Наименование элемента программы

Л – лекции, ПЗ – практические занятия (семинары), Лаб – лабораторные практикумы, Э – экзамен, З – зачет.

* По согласованию с руководителем программы и руководителем научно-исследовательской работы магистранта в вариативную часть программы могут быть включены другие курсы.

O– образовательная подготовка, П – практика, Э – экзаменационные сессии, Д – подготовка к защите и защита квалификационной выпускной работы, К – каникулы.

Если президенты не могут делать этого со своими женами, они делают это со своими странами © Иосиф Бродский
==> читать все изречения...

1731 -

| 1672 -

1-7	8-14	15-21	22 - 28	6-12	13 - 19	20 - 26	3 - 10	11 - 17	18 - 24	2 - 8	9 - 15	16 - 22	23 - 29	14 - 20	21 - 27	4 - 10	11 - 17	18 - 25	5 - 12	13 - 19	20 - 26	3 - 9	10 - 16	17 - 23	24 - 30	2 - 8	10 - 16	18 - 24	25 - 31	1-7	8-14	15-21	22 - 28	6 - 12	13 - 19	20 - 26	3 - 9	10 - 16	17 - 23	24 - 31
1	2	3	4	5	6	7	8	9	10	11	12	13	14	15	16	17	18	19	20	21	22	23	24	25	26	27	28	29	30	31	32	33	34	35	36	37	38	39	40	41	42	43	44	45	46	47	48	49	50
I	О/П	О/П	О/П	О/П	О/П	О/П	О/П	О/П	О/П	О/П	О/П	О/П	О/П	О/П	О/П	О/П	О/П	Э	Э	Э	Э	К	О/П	О/П	О/П	О/П	О/П	О/П	О/П	О/П	О/П	О/П	О/П	О/П	О/П	О/П	О/П	Э	Э	Э	Э	К	К	К	К	К	К	К	К	К
II	О/П	О/П	О/П	О/П	О/П	О/П	О/П	О/П	О/П	О/П	О/П	О/П	О/П	О/П	О/П	О/П	О/П	Э	Э	Э	Э	К	О/П	О/П	О/П	О/П	О/П	О/П	О/П	О/П	Д	Д	Д	Д	Д	Д	Д	Д	Д	Д	К	К	К	К	К	К	К	К	К	К

Учебная дисциплина «Иностранный язык (английский)»
Цель изучения дисциплины	Основной целью изучения иностранного языка студентами факультета естественных наук является достижение практического владения языком для общих целей и начало обучения иностранного языка для специальных целей, что позволяет в будущем использовать его как в повседневной жизни, так и в научной работе и вести профессиональную деятельность в иноязычной среде. Задачи дисциплины «Иностранный язык» обусловлены определенными выше целями и формулируются следующим образом: • овладеть лексическим минимумом для специалистов естественно-научных специальностей общего и терминологического характера; • читать оригинальную литературу на иностранном языке в соответствующей отрасли знаний; • оформлять извлеченную из иностранных источников информацию в виде перевода, резюме, доклада или сообщения как в устном, так и в письменном виде.
Компетенции, формируемые в результате освоения дисциплины	ОПК-1
Знания, умения и навыки, получаемые в процессе изучения дисциплины	В результате изучения дисциплины студент должен: знать: - фонетические, лексические и грамматические явления изучаемого иностранного языка, использующиеся в сфере повседневного и профессионального общения и позволяющие использовать его как средство личностной коммуникации; - наиболее употребительную повседневную и общенаучную лексику в сфере своей специализации. уметь: - понимать оригинальный языковой материал в устных и письменных видах речевой деятельности на английском языке; - распознавать основные грамматические явления, характерные для научного стиля изложения; - использовать на практике приобретенные учебные умения; владеть: - навыками чтения научной литературы на английском языке; - навыками устной речи и восприятия на слух информации на английском языке для общих и специальных целей.
Краткая характеристика учебной дисциплины (основные блоки и темы)	Обучение различным аспектам речевой деятельности должно осуществляться в их совокупности и взаимной связи с учетом специфики каждого из них. Управление процессом усвоения обеспечивается четкой постановкой цели на каждом конкретном этапе обучения. В данном курсе определяющим фактором в достижении установленного уровня того или иного вида речевой коммуникации является требование профессиональной направленности практического владения иностранным языком.
Трудоемкость (ЗЕ/часы)	6/216
Форма итогового контроля знания	экзамен

