В Налоговом кодексе РФ не предусмотрено специального механизма для корректировки налоговой базы по НДС, если налогоплательщик при ввозе на территорию РФ уплатил НДС, принял его к вычету, однако впоследствии суд признал уплату налога на таможне незаконной.
По данному вопросу есть три точки зрения.
Согласно официальной позиции налогоплательщик должен подать уточненную декларацию за период, в котором НДС, уплаченный на таможне, был принят к вычету. Есть работа автора с аналогичным подходом.
В соответствии со второй позицией, представленной в судебном акте и работе автора, налогоплательщик восстанавливает принятый к вычету "ввозной" НДС в том налоговом периоде, в котором его уплата на таможне признана судом неправомерной (в периоде вступления в силу судебного решения).
В то же время есть работа автора, в которой содержится следующая точка зрения: налогоплательщик должен восстановить НДС в периоде, в котором сумма налога, признанного по решению суда неправомерно взысканным, возвращена налогоплательщику.
Подробнее см. документы
Позиция 1. Налогоплательщик должен подать уточненную декларацию за период, в котором применен вычет "ввозного" НДС
Письмо Минфина России от 14.11.2011 N 03-07-08/318
Разъясняется, что если по решению суда взыскание НДС при ввозе на территорию РФ признано неправомерным и данная сумма подлежит возврату налогоплательщику таможенным органом, то налогоплательщик, принявший НДС к вычету, должен представить в инспекцию уточненную декларацию за тот период, в котором производились указанные налоговые вычеты.
Аналогичные выводы содержит...
Письмо Минфина России от 03.11.2009 N 03-07-08/224
Консультация эксперта, 2009
Позиция 2. Налогоплательщик должен восстановить НДС в периоде, когда уплата налога была признана неправомерной (в периоде вступления в силу судебного решения)
Постановление ФАС Московского округа от 21.10.2011 по делу N А40-151153/10-140-889
ФАС установил, что общество при ввозе на территорию РФ судового оборудования по требованию таможенного органа уплатило НДС. Впоследствии суд признал незаконным решение органа таможенного контроля, а налог - излишне уплаченным. В связи с этим таможенные органы возвратили сумму НДС обществу. Организация восстановила в бюджет НДС, принятый к вычету в предыдущих периодах, отразив его в декларации за период, в котором вступило в силу судебное решение.
Суд признал правомерными восстановление НДС по решению суда. По мнению ФАС, в данном случае нет оснований для внесения изменений в налоговую декларацию за прошедшие налоговые периоды в соответствии с п. 1 ст. 81 и п. 1 ст. 54 НК РФ.
Статья: Обзор новостей от 30.03.2010 ("Автономные организации: бухгалтерский учет и налогообложение", 2010, N 4)
Автор указывает, что налогоплательщик должен восстановить ранее принятый к вычету НДС в том налоговом периоде, когда вступает в силу решение суда, поскольку налоговый вычет в свое время был применен в соответствии с требованиями Налогового кодекса РФ.
Позиция 3. Налогоплательщик должен восстановить НДС, признанный по решению суда неправомерно взысканным, в периоде возврата налога
Обзор: Новые документы для бухгалтера. Выпуск от 31.03.2010
Автор указывает, что ранее принятый к вычету НДС, уплаченный при ввозе на территорию РФ, налогоплательщик должен восстановить в том периоде, в котором ему вернули сумму налога, признанного по решению суда неправомерно взысканным.
