Указом Президента в январе 1992 г. на базе Гостехкомиссии СССР был создан государственный орган более высокого статуса - Государственная техническая комиссия при Президенте Российской Федерации (Гостехкомиссия России). Гостехкомиссия России, являясь органом государственного управления, осуществляет ныне проведение единой технической политики и координацию работ в области защиты информации, возглавляет Государственную систему защиты информации от технических разведок, несет ответственность за обеспечение защиты информации от иностранных технических разведок и от ее утечки по техническим каналам на территории Российской Федерации, осуществление контроля эффективности принимаемых мер защиты. Непосредственное подчинение Президенту Российской Федерации обеспечивает независимость Гостехкомиссии России от региональных, ведомственных и корпоративных влияний, гарантирует соответствие ее деятельности высшим государственным интересам. Гостехкомиссия России коллегиальный орган. В ее состав входят министры, председатели государственных комитетов, первые заместители (заместители) этих руководителей - всего 23 человека. Принятые решения не являются прерогативой какого-либо ведомства, в них учитываются прежде всего интересы государства, общества и личности. Этим полностью исключается монополия в принятии решений по важнейшим вопросам обеспечения национальной безопасности. Решения Гостехкомиссии России являются обязательными для исполнения всеми органами государственного управления, предприятиями, организациями и учреждениями независимо от их организационно-правовой формы и формы собственности, которые по роду своей деятельности обладают информацией, составляющей государственную или служебную тайну.
Создание Гостехкомиссии России означало выход на новый качественный уровень развития не только самой Комиссии, но и всей Государственной системы защиты информации в Российской Федерации, сопровождаемый глубоким принципиальным реформированием государственных механизмов защиты информации в области обороны, политики, экономики, науки, экологии, ресурсов. Это, естественно, потребовало коренной реорганизации всей структуры Гостехкомиссии России, ее рабочего органа - центрального аппарата и проведения соответствующих организационно-распорядительных мероприятий в министерствах и ведомствах. В нынешних условиях Гостехкомиссия России целенаправленно отказалась от жесткого руководства, сосредоточии основные усилия на разработке и совершенствовании общей идеологии в сфере защиты информации, оказании помощи – технической, методической и консультативной, всем заинтересованным в этом, а также выполнении контрольных функций. При этом Гостехкомиссия России активно взаимодействует в настоящее со всеми органами федеральной и региональной государственной власти.
В новой обстановке значительно расширился круг решаемых Гостехкомиссией России задач. Деятельность в области защиты информации все более приобретает новый характер, соответствующий демократическим основам открытого общества. Большие изменения происходят и в методологии защиты информации. Осуществляется переход от дорогостоящего скрытия заведомо завышенного объема данных к гарантированной защите принципиально важных, «узловых точек». Закладываются правовые основы такой деятельности. Приняты Закон Российской Федерации «О государственной тайне» и Федеральный закон «Об информации, информатизации и защите информации». Этими правовыми актами сферу защиты информации распространен такой основополагающий принцип, как баланс интересов государства, общества и личности.
Произошло структурное совершенствование существующей системы органов защиты государственной тайны. Ее основным элементом стала Межведомственная комиссия по защите государственной тайны, предназначенная для координации всей деятельности органов государственной власти, предприятий, учреждений организаций в этой области. Указом Президента Российской Федерации организационно-техническое обеспечение ее деятельности возложено на центральный аппарат Гостехкомиссии России, имеющий богатый опыт по подготовке межведомственных решений. Одними из главных результатов этой деятельности явились подготовка и утверждение Президентом Российской Федерации Перечня сведений, отнесенных к государственной тайне, и государственной программы по обеспечению защиты государственной тайны на 1996-1997 гг. Опубликование в открытой печати Перечня сведений, отнесенных к государственной тайне, открыло новый этап в обеспечении защиты информации, составляющей государственную тайну, явилось реальным результатом демократизации России в части открытости и гласности.
Возглавляя государственную систему защиты информации, Гостехкомиссия России постоянно осуществляет анализ ее деятельности, совершенствует ее структуру и методы ведения работ. В Российской Федерации в соответствии с законодательными и нормативными правовыми документами Гостехкомиссией России в пределах ее компетенции созданы и успешно действуют системы лицензирования деятельности предприятий, организаций и учреждений по осуществлению мероприятий и (или) оказанию услуг в области защиты информации и сертификации средств защиты информации. В настоящее время в Российской Федерации создано 7 региональных и 20 отраслевых лицензионных центров, обеспечивающих проведение лицензионной деятельности в области защиты информации. Проведены сертификационные испытания и выданы 43 сертификата на средства защиты информации по требованиям безопасности информации. Созданы и действуют в системе сертификации средств защиты информации по требованиям безопасности информации 3 органа и 17 испытательных лабораторий. Предприятиям и организациям выдано 269 лицензий на право проведения работ в области защиты информации.