Учебная дисциплина «Философские проблемы естествознания»
Цель изучения дисциплины	Цели курса предполагают формирование общекультурных компетенций учащихся, в частности, целостного мировоззрения на основе современной научной картины мира, компетенций социального взаимодействия, расширение общего гуманитарного кругозора, которого требует университетский уровень современного высшего образования. Изложение курса реализуется на базе историко-философского и историко-научного материала, что позволяет вскрыть закономерности формирования логики и основных принципов научного мышления, понимания специфики геологии как науки, ее места и роли в других науках и Культуре вообще.
Компетенции, формируемые в результате освоения дисциплины	ОПК-8, ОПК-5
Знания, умения и навыки, получаемые в процессе изучения дисциплины	В результате освоения дисциплины учащийся должен: - Знать: основы философии, способствующие развитию общей культуры и социализации личности, знать основные этапы формирования философии, основные философские школы, вопросы, которые рассматривает философия, характер их решения. - Уметь выявлять и анализировать мировоззренческий и методологический смысл проблем тех наук, которые изучают студенты – биологии, а также уметь ориентироваться в нравственных проблемах своей жизни, а также жизни страны, эпохи. Студент также должен уметь работать с литературой, выступать публично, понимать и излагать получаемую информацию.
Краткая характеристика учебной дисциплины (основные блоки и темы)	Содержание дисциплины составляет комплекс вопросов о богатстве и многообразии философских проблем, о языке, средствах и методах философии, об истории философии и ее современных проблемах, об особенностях научного познания, проблеме истины, ценностных проблемах науки и научных коллективов.
Трудоемкость (ЗЕ/часы)	6/216
Форма итогового контроля знания	экзамен

Учебная дисциплина «Синтетическая биология»
Цель изучения дисциплины	Обучение студентов подходам и методам синтетической биологии; развитие у студентов доказательного, логического мышления; подготовка к восприятию других дисциплин в области современной биологии и биотехнологии; подготовка студентов к участию в научно-исследовательских и опытно-конструкторских работах в области современной биологии и биотехнологии. Студенты должны воспринять подход к биологическим объектам как к потенциально программируемым системам, получить представления об основных методах, инструментах и стандартах синтетической биологии, познакомиться с примерами синтетических биологических систем и их использованием в биотехнологии.
Компетенции, формируемые в результате освоения дисциплины	ОПК-3, ПК-1
Знания, умения и навыки, получаемые в процессе изучения дисциплины	В процессе изучения дисциплины «Синтетическая биология» обучаемые приобретают следующие Знания •общих принципов дизайна синтетических биологических систем; •cтандартов синтетической биологии; •методов сборки ДНК; •синтетических систем в клетках бактерий, дрожжей, растений и животных; •основных принципов белковой инженерии; •теории и методов конструирования полусинтетических минимальных клеток; •биоортогональных подходов к дизайну биологических систем; Умения •разрабатывать стратегию сборки ДНК-конструкций; •конструировать генные контуры; •планировать характеристику синтетико-биологических систем на уровне транскрипции и трансляции; Навыки •выделения функциональных доменов и активных центров в белках; •описания синтетико-биологических систем с использованием языка SBOL.
Краткая характеристика учебной дисциплины (основные блоки и темы)	Основные блоки: I. Стандарты синтетической биологии. Методы сборки ДНК II. Стандартизация измерения экспрессии генов III. Синтетическая биология в клетках бактерий IV. Синтетическая биология в эукариотических клетках V. Синтетическая биология растений VI. Полусинтетические минимальные клетки: теория и конструирование VII. Общие принципы дизайна синтетических биологических систем VIII. Новые методы кодирования в биологических системах
Трудоемкость (ЗЕ/часы)	3/108
Форма итогового контроля знания	экзамен

