1999-2000 .
1
. , . . , . , , , . ; in vivo in vitro. - .
2
L- . . . . . - -.
3
: , . ( , , , ).
4
. . . . . . . ; .
5
()
. . . . .
6
()
. . . . . . .
7
. : 27, 310, a, p, poly(Pro) II. b-. b-. .
8
()
. . ( -). . . ( "--") - . - . .
9
()
a-. - -. -. a- . b- . b- a-. ""?
10
. . , , , . , . . .
|
|
11
, ; a-, b- , . a- b-.
12
, . , , . . .
13
. ; . b-: b-, . b- b-. b-. b-.
14
a-. . a-. a-. a/b-: b-, a-, a/b-. b-a-b . a+b . .
15
. "" . , : a- b-; ; ; b-a-b . . "" . , , : , ?
16
()
. . - "--". . ? . "--" "" . "--"? . , . . : .
17
()
in vivo. ? in vitro. " ". () . . - . . . .
|
|
18
" ": . , . (, ).
19
()
. "" . . "" .
.
20
()
. - . . . "" . - . . . . . : . . "-". " " . . : , . . .
( )
[1] . , . 1,8-12. : , 1980.
(Fersht A. Enzyme structure and mechanism, 2nd ed. NY: W.H.Freeman & Co., 1985.)
[2] .. . : , 1981; .4,6.
[3] .., .. . : , 1982.
(Schulz G.E., Schirmer R.H. Principles of protein structure. New York - Heidelberg - Berlin: Springer-Verlag, 1979).
[4] ., . , . 1, . 2,5; .3, . 17,20,21. : , 1982.
(Cantor C.R., Schimmel P.R. Biophysical chemistry, part 1, ch. 2,5; part 3, ch. 17,20,21. San Francisco, W.H.Freeman & Co, 1980).
[5] Branden C., Tooze J. Introduction to Protein Structure. New York, London: Garland Publ., Inc., 1991.
[6] Creighton T.E. Proteins, 2-nd ed. NY: W.H.Freeman & Co., 1991.
[7] Perutz M.F. Protein structure. NY: W.H.Freeman & Co., 1992.
[8] Leninger A.L., Nelson D.L., Cox M.X. Principles of biochemistry, 2nd ed., chapters 5-8. NY: Worth Publ. Inc., 1993.
[9] Stryer L. Biochemistry, 4th ed., part II. NY: W.H.Freeman & Co., 1995.
[10] . . ., , 1974.
(Poling L. General chemistry. NY: W.H.Freeman & Co., 1970).
[11] .. . . ., , 1996.
:
[12] .., .. . . , - , 1999.
[13] .. . .1. ., "", 1999.
, .
( : Bernstein F.C., Koetzle T.F., Meyer E.F., Jr, Brice M.D., Kennard O., Shimanouchi T., Tasumi T., J. Mol. Biol. 1977, 112:535542) MOLSCRIPT (Kraulis P.J., J. Appl. Cryst. 24: 946-950, 1991).
, ,
.. ,
20- ,
"-" 48-.
, .. , .
, , , (, , ). " 2 3 - "; , .
|
|
, , , , , , "" - , .
, , , .
, , .
( ). "" . , ( !) ; ; ; , ..
, , . , , " " , , ...
( 1999 2000) .
* * *
.., : .
.., .., .., .., .., .. .. , .., .., .., .., .., .., .. .. .
.., .. .. , , last but not least "" , , .
1
, , . . , - , ( ) , ( ). "" , "" () . , , , , ; . ( ) . , , , , . , "" , , .
, (: ) . "" . ( ) . .
. , , .
|
|
; . . 50- , ("" , ). (" "), R1, R2,..., RM
. . . , , , , , .. , "" .
"" . 50- . ( !) 60- -, : .
, , , , ( ) .
"" , . , , , ( ), .
, " " .
1) ; .
2) "" , , . , .
3) , ( ); , , ( " ") , .
, , .
, . "" "" ( , , ), .
( , SwissProt) ( ). , , . . : , ( ) . , " ", " " .. , , , . , .
|
|
, , , . " " (.1-1) "", .
.1-1. : ( ), (a- b-), , , ( - ) .
, , ( ). "" , .
a- b-; a- (. .1-1) , b- (, ) (. .1-1). , (, , "") , .
(.1-1). "" (.1-1). ( .1-1 cro ): b a ( a- b- !). , ( cro , ).
, . , "" (.1-2).
.1-2. , .
in vivo . , , : 40 , "" - in vitro; .
, ( !) .. .
. , , . -, ( , ) in vivo , , -! in vitro , , .
, , - .. . , ( , ) .
- . , , "" . (: ), , , , , , .., .. "" ( ). .
S-S : "" S-S ( in vitro) , in vivo , . , ( , ); S-S , .
, , , .. . , , . , . , , . , .
.
. .1-1, , , , "". ! , (. .1-3). , , , "" (. .1-3 , , .1-1, 1-2, "", ). (.1-3) , , , . - , "", .
.1-3. () ().
. - (.1-4), .. , , . , .
.1-4. , a- : c', . , : ( ) ( ), ( ), ( ).
. (" ", ) (, ), "" - , , , . : , " ", ( ..).
. , ( ), , (.1-2), (.1-1) : , , , ( !) .
( ) . , , . , "" , () , () ( ), ( ) , (.1-4).
, .. ? , , , " " (, , , , , ; , ..). . , ( ) (.1-5) [ -: () "", .. , , , -].
.1-5. , ( ): . , : Ser195 (), His57 () Asp102 () , Ser221 (), His64 () Asp32 () .
" " , : .
, , , .