12 декабря 1993 г. были проведены новые выборы в Государственную думу и одновременно референдум по новой Конституции. Она установила принцип разделения властей на законодательную, исполнительную и судебную, каждая из которых является самостоятельной. Главой государства является Президент, который избирается на 4 года и определяет основные направления внутренней и внешней политики. Президент РФ является гарантом Конституции и выступает в качестве арбитра, посредника между различными ветвями власти и государственными институтами. По сути, он должен осуществлять посредничество между самим государством и обществом. Таким образом, Конституция 1993 г. означала превращение России в «сверхпрезидентскую» республику. Парламент утратил многие свои полномочия. Президент России может принимать указы, имеющие силу нормативного акта. Российский Президент является Верховным главнокомандующим, ему непосредственно подчиняются все «силовые» министры и министр иностранных дел, а также Совет Безопасности.
В условиях концентрации основных властных полномочий в руках президента возросла роль его администрации. Опорой режима личной власти и проводником политики президента стал государственный аппарат и верхушка чиновничества. 22 декабря 1993 г. Ельцин подписал указ, которым федеральные чиновники были выделены в особую категорию со своим уставом и льготной системой финансового, медицинского, бытового и иного обеспечения. Всего за 1990-е гг. численность чиновников в России выросла, по сравнению с 1991 г. в 3 раза. Это означало крах либеральных надежд конца 1980-х гг. на глубокое реформирование бюрократической системы.
С конца 1993 года в России с небольшими перерывами проходили крупные политические кампании – выборы в Государственную Думу, выборы Президента РФ, а также выборы губернаторов и президентов во всех субъектах Федерации. Эти выборы показывали расстановку политических сил. В ходе этих кампаний многие политики, целые партии и движения сходили со сцены, а на политической карте страны появлялись новые фигуры. В декабре 1993 г. на выборах в новый парламент страны – Государственную думу неожиданный успех одержала ЛДПР (лидер- В.Жириновский), получив 24% голосов. Коммунисты и аграрии набрали в сумме 22% голосов избирателей. Другие оппозиционно настроенные партии (в том числе «Яблоко» Г.Явлинского) получили все вместе 28%. Проправительственный «Демократический выбор России» набрал лишь 15,4%. Большинство в Госдуме стало принадлежать оппозиции. Ее председателем был избран представитель аграриев И.П. Рыбкин.
Важнейшим фактором внутренней политики России стала Чечня. Летом 1991 г. группировка генерала Д.Дудаева, опираясь на самодеятельные вооруженные отряды, разогнала Верховный Совет Чечено-Ингушетии и объявила о создании независимой Чеченской республики Ичкерия. Это произошло при попустительстве союзной власти и российских руководителей. После распада СССР дудаевцы получили оружие, которое оставили после себя воинские части, спешно покинувшие республику. Сепаратисты готовились занять лидирующие позиции на Северном Кавказе. Фактически с конца 1991 г. в Чечне началась война внутри самих чеченцев (между тейпами – группами родственников) за сферы влияния. Участились факты насилия по отношению к мирному населению республики и российским военным. С января по июнь 1992 г. республику покинули около 40 тыс. человек. Криминальные финансовые структуры «отмывали» через Чечню огромные деньги.
После неудачного осеннего наступления пророссийской чеченской оппозиции на Грозный на территорию республики 11 декабря 1994 г. были введены федеральные армейские части. С помощью военной операции российское руководство пыталось предотвратить выход Чеченской республики из состава России, вернуть контроль над стратегическими нефтепроводами и железными дорогами, проходящими через республику. Однако «блицкриг» не удался. Чеченский конфликт превратился в полномасштабную войну с многочисленными жертвами среди мирных жителей и военных.
Неудачные военные действия на Северном Кавказе, экономическая политика правительства, усилившееся расслоение общества вызвали рост оппозиции в стране, что показали результаты выборов в Госдуму в 1995 г. Всего в кампании участвовало 43 партии и избирательных объединений, но 5% порог перешагнули только четыре партии: КПРФ (22% голосов), ЛДПР (10,9%), правительственный блок «Наш Дом – Россия» (10%) и «Яблоко» (7,1%). ДВР Е.Гайдара в Думу не прошел. По одномандатным округам КПРФ и ее союзники завоевали более половины мест. Спикером Госдумы стал коммунист Г.Селезнев.