Учебная дисциплина «Белковая инженерия»
Цель изучения дисциплины	Основной целью освоения дисциплины является приобретение студентами знаний по современным направлениям белковой инженерии, основанных на практическом использовании достижений биохимии, молекулярной биологии и структурной биологии.
Компетенции, формируемые в результате освоения дисциплины	ПК-7
Знания, умения и навыки, получаемые в процессе изучения дисциплины	Рассматриваются основы структурно-функциональной организации белков и взаимодействующих с ними биополимеров, современные методы и подходы к получению новых белков. Знания: · о современных направлениях биохимии белка · о перспективных и развивающихся направлениях белковой инженерии · в том числе основанных на применении комплекса методов структурной биологии.
Краткая характеристика учебной дисциплины (основные блоки и темы)	Курс «Белковая инженерия» включает современные данные о сформировавшихся и развивающихся направлениях в области разработки белков с заданными свойствами, направленных на создание ферментов с лучшими кинетическими параметрами, новой субстратной специфичностью, улучшенной стабильностью и другими свойствами, важными для практического применения в биотехнологии и медицине.
Трудоемкость (ЗЕ/часы)	3/108
Форма итогового контроля знания	экзамен

Учебная дисциплина «Методы исследования биополимеров»
Цель изучения дисциплины	Ознакомить студентов с принципами основных и наиболее широко используемых методов молекулярной биологии, а также с особенностями их применения для решения тех или иных задач молекулярной биологии. На лекциях даются основные представления о наиболее часто используемых способах детекции, идентификации и фракционирования молекул биополимеров, а также лежащих в основе таких способов физико-химических принципах; разбираются физико-химические принципы функционирования приборов и приборных комплексов, используемых в молекулярной биологии, а также инструментальные подходы к решению комплексных задач молекулярной биологии, в частности идентификации компонентов сложных биологических объектов, точное измерение сверхмалых концентраций биополимеров, определение тонкой структуры биополимеров (в частности полинуклеотидных последовательностей), входящих в состав сложных биологических объектов.
Компетенции, формируемые в результате освоения дисциплины	ПК-3
Знания, умения и навыки, получаемые в процессе изучения дисциплины	В результате освоения дисциплины обучающийся должен: • иметь представление о наиболее часто используемых способах детекции, идентификации и фракционирования молекул биополимеров, а также лежащих в основе таких способов физико-химических принципах; o физико-химические принципах функционирования приборов и приборных комплексов, используемых в молекулярной биологии; • знать основные инструментальные подходы к решению комплексных задач молекулярной биологии, основные принципы их функционирования и использования; • уметь предсказывать и объяснять результаты применения физико-химических подходов и созданных на их основе приборов и приборных комплексов для решения задач молекулярной биологии, планировать эксперименты с использованием соответствующих приборов для решения таких задач.
Краткая характеристика учебной дисциплины (основные блоки и темы)	Основные блоки: Основные типы биополимеров. Их физико-химические свойства. Нуклеиновые кислоты. Одноцепочечные (ДНК и РНК). Двуцепочечные (ДНК). Структурные характеристики B-ДНК. Денатурация ДНК. Хаотропные агенты. Белки. Электрофорез. Электрофорез в гелях. Центрифугирование. Варианты практического использования седиментации. Хроматография. Классификация и примеры хроматографических методов. Масс-спектрометрия как метод анализа молекул биополимеров. Количественные аспекты ПЦР. "Полуколичественная" ПЦР (детекция на неэкспоненциальном участке кривой накопления продукта). Метод молекулярных колоний – ПЦР в геле. Системы массового параллельного секвенирования (MPSS). Используемые в MPSS методы клональной амплификации и определения нуклеотидных последовательностей амплификатов Внедренные в практику системы MPSS (принцип работы, основные характеристики, достоинства и недостатки): Принципы функционирования перспективных разработок MPSS,основанных на определении нуклеотидных последовательностей единичных молекул ДНК:
Трудоемкость (ЗЕ/часы)	4/144
Форма итогового контроля знания	экзамен

