Основание обители
1605 – Древняя история Усть-Киргизского (Богородского) мужского монастыря началась с его основания в 9 верстах от Томска на р. Большая Киргизка.
1653 – году монастырем управлял игумен Ефрем (Березовский). Именно он и задумал перевести монастырь в Томский острог из-за частых набегов кочевников и пожаров.
1923 – закрытие монастыря Советскими властями; последним настоятелем обители был архимандрит Ираклий (Попов), который, впоследствии став епископом на Урале, расстрелян в 30-х годах.
1992 – Новейшая история Богородице-Алексиевского монастыря началась с торжественного богослужения, совершённого епископом Новосибирским и Бердским Тихоном в день памяти св. первоверховных апостолов Петра и Павла в реставрируемом Казанском соборе.
1995 – обители был полностью передан вновь отреставрированный Казанский собор.
1999 – наместником монастыря был назначен игумен Силуан (Вьюров), ныне еп. Колпашевский и Стрежевской, при котором было собрано современное братство обители.
Этапы истории
1656 – случился пожар, уничтоживший новый деревянный храм обители, построенный в 1605 году. Монастырь переносится в Томск на Юрточную гору.
1662 – в монастыре был возведен первый деревянный трехпрестольный храм в честь Казанской иконы Божией Матери с приделами в честь преподобного Алексия Человека Божия и мучеников Флора и Лавра.
1681 – монастырь в числе трех старейших сибирских обителей принят под личное покровительство царя Феодора Алексеевича Романова.
1698 – в монастыре была открыта первая в Томске школа.
17 век – при монастыре организована первая в городе больница и богадельня.
1835 – Богородице-Алексиевский монастырь становится резиденцией томских архиереев, на территории монастыря был построен архиерейский дом (ныне – Трёхсвятительский корпус).
Краткое описание монастырского комплекса
1776 – закладывается первый каменный храм обители – Казанский собор.
1884 – в монастыре был построен каменный настоятельский корпус (ныне – братский корпус).
1836 – начата постройка каменной монастырской ограды.
1860 – строится колокольня каменного собора.
1904 – над склепом св. Феодора Томского возводится каменная часовня.
2005-2010 – строительство Трёхсвятительского корпуса.
Просветительская и миссионерская деятельность
Образованный среди языческих народов Сибири, монастырь с момента своего основания становится крупным миссионерским центром.
В начале 17 века на острове Крестовом (Крещеном) при слиянии рек Томи и Оби монахами-миссионерами совершались первые крещения инородцев юга Сибири.
К середине 17 столетия на монастырских угодьях в Нагорном Иштане был устроен один из первых миссионерских станов.
1698 – в монастыре была открыта первая в Томске школа, послужившая началом всей будущей образовательной системы Томска
1746 – в обители открывается первое на Юге Сибири Русское духовное училище.
1818 – трудами архимандрита Иеронима-«Гимназиарха» (Кириллова), видного просветителя, была открыта первая в Томске русско-латинская гимназия, просуществовавшая до 1919 года.
1882-1899 – при архиерейском доме действует Томская Духовная семинария.
1997-1999 – при монастыре действовал иконописный класс, который теперь существует при ТДС.
1999 – открыта общедоступная православная библиотека. На сегодня библиотека насчитывает более 11000 книг.
2007 – открыта детская воскресная школа, с 2010 года располагается в Трёхсвятительском корпусе. Со временем школа переросла в Церковно-культурный центр с множеством образовательных и миссионерских инициатив.
Исторические личности, бывавшие в монастыре
В течение многих лет с 1881 по 1912 год в монастыре совершал архиерейские богослужения известный миссионер, апостол Алтая, архиепископ Томский и Алтайский Макарий (Невский), ныне прославленный в лике святых.
В разные годы монастырь посещали такие духовные лица, как святой равноапостольный Иннокентий, митрополит Московский и Коломенский, апостол Сибири и Америки; старцы Зосима (Верховский) и Василиск (Гаврилов), основатель Богородице-Алексиевской пустыни под г. Кузнецком, являвшийся духовным отцом святого праведного Петра Томского.
С 1847 по 1854 год в монастыре жил и работал известный духовный писатель, постриженик святой Афонской горы инок Парфений (Агеев). Именно здесь, в Томске, им было написано знаменитое сочинение «Сказание о странствии и путешествии по России, Молдавии, Турции и Святой Земле».
Впрочем, некоторые исторические фигуры приезжали сюда не по своей воле. В те далекие времена монастыри нередко использовались для заточения лиц неугодных или провинившихся, исключением не стала и Богородице-Алексиевская обитель. Так, с декабря 1729 по январь 1730 г. здесь под стражей содержался крестник Императора Петра I, прадед А. С. Пушкина Абрам Петрович Ганнибал. А в конце 1740 года в близлежащем от Богородице-Алексиевского женском Христорождественском монастыре старший иеромонах Алексиевского монастыря Моисей (Булатов) совершил монашеский постриг княгини Екатерины Алексеевны Долгоруковой – бывшей невесты Императора Петра II и нареченной императрицы.
После кончины святого праведного старца Феодора необычайной особенностью монастыря, находящегося в сибирской глубинке, стали визиты августейших особ. В разное время обитель и саму могилу старца Феодора, расположенную в монастырской ограде, посещали различные представители дома Романовых. Первым был визит Великого князя Владимира Александровича в 1868 году. В 1873 году сюда приезжал Великий князь Алексей Александрович. Наследник престола Цесаревич Николай Александрович, в будущем император Николай II, приехал в Томск в 1891 году, совершая кругосветное путешествие. Он посетил обитель и поклонился могиле святого старца.
Уже в наше время, в 1993 году для поклонения мощам св. праведного Феодора приезжали потомки дома Романовых – княгиня Мария Владимировна, княгиня Леонида Георгиевна и князь Георгий Михайлович.
Часовня старца Феодора
1904 – над склепом св. Феодора Томского возводится каменная часовня по благословению архимандрита Ионы (Изосимова), руководителя томского кружка почитателей старца.
1936 – часовня св. прав. Феодора Томского была разобрана.
5 июля 1995 – состоялось обретение мощей св. прав. Феодора по инициативе прот. Леонида Хараима, благочинного томского епархиального округа.
1998 – часовня св. прав. Феодора Томского восстановлена.