Большое влияние на социально-экономическую и политическую ситуацию в России оказали президентские выборы 1996 г. Многим казалось, что с таким багажом проблем, неудач и невыполненных обещаний Ельцин не сможет победить. Популярность Ельцина у избирателей снизилась до 6%, и победа его соперника, лидера КПРФ Зюганова казалась весьма вероятной. Чтобы обеспечить победу Ельцину, руководство России предприняло беспрецедентную атаку СМИ на избирателя под лозунгом «Голосуй или проиграешь!». В полную силу был использован административный ресурс и разыграна антикоммунистическая карта. Правительство заявило о разработке новой программы преобразований, нацеленных на человека. Ельцин вывел из состава правительства самые непопулярные фигуры – министра иностранных дел Козырева и вице-премьера Чубайса, ответственного за провал приватизации. Специально под выборы был выделен кредит МВФ на 10 млрд. долларов, а также 3 млрд. долларов в виде займов западных правительств. Благодаря иностранным займам началось частичное погашение долгов бюджетникам. Правительство заявило о сближении с Белоруссией. Были предприняты энергичные шаги по решению чеченской проблемы – от разработки плана мирного урегулирования до физического устранения Дудаева и прекращения военных операций. Сам Ельцин, еще недавно казавшийся больным и вялым, обнаружил энергию, активность. Он посетил 24 города и региона – больше, чем за все годы своего президентства. Первый тур выборов не выявил победителя: Ельцин набрал 35,28% голосов, Зюганов – 32,04%, Лебедь – 14,52%, Явлинский – 7,42%, Жириновский – 5,7%. Чтобы победить, в промежутке между первым и вторым турами выборов Ельцин заключил политический союз с генералом Лебедем, назначив его секретарем Совета Безопасности и помощником Президента по национальной безопасности. Из правительства был уволен министр обороны П.Грачев (на него возлагалась основная вина за бездарное ведение войны в Чечне), начальник ФСБ М.Барсуков и любимец Ельцина – начальник его охраны А.Коржаков. В эти дни у Ельцина произошел тяжелый сердечный приступ. Это было скрыто от всего мира. 3 июля 1996 г. состоялся второй тур президентских выборов. По официальным данным за Ельцина проголосовало 53,8%, за Зюганова – 40,3%. Немало людей, отдавших голоса Ельцину, не были его сторонниками, но они не хотели возвращения коммунистов к власти. Таким образом, избиратели голосовали за меньшее из двух зол. Президентские выборы 1996 г. закрепили политические итоги революции 1989-1993 гг.
После выборов вновь обострилось положение в Чечне. Отряды боевиков взяли Грозный. В конце августа 1996 г. в Хасавюрте состоялись переговоры генерала Лебедя и начальника штаба дудаевских войск Масхадова. Были подписаны документы, согласно которым войска уходили с территории Чечни. Решение вопроса о статусе Чечни откладывалось до 2001 г. Хасавюртовские соглашения вызвали неоднозначную оценку. Чеченцы трактовали их как победу в войне. Генерал Лебедь и правозащитные организации усматривали успех в том, что удалось остановить кровопролитие и перевести урегулирование конфликта в политическое русло. Однако российские военные были недовольны тем, что политики не дали войскам возможности «добить противника». На деле, как отметил в начале 2004 г. президент В.В.Путин, «были брошены на произвол судьбы и сама Чечня, и весь чеченский народ».
После выборов возросло политическое влияние сил, выступавших в поддержку Ельцина. Примерно в это же время в политический лексикон вошло и утвердилось слово «олигарх», которое стали использовать при характеристике взаимоотношений власти и бизнеса в России.
В 1996-1999 гг. существенным фактором российской политики стало состояние здоровья Президента. Осенью 1996 г. Ельцин перенес тяжелую операцию на сердце. В последующие годы он много раз находился на больничной койке, лишь на время появлялся в Кремле. В то время как Ельцин фактически отошел от дел, возник такой специфический российский институт поддержки президентской власти, который получил название «семья». Ее образовал узкий круг лиц, в который входили некоторые члены семьи Ельцина и люди, предельно ему близкие. «Семья» брала на себя функции «теневого кабинета», занимаясь подбором кадров и выработкой политического курса.
