сибирского округа от 07.04.2009 N Ф04-888/2009(5125-А45-46) по делу N А45-7119/2008
Постановление ФАС Западно-Сибирского округа от 22.09.2008 N Ф04-5531/2008(11345-А03-42) по делу N А03-10556/2007-31 (Определением ВАС РФ от 14.01.2008 N ВАС-16998/08 отказано в передаче данного дела в Президиум ВАС РФ)
Постановление ФАС Московского округа от 25.02.2010 N КА-А40/856-10 по делу N А40-51444/09-117-340
Постановление ФАС Северо-Западного округа от 15.12.2008 по делу N А56-1979/2008
Постановление ФАС Северо-Западного округа от 14.01.2008 по делу N А05-2845/2007
Постановление ФАС Северо-Кавказского округа от 22.10.2007 N Ф08-6376/2007/1-2358А по делу N А53-5560/2006-С6-34
Постановление ФАС Уральского округа от 29.10.2008 N Ф09-7930/08-С2 по делу N А07-13791/07
Постановление ФАС Уральского округа от 21.06.2007 N Ф09-4824/07-С2 по делу N А47-9418/06
Постановление ФАС Поволжского округа от 20.12.2011 по делу N А12-5213/2011
Суд не согласился с выводами инспекции о том, что общество в нарушение ст. ст. 153, 154 НК РФ не включило в налоговую базу по НДС зачисленные на счет общества денежные средства с указанием платежа "торговая выручка". Суд указал, что налоговый орган не установил, от каких операций получены внесенные на расчетный счет денежные средства и какими документами это подтверждается. Инспекция также не представила доказательств того, что полученные обществом на расчетный счет денежные средства являлись "торговой выручкой".
Постановление ФАС Центрального округа от 23.08.2011 по делу N А35-2761/2009
Суд указал, что факт получения налогоплательщиком в кассу либо на расчетный счет денежных средств вне связи с конкретной хозяйственной операцией, признаваемой объектом налогообложения по НДС, сам по себе не может быть квалифицирован как свидетельствующий о возникновении у налогоплательщика объекта налогообложения, равно как и о размере налоговой базы по НДС.
Постановление ФАС Уральского округа от 31.08.2009 N Ф09-6309/2009-С2 по делу N А07-9566/2008 (Определением ВАС РФ от 11.01.2010 N ВАС-17272/09 отказано в передаче данного дела в Президиум ВАС РФ)
Суд указал, что инспекция не имела права формировать налоговую базу по НДС на основании выписок банков о движении денежных средств общества по банковским счетам и информации, полученной в ходе встречных проверок контрагентов налогоплательщика.
Постановление ФАС Уральского округа от 02.12.2008 N Ф09-9079/08-С2 по делу N А50-6549/08
Суд признал неправомерным начисление НДС на сумму денежных средств, поступивших на расчетный счет налогоплательщика, установив, что указанные средства переданы налогоплательщику в рамках договора поручения для приобретения товара.
Позиция 2. Выписка банка, отражающая поступление денежных средств на расчетный счет, является основанием для доначисления НДС
Постановление ФАС Северо-Западного округа от 01.12.2008 по делу N А56-43925/2007
Суд пришел к следующему выводу: поскольку предприниматель не представил в инспекцию первичные документы, налоговый орган правомерно доначислил НДС на основании сведений о выручке, подтвержденных выписками банка.
Постановление ФАС Уральского округа от 02.09.2009 N Ф09-6426/09-С2 по делу N А71-12904/2008А24
Суд указал, что инспекция вправе использовать во время проверки имеющиеся сведения о налогоплательщике, в том числе о движении денежных средств по расчетному счету.