Учебная дисциплина «Механизмы репликации, транскрипции и трансляции»
Цель изучения дисциплины	Дисциплина «Основные молекулярно-генетические процессы» предназначена для познания студентами тонких механизмов хранения, воспроизведения и реализации генетической информации. Основной целью освоения дисциплины является свободное владение материалом, описывающим процессы репликации, транскрипции,обратной транскрипции и трансляции.
Компетенции, формируемые в результате освоения дисциплины	ОПК-5, ПК-1, ПК-3
Знания, умения и навыки, получаемые в процессе изучения дисциплины	По окончании изучения спецкурса студент должен: иметь представление о сложности и разнообразии механизмов репликации, транскрипции, трансляции и обратной транскрипции; знать основные свойства генетического кода, структуру рибосом, основные ферменты, осуществляющие процессы воспроизведения и реализации генетической информации; уметь схематически изобразить основные стадии репликации, транскрипции, трансляции у про- и эукариот, этапы обратной транскрипции, циклы размножения фагов и ретровирусов.
Краткая характеристика учебной дисциплины (основные блоки и темы)	Для достижения поставленной цели выделяются следующие задачи: ретроспективный обзор изучения процесса репликации ДНК у про- и эукариот с детализацией использованных методов; изучение этапов обратной транскрипции и современных моделей канцерогенеза; характеристика бактериальных и эукариотических РНК-полимераз, белковых факторов транскрипции, этапов транскрипции и процессинга РНК у про- и эукариот; изложение основных свойств генетического кода, структуры рибосом и этапов трансляции у про- и эукариот.
Трудоемкость (ЗЕ/часы)	2/72
Форма итогового контроля знания	экзамен

Учебная дисциплина «Молекулярная вирусология»
Цель изучения дисциплины	Ознакомить студентов с принципами основных и наиболее широко используемых методов молекулярной биологии, а также с особенностями их применения для решения тех или иных задач молекулярной биологии. На лекциях даются основные представления о наиболее часто используемых способах детекции, идентификации и фракционирования молекул биополимеров, а также лежащих в основе таких способов физико-химических принципах; разбираются физико-химические принципы функционирования приборов и приборных комплексов, используемых в молекулярной биологии, а также инструментальные подходы к решению комплексных задач молекулярной биологии, в частности идентификации компонентов сложных биологических объектов, точное измерение сверхмалых концентраций биополимеров, определение тонкой структуры биополимеров (в частности полинуклеотидных последовательностей), входящих в состав сложных биологических объектов.
Компетенции, формируемые в результате освоения дисциплины	ОПК-3, ПК-1
Знания, умения и навыки, получаемые в процессе изучения дисциплины	В результате освоения дисциплины обучающийся должен: • знать основные принципы таксономии вирусов и устройства вирусных частиц; • знать карты геномов наиболее актуальных вирусных семейств; • знать основные типы противовирусных препаратов; • знать основные принципы разработки вакцинных препаратов; • знать принципы основных методов диагностики и основные сравнительные характеристики методов диагностики вирусных инфекций; • знать механизмы развития устойчивости к противовирусным препаратам; • уметь объяснить механизмы появления новых вирусных инфекций; • уметь объяснить пути передачи вирусных инфекций; • уметь объяснить причины распространения инфекций.
Краткая характеристика учебной дисциплины (основные блоки и темы)	Дисциплина «Молекулярная вирусология» имеет своей целью ознакомление студентов с рядом разделов таксономии вирусов, классической вирусологии, медицинской вирусологии и молекулярной биологии в применении к вирусологии, которые имеют отношение к современному пониманию строения вирусной частицы, геномики вирусов, репликационного цикла вирусов в клетке, молекулярных основ диагностики, профилактики и лечения вызываемых вирусами болезней для создания целостного представления о вирусах и вызываемых ими болезнях. Курс призван существенно расширить познания студентов в области молекулярных основ вирусологии и вакцинологии, а также ознакомить студентов с принципами создания вакцин и разработки современных противовирусных препаратов. Комплекс знаний, предлагаемых курсом, объединяет современные представления из целого ряда дисциплин на стыке химии и биологии: геномики, биоорганической химии, молекулярной биологии, вирусологии, таксономии вирусов и пр. В рамках курса даются базовые представления об общих принципах устройства вирусных частиц и их геномов, классификации вирусов, история развития вирусологии как науки, разработки и испытаниях вакцин и лечебных противовирусных препаратов; основных принципах химиотерапии вирусных заболеваний, современных принципах разработки лекарственных средств и тенденциях в этой области.
Трудоемкость (ЗЕ/часы)	2/72
Форма итогового контроля знания	экзамен

