Отделение нанотехнологий и информационных технологий было образовано 3 марта 1983 года (под названием Отделение информатики, вычислительной техники и автоматизации) на базе четырех институтов АН СССР: Института прикладной математики им. М.В. Келдыша, Вычислительного центра, Института проблем передачи информации и Ленинградского института информатики и автоматизации.
В 1985 году в состав Отделения входило уже 8 институтов. Были образованы Институт проблем информатики, Институт проблем кибернетики, Институт проблем технологии микроэлектроники и особочистых материалов и Институт микроэлектроники в г. Ярославле.
Отделение образовано как реакция на ставшее очевидным:1) влияние компьютеризации и информатизации на развитие экономических и социальных процессов в мире, 2) бурный рост компьютерной индустрии в развитых странах мира,3) огромный интерес крупнейших научных центров к проблемам вычислительной техники, информатики и информационных технологий, автоматизации.
В настоящее время в составе Отделения, которое с декабря 2007 г. носит название Отделение нанотехнологий и информационных технологий РАН, 39 действительных члена и 63 члена-корреспондента РАН. Из них 68 членов Отделения работают в институтах Академии наук, 32 - в госкорпорациях, федеральных государственных унитарных предприятиях, университетах и других высших учебных заведениях
Программы фундаментальных исследований Президиума РАН
Проблемы создания информационно-вычислительной среды на основе GRID-технологий, облачных вычислений и современных телекоммуникационных систем (координатор - академик Е.П. Велихов).
Информационные, управляющие и интеллектуальные технологии и системы(координатор - академик С.В. Емельянов).
Фундаментальные проблемы системного программирования (координатор - академик И.А. Соколов).
Алгоритмы и математическое обеспечение для вычислительных систем сверхвысокой производительности (координатор - академик В.Б. Бетелин).
Фундаментальные основы технологий наноструктур и наноматериалов (координатор - академик Ж.И. Алферов).
Интеллектуальные информационные технологии, системный анализ и автоматизация (координатор - чл.-к. РАН Ю.С. Попков).
Научные основы создания гетерогенных телекоммуникационных и локационных систем и их элементной базы (координатор - академик Ю.В. Гуляев).
Элементная база микроэлектроники, наноэлектроники и квантовых компьютеров, материалы для микро- и наноэлектроники, микросистемная техника (координатор - академик А.А. Орликовский).
Архитектурно-программные решения и обеспечение безопасности суперкомпьютерных информационно-вычислительных комплексов новых поколений (координатор - академик А.Л. Стемпковский).
Фундаментальные проблемы физики и технологии эпитаксиальных наноструктур и приборов на их основе (координатор - чл.-к. РАН А.Е. Жуков).
