Классификация аминокислот

Аминокисло́ты (аминокарбо́новые кисло́ты) — органические соединения, в молекуле которых одновременно содержатся карбоксильные и аминные группы.

 

По радикалу

· Неполярные: аланин, валин, изолейцин, лейцин, пролин, метионин, фенилаланин, триптофан,

· Полярные незаряженные (заряды скомпенсированы) при pH=7:, серин, треонин, цистеин, аспарагин, глутамин, тирозин

· Полярные заряженные отрицательно при pH=7: аспартат, глутамат

· Полярные заряженные положительно при pH=7: лизин, аргинин, гистидин

 

По функциональным группам

· Алифатические

o Моноаминомонокарбоновые: глицин, аланин, валин, изолейцин, лейцин

o Оксимоноаминокарбоновые: серин, треонин

o Моноаминодикарбоновые: аспартат, глутамат, за счёт второй карбоксильной группы несут в растворе отрицательный заряд

o Амиды моноаминодикарбоновых: аспарагин, глутамин

o Диаминомонокарбоновые: лизин, аргинин, несут в растворе положительный заряд

o Серосодержащие: цистеин, метионин

· Ароматические: фенилаланин, тирозин, триптофан, (гистидин)

· Гетероциклические: триптофан, гистидин, пролин

· Иминокислоты: пролин

 

По классам аминоацил-тРНК-синтетаз

· Класс I: валин, изолейцин, лейцин, цистеин, метионин, глутамат, глутамин, аргинин, тирозин, триптофан

· Класс II: глицин, аланин, пролин, серин, треонин, аспартат, аспарагин, гистидин, фенилаланин

Для аминокислоты лизин существуют аминоацил-тРНК-синтетазы обоих классов.

 

По путям биосинтеза

Пути биосинтеза протеиногенных аминокислот разноплановы. Одна и та же аминокислота может образовываться разными путями. К тому же совершенно различные пути могут иметь очень похожие этапы. Тем не менее, имеют место и оправданы попытки классифицировать аминокислоты по путям их биосинтеза. Существует представление о следующих биосинтетических семействах аминокислот: аспартата, глутамата, серина, пирувата и пентоз. Не всегда конкретную аминокислоту можно однозначно отнести к определённому семейству; делаются поправки для конкретных организмов и учитывая преобладающий путь. По семействам аминокислоты обычно распределяют следующим образом:

· Семейство аспартата: аспартат, аспарагин, треонин, изолейцин, метионин, лизин.

· Семейство глутамата: глутамат, глутамин, аргинин, пролин.

· Семейство пирувата: аланин, валин, лейцин.

· Семейство серина: серин, цистеин, глицин.

· Семейство пентоз: гистидин, фенилаланин, тирозин, триптофан.

Фенилаланин, тирозин, триптофан иногда выделяют в семейство шикимата.