Учебная дисциплина «Мутагенез и репарация»
Цель изучения дисциплины	Ознакомить студентов с принципами основных и наиболее широко используемых методов молекулярной биологии, а также с особенностями их применения для решения тех или иных задач молекулярной биологии. На лекциях даются основные представления о наиболее часто используемых способах детекции, идентификации и фракционирования молекул биополимеров, а также лежащих в основе таких способов физико-химических принципах; разбираются физико-химические принципы функционирования приборов и приборных комплексов, используемых в молекулярной биологии, а также инструментальные подходы к решению комплексных задач молекулярной биологии, в частности идентификации компонентов сложных биологических объектов, точное измерение сверхмалых концентраций биополимеров, определение тонкой структуры биополимеров (в частности полинуклеотидных последовательностей), входящих в состав сложных биологических объектов.
Компетенции, формируемые в результате освоения дисциплины	ОПК-3, ПК-1
Знания, умения и навыки, получаемые в процессе изучения дисциплины	В результате освоения дисциплины обучающийся должен: - иметь представление о современных и развивающихся представлениях мутагенеза; - знать биохимические и молекулярно-биологические основы мутационного и репарационного процессов в клетках про- и эукариот; - знать об особенностях современных методологий, используемых для изучения мутационно-репарационной тематики; - иметь представление о перспективах развития управляемого мутагенеза и связанных с ним областей наук о жизни.
Краткая характеристика учебной дисциплины (основные блоки и темы)	Курс «Мутагенез и репарация» включает современные данные о сформировавшихся и развивающихся направлениях в области исследования процессов метаболизма ДНК (мутагенез/репликация/репарация/рекомбинация) в клетках про- и эукариот, рассматривает молекулярные механизмы клеточных процессов, обеспечивающих хранение и реализацию генетической информации, освещает роль мутагенеза и репарации ДНК в ходе онтогенеза и канцерогенеза.
Трудоемкость (ЗЕ/часы)	3/108
Форма итогового контроля знания	экзамен

Учебная дисциплина «Молекулярная эволюция»
Цель изучения дисциплины	Основной целью освоения дисциплины является ознакомление студентов с современными взглядами на теорию молекулярной эволюции, некоторыми моделями происхождения жизни, методами изучения эволюции макромолекул, некоторыми проблемами молекулярной коэволюции.
Компетенции, формируемые в результате освоения дисциплины	ОПК-6
Знания, умения и навыки, получаемые в процессе изучения дисциплины	В результате освоения дисциплины обучающийся должен: - иметь представление о современных и развивающихся представлениях мутагенеза; - знать биохимические и молекулярно-биологические основы мутационного и репарационного процессов в клетках про- и эукариот; - знать об особенностях современных методологий, используемых для изучения мутационно-репарационной тематики; - иметь представление о перспективах развития управляемого мутагенеза и связанных с ним областей наук о жизни.
Краткая характеристика учебной дисциплины (основные блоки и темы)	Содержание дисциплины охватывает весь круг вопросов, связанных с теорией молекулярной эволюции, некоторыми моделями происхождения жизни, методами изучения эволюции макромолекул, некоторыми проблемами молекулярной коэволюции.
Трудоемкость (ЗЕ/часы)	3/108
Форма итогового контроля знания	экзамен

