Налоговый кодекс РФ не содержит разъяснений по данному вопросу.
По данному вопросу есть две точки зрения.
Официальной позиции нет.
Есть примеры судебных решений, согласно которым отсутствие в актах приема-передачи векселей ссылок на конкретные счета-фактуры не может являться основанием для отказа в вычете НДС.
В то же время есть судебные решения, из которых следует, что отсутствие в актах приема-передачи векселей ссылок на конкретные счета-фактуры является основанием для отказа в вычете, так как это не позволяет идентифицировать оплату по конкретному счету-фактуре.
Подробнее см. документы
Позиция 1. Право на вычет есть
Постановление ФАС Северо-Западного округа от 28.01.2010 по делу N А13-10133/2007
Суд признал неправомерным отказ в вычете на том основании, что в актах приема-передачи векселей отсутствуют реквизиты счетов-фактур. Кроме того, ни Налоговым кодексом РФ, ни вексельным правом не предусмотрено выделение в векселе суммы НДС.
Постановление ФАС Уральского округа от 02.07.2008 N Ф09-4702/08-С2 по делу N А76-26719/07
По мнению суда, акт приема-передачи векселя является первичным документом, поэтому он должен соответствовать требованиям ст. 9 Федерального закона от 21.11.1996 N 129-ФЗ "О бухгалтерском учете". В данной норме нет требования об обязательной ссылке на счет-фактуру.
Постановление ФАС Северо-Западного округа от 06.02.2007 по делу N А56-14818/2006
Суд отклонил довод об отсутствии в актах приема-передачи векселей ссылок на счета-фактуры, по которым происходила оплата товара. При этом суд отметил наличие акта сверки взаиморасчетов между налогоплательщиком и продавцом, в котором перечислены соответствующие счета-фактуры. Кроме того, в актах приема-передачи векселей указана сумма НДС, уплаченная налогоплательщиком продавцу в составе цены товара.
Аналогичные выводы содержит...
Постановление ФАС Северо-Западного округа от 06.05.2006 по делу N А56-11568/2005
Постановление ФАС Поволжского округа от 21.11.2006 по делу N А55-2583/2006 (Определением ВАС РФ от 20.03.2007 N 2845/07 отказано в передаче данного дела в Президиум ВАС РФ)
Суд установил, что отсутствие в актах приема-передачи векселей ссылок на конкретные счета-фактуры не лишает переданные векселя и акты приема-передачи векселей доказательственной силы документов, подтверждающих факт расчетов с поставщиками за поставленную продукцию, в том числе факт уплаты НДС.
Аналогичные выводы содержит...
Постановление ФАС Западно-Сибирского округа от 17.04.2006 N Ф04-1768/2006(21298-А45-34) по делу N А45-17032/05-12/665
Постановление ФАС Поволжского округа от 18.07.2006 по делу N А55-32435/2005-39
Постановление ФАС Поволжского округа от 18.07.2006 по делу N А55-32240/2005
Постановление ФАС Западно-Сибирского округа от 13.11.2006 N Ф04-7718/2006(28496-А27-14) по делу N А27-10080/06-6
По мнению суда, отсутствие в актах приема-передачи векселей указаний на счета-фактуры не свидетельствует об отсутствии факта поставки товара и оплаты за него, а также о том, что налогоплательщик не ведет хозяйственной деятельности.
Позиция 2. Права на вычет нет
Постановление ФАС Западно-Сибирского округа от 13.02.2006 N Ф04-1404/2005(19534-А03-34)
Суд установил, что акты приема-передачи векселей не содержат ссылку на конкретный счет-фактуру, на основании которого произведена оплата, а это не позволяет идентифицировать оплату по конкретному счету-фактуре.
Аналогичные выводы содержит...
Постановление ФАС Уральского округа от 03.05.2006 N Ф09-3287/06-С2 по делу N А71-487/05
Постановление ФАС Уральского округа от 19.05.2005 N Ф09-3200/04-С2
Постановление ФАС Уральского округа от 13.03.2006 N Ф09-1365/06-С2 по делу N А60-22520/05
Суд указал, что налогоплательщику правомерно отказано в применении налоговых вычетов, так как акты приема-передачи составлены с нарушениями (нет ссылки на договор с поставщиком и соответствующие счета-фактуры, не указано наименование товара, НДС не выделен отдельной строкой).