В конце 1990-х гг. политический процесс характеризуется «кадровой чехардой». С марта 1998 г., после отставки В.С.Черномырдина с поста премьер-министра и до конца 1999 г. во главе правительства побывали С.В.Кириенко, Е.М.Примаков, С.В.Степашин и В.В.Путин. Финансовый кризис 1998 г. привел не только к падению правительства Кириенко. Парламент продемонстрировал готовность решительно противостоять президенту при формировании нового кабинета. Ельцин был вынужден уступить и впервые назначил главой правительства кандидата, предложенного Думой: академика и главу Службы внешней разведки Е.М.Примакова. Время премьерства Примакова характеризуется как период «двойного лидерства». Первым был дряхлеющий, утративший былую популярность президент (в 1999 г. негативно Ельцина оценивало 82-85% населения). Другим был председатель правительства, который пользовался авторитетом в обществе (в мае 1999 г. его рейтинг составлял 65%) и сумел добиться некоторых позитивных перемен в экономике.
С весны 1999 г. Ельцин искал преемника. Примаков был немолод, нелоялен, дружил с коммунистами. Попытка Госдумы провести импичмент президента дала повод Ельцину для досрочной отставки правительства Примакова. Та же участь ожидала и следующего премьера С.В.Степашина – молодого, лояльного, но не слишком решительного. Имя преемника Ельцин назвал 9 августа 1999 г. после подписания указа о назначении В.Путина и.о. премьер-министра. Его назначение совпало с обострением ситуации на Северном Кавказе. Чечня три года де-факто была независимой. Сепаратистский режим не в состоянии был наладить мирную жизнь в республике. Там процветала работорговля. Летом 1999 года многочисленные банды международных террористов во главе с Ш.Басаевым и Хаттабом совершили нападение на Дагестан с целью вовлечения этой республики в зону криминального влияния и отторжения от России. Это был серьезный вызов целостности Российской Федерации. В сентябре чеченские террористы произвели взрывы домов в Москве, Буйнакске и Волгодонске. Погибло около 300 мирных жителей. В этой ситуации новый премьер-министр проявил себя энергичным, решительным руководителем. Федеральные силы разгромили вторгшихся в Дагестан боевиков и в начале октября 1999 г. вошли в Чечню. В феврале 2000 г. федеральные войска взяли Грозный. Успехи во второй чеченской кампании резко увеличили популярность В.Путина. Общество увидело в нем политика, способного объединить различные политические силы для решения государственных задач. Он нашел правильные слова и заговорил с народом на том патриотическом языке, которого народ давно ждал.
18 декабря 1999 г. прошли выборы в третью Государственную Думу. В результате в парламенте сложилась принципиально новая расстановка сил. Вновь на первом месте были коммунисты (24,3% голосов избирателей). Значительного успеха (23,6%) добилось избирательное объединение «Единство», созданное в октябре 1999 г. «в поддержку Путина». В Думу также вошли «Отечество – Вся Россия», Союз правых сил, «Яблоко», ЛДПР. Из числа депутатов, избиравшихся по одномандатным округам, были образованы фракции «Народный депутат», «Регионы России», Агропромышленная депутатская группа. Председателем Думы вновь стал Г.Селезнев. Впервые за годы реформ россияне избрали парламент, лояльный правительству. 31 декабря 1999 г., неожиданно для всего российского общества, Б.Н. Ельцин в прямом эфире заявил о досрочном сложении президентских полномочий. И впервые в многовековой истории России глава государства оставил свой пост не в результате смерти или переворота, а руководствуясь высшим законом страны. Согласно Конституции, обязанности президента наряду с функциями председателя правительства стал выполнять В.В. Путин. 26 марта 2000 г. он в первом туре одержал победу на досрочных президентских выборах. Пост главы правительства занял М.М. Касьянов. С уходом Б.Н. Ельцина закончился первый этап сложных преобразований советской социально-экономической и политической системы.