Учебная дисциплина «Химия биополимеров»
Цель изучения дисциплины	Основной целью освоения дисциплины является получения знаний о свойствах биополимеров и применении химических методов для исследования структуры и функций данных биополимеров. Для достижения поставленной цели выделяются задачи курса: - Изучение химических свойств биополимеров - Изучение химических методов определения состава и последовательности - Изучение химических методов исследования пространственной и функциональной - структуры биополимеров. - Изучение методов высокоспецифичной модификации биополимеров и их применение для исследования структуры и функций биополимеров.
Компетенции, формируемые в результате освоения дисциплины	ОПК-3, ПК-1
Знания, умения и навыки, получаемые в процессе изучения дисциплины	В результате освоения дисциплины обучающийся должен: -иметь представление о структуре и химических свойствах белков, нуклеиновых кислот, стероидов, липидов и углеводов; -знать основные методы определения первичной последовательности в биополимере; - уметь применять химические методы исследования структуры и функции биополимеров.
Краткая характеристика учебной дисциплины (основные блоки и темы)	Курс «Химия биополимеров знакомит учащихся с новейшими методами исследования структуры биополимеров и химическими подходами к исследованию структурных основ их функционирования. Большая часть материалов курса не описана в учебниках и излагается по материалам оригинальных статей и обзоров в научных журналах. Содержание дисциплины охватывает аспекты биоорганической химии, биохимии, молекулярной биологии, и т. п., имеющие отношение к химическим свойствам белков, нуклеиновых кислот, липидов, стероидов и углеводов.
Трудоемкость (ЗЕ/часы)	3/108
Форма итогового контроля знания	экзамен

Учебная дисциплина «Эпигенетические механизмы регуляции экспрессии генов»
Цель изучения дисциплины	Основной целью освоения дисциплины является усвоение студентами основных молекулярных механизмов, лежащих в основе дифференциальной экспрессии генов, знакомство с уровнями организации хроматина и роли хроматина в регуляции экспрессии генов на самом современном уровне.
Компетенции, формируемые в результате освоения дисциплины	ОПК-3, ПК-1
Знания, умения и навыки, получаемые в процессе изучения дисциплины	В результате освоения дисциплины обучающийся должен: •Владеть современной молекулярно-биологической терминологией, имеющей отношение к регуляции экспрессии генов, организации хроматина и малым регуляторным РНК; •знать основные механизмы дифференциальной экспрессии генов; •знать основные классы белков, участвующих в нуклеосомной и наднуклеосомной организации хроматина; •знать основные посттрансляционные модификации гистонов и их роль в организации хроматина и регуляции экспрессии генов; •знать основные типы хроматина, особенности их организации и генезиса; •знать разнообразие разновидностей малых регуляторных РНК, принципы их классификации, особенности процессинга. •знать механизмы регуляции экспрессии генов с участием коротких РНК. •знать основные экспериментальные подходы, применяемые в эпигенетике.
Краткая характеристика учебной дисциплины (основные блоки и темы)	Содержание дисциплины охватывает аспекты современной генетики, молекулярной биологии, клеточной биологии, геномики и биоинформатики, имеющие отношение к современному пониманию механизмов наследуемой в клеточных поколениях регуляции экспрессии генов. В рамках курса даются базовые представления об уровнях организации хроматина, структуре нуклеосом, ковалентных модификации гистонов, вариантах гистонов, АТФ-зависимом ремоделинге хроматина, метилировании ДНК, роли коротких некодирующих РНК в регуляции экспрессии генов. Много внимания уделяется современным методическим подходам. Тема спецкурса находится на пике интереса современной биологии, в год публикуются тысячи новых статей, поэтому важной задачей разработчиков является ежегодная переработка материала, дополнение его новыми методическими подходями и последними открытиями. Поэтому в рамках спецкурса, наряду с хорошо исследованными механизмами, студенты сталкиваются с самыми последними открытиями в эпигенетике и эпигеномике.
Трудоемкость (ЗЕ/часы)	3/108
Форма итогового контроля знания	экзамен

Учебная дисциплина «Основы работы в ОС Linux»
Цель изучения дисциплины	Цель курса - освоение операционной системы Linux в объеме, достаточном для самостоятельной работы с прикладным программным обеспечением на персональных компьютерах и удаленных серверах.
Компетенции, формируемые в результате освоения дисциплины	ОПК-7
Знания, умения и навыки, получаемые в процессе изучения дисциплины	Для достижения поставленной цели выделяются следующие задачи: • освоение работы с пакетными менеджерами; • освоение работы в программной оболочке bash, изучение базовый принципов программирования с использованием bash; • получение практического опыта установки программ, распространяемых в виде исходных кодов; •освоение работы с очередью задач на кластерах и суперкомпьютерах.
Краткая характеристика учебной дисциплины (основные блоки и темы)	Основные блоки: • изучение основ устройства операционной системы Linux и организации файловой системы; • изучение принципов создания и распространения свободного программного обеспечения, различных типов лицензирования программного обеспечения; • ознакомление с различными программами, часто используемыми в операционной системе Linux, включая текстовые редакторы, сетевые утилиты, файловые менеджеры.
Трудоемкость (ЗЕ/часы)	1/36
Форма итогового контроля знания	зачет

Учебная дисциплина «Программирование на языке Python»
Цель изучения дисциплины	Цель курса - научить студентов основам программирования на языке Python.
Компетенции, формируемые в результате освоения дисциплины	ОПК-7
Знания, умения и навыки, получаемые в процессе изучения дисциплины	Для достижения поставленной цели выделяются следующие задачи: знакомство со средствами разработки и отладки приложений на языке Python; получение практического опыта по разработке небольших приложений на языке Python; знакомство с основными библиотеками для Python, в том числе предназначенными для разработки научного программного обеспечения.
Краткая характеристика учебной дисциплины (основные блоки и темы)	Основные блоки изучение основ процедурного и объектно-ориентированного программирования; получение представления о синтаксисе языка Pyhton, об основных конструкциях и операторах; изучение общепринятых правил по оформлению программ на языке Python;
Трудоемкость (ЗЕ/часы)	2/72
Форма итогового контроля знания	зачет

Учебная дисциплина «Алгоритмы и структуры данных»
Цель изучения дисциплины	Цели курса - развить у студентов алгоритмическое мышление и дать им знания об основных алгоритмах и структурах данных, необходимых для эффективной разработки программного обеспечения.
Компетенции, формируемые в результате освоения дисциплины	ПК-3
Знания, умения и навыки, получаемые в процессе изучения дисциплины	Для достижения поставленных целей выделяются следующие задачи: изучение основ теории графов и дискретной математики; получение навыков реализации базовых алгоритмов и структур данных; знакомство с различными алгоритмами, часто встречающимися при решении практических задач, в том числе биоинформатических; формирование понимания алгоритмической сложности и эффективности; получение навыка формализации поставленных задач; изучение инструментов анализа, отладки и оптимизации алгоритмов.
Краткая характеристика учебной дисциплины (основные блоки и темы)	Курс состоит из лекций и практических занятий. На практических занятиях используется язык Python.
Трудоемкость (ЗЕ/часы)	6/216
Форма итогового контроля знания	экзамен

Учебная дисциплина «Анализ данных и машинное обучение»
Цель изучения дисциплины	Цель курса - обучить студентов современным методам анализа данных, в том числе с использованием машинного обучения.
Компетенции, формируемые в результате освоения дисциплины	ОПК-7
Знания, умения и навыки, получаемые в процессе изучения дисциплины	Для достижения поставленной цели выделяются следующие задачи: изучение основ теории вероятностей и математической статистики; изучение основных принципов анализа данных; изучение и практическое освоение методов машинного обучения, таких как нейронные сети, метод опорных векторов, деревья решений, Randomforest; изучение методов уменьшения размерности данных; изучение методов deeplearning; освоение правильной методологии использования методов машинного обучения.
Краткая характеристика учебной дисциплины (основные блоки и темы)	Курс состоит из лекций и практических занятий. На практических занятиях используется язык Python и специализированное программное обеспечение для анализа данных Weka
Трудоемкость (ЗЕ/часы)	4/144
Форма итогового контроля знания	экзамен

Учебная дисциплина «3D-моделирование»
Цель изучения дисциплины	Цели курса - развить пространственное мышление и научить студентов решать практические задачи, связанные с 3D-моделированием, с помощью прикладного программного обеспечения.
Компетенции, формируемые в результате освоения дисциплины	ОПК-7
Знания, умения и навыки, получаемые в процессе изучения дисциплины	Для достижения поставленной цели выделяются следующие задачи: •получение навыков работы в свободно распространяемой программе 3D-моделирования Blender; •получение практического опыта изготовления объемной модели объекта по чертежу; •освоение процесса построения 3D-моделей для иллюстраций, анимации, интерактивных презентаций, моделирования физических процессов и 3D-печати; •освоение процесса подготовки иллюстраций пространственных структур биомолекул и других биологических объектов в соответствии с заданными требованиями по разрешению, формату файла, палитре цветов; •освоение процесса создания интерактивных презентаций; •освоение разработки и модификации 3D-моделей для 3D-печати.
Краткая характеристика учебной дисциплины (основные блоки и темы)	Курс состоит из практических занятий, используется свободно распространяемый пакет 3D-моделирования Blender. Основные блоки: •изучение базовых принципов 3D-моделирования с помощью современных программ, получение представления об освещении, текстурах, различных форматах файлов; •изучение общих принципов анимации, получение опыта создания анимации, в том числе для системы частиц; •знакомство с возможностями моделирования физических процессов; •знакомство с возможностями автоматизации работы в Blender с помощью встроенного скриптового языка Python.
Трудоемкость (ЗЕ/часы)	2/72
Форма итогового контроля знания	зачет

Учебная дисциплина «Практикум по структурнойбиоинформатике»
Цель изучения дисциплины	Цель курса - освоение на практике методов структурной биоинформатики и молекулярного моделирования.
Компетенции, формируемые в результате освоения дисциплины	ОПК-7
Знания, умения и навыки, получаемые в процессе изучения дисциплины	Для достижения поставленной цели выделяются следующие задачи курса: •освоение программ для просмотра и редактирования пространственных структур биомолекул; •освоение метода моделирования пространственной структуры белков по гомологии; • изучение методов моделирования пространственной структуры белков denovo; •освоение методов моделирования комплексов биомолекул друг с другом и с небольшимилигандами; •освоение всех этапов моделирования методом молекулярной динамики: создание модели белка в водном растворе, моделирование и анализ структуры и динамики модели; •освоение методов оценки свободной энергии с использованием «алхимических» превращений и с использованием потенциала средней силы.
Краткая характеристика учебной дисциплины (основные блоки и темы)	Курс состоит из практических занятий и самостоятельной работы.
Трудоемкость (ЗЕ/часы)	4/144
Форма итогового контроля знания	экзамен

Учебная дисциплина «Общая биоинформатика»
Цель изучения дисциплины	Цель курса - дать представление о типичных задачах биоинформатики и путях их решения.
Компетенции, формируемые в результате освоения дисциплины	ОПК-7
Знания, умения и навыки, получаемые в процессе изучения дисциплины	Для достижения поставленной цели выделяются следующие задачи курса: •изучение основных публичных источников биоинформатических данных; •изучение базовых алгоритмов, наиболее часто используемых при выравнивании и поиске нуклеотидных последовательностей; •изучение инструментов для работы с геномными и протеомными данными; •изучение способов визуализации данных биологических исследований; •изучение методов обработки результатов высокопроизводительногосеквенирования; •изучение использования высокопроизводительных вычислений для решениябиологических задач.
Краткая характеристика учебной дисциплины (основные блоки и темы)	Лекционный курс
Трудоемкость (ЗЕ/часы)	4/144
Форма итогового контроля знания	экзамен