Согласно разъяснениям Минфина России до 1 апреля 2012 г. наравне с новой формой можно применять и прежнюю форму счета-фактуры (Письмо от 31.01.2012 N 03-07-15/11 (направлено для сведения и использования в работе Письмом ФНС России от 01.02.2012 N ЕД-4-3/1547@)).
По данному вопросу существует две точки зрения.
Согласно официальной позиции, выраженной Минфином России, в счете-фактуре, который выставляет обособленное подразделение, должно быть указано наименование организации-продавца (налогоплательщика). При этом Министерство ссылается на Правила заполнения счета-фактуры, утвержденные Постановлением Правительства РФ от 26.12.2011 N 1137. Ранее аналогичные разъяснения (со ссылкой на Постановление Правительства РФ от 02.12.2000 N 914) давали Минфин России, ФНС России, УФНС России по г. Москве.
Есть судебное решение, в котором признается правомерным указание в счете-фактуре в качестве продавца филиала организации.
Подробнее см. документы
Позиция 1. В счете-фактуре в качестве продавца указывается головная организация
Письмо Минфина России от 10.02.2012 N 03-07-09/06
Финансовое ведомство, ссылаясь на Правила заполнения счета-фактуры (утв. Постановлением Правительства РФ от 26.12.2011 N 1137), указало, что в счете-фактуре, который выставляет обособленное подразделение, должно быть указано наименование организации-продавца (налогоплательщика).
Аналогичные выводы содержит...
Письмо Минфина России от 26.01.2012 N 03-07-09/03
Письмо Минфина России от 02.11.2011 N 03-07-09/36
Министерство разъясняет, что в счете-фактуре, который выставляет обособленное подразделение, должно быть указано наименование организации-продавца (налогоплательщика).
Аналогичные выводы содержит...
Письмо Минфина России от 23.05.2011 N 03-07-09/12
Письмо Минфина России от 08.12.2009 N 03-07-11/310
Письмо Минфина России от 17.09.2009 N 03-07-09/47
Письмо Минфина России от 01.09.2009 N 03-07-09/43
Письмо Минфина России от 01.04.2009 N 03-07-09/15
Письмо Минфина России от 20.04.2007 N 03-07-11/114
Письмо Минфина России от 04.05.2006 N 03-04-09/08
Письмо ФНС России от 19.10.2005 N ММ-6-03/886@ "О применении законодательства по косвенным налогам за II и III кварталы 2005 года" (с изм. от 23.10.2006) (вместе с Разъяснениями по отдельным вопросам, связанным с применением законодательства по налогу на добавленную стоимость)
Письмо УФНС России по г. Москве от 19.05.2009 N 16-15/049391
Статья: Формируем сеть магазинов ("Торговля: бухгалтерский учет и налогообложение", 2008, N 3)
Статья: О порядке оформления счетов-фактур, ведения книг покупок и книг продаж (Белый А.И.) ("Налоговый вестник", 2007, N 3)
Статья: Особенности налогообложения организаций, имеющих обособленные структурные подразделения ("Новое в бухгалтерском учете и отчетности", 2006, N 24)
Постановление ФАС Московского округа от 28.01.2009 N КА-А40/13343-08 по делу N А40-36911/08-118-125
Суд пришел к выводу, что выставление филиалом счетов-фактур от имени головной организации не противоречит действующему законодательству.
Постановление ФАС Восточно-Сибирского округа от 04.03.2009 N А33-3064/08-Ф02-729/09, А33-3064/08-Ф02-734/09 по делу N А33-3064/08 (Определением ВАС РФ от 24.08.2009 N ВАС-8045/09 отказано в передаче данного дела в Президиум ВАС РФ)
Суд разъяснил, что плательщиками НДС признаются организации. Обособленные подразделения организации плательщиками налога не являются. Следовательно, счета-фактуры, в которых указаны наименование и адрес обособленного подразделения, а не наименование и юридический адрес организации-налогоплательщика, составлены с нарушением ст. 169 НК РФ и не являются основанием для принятия сумм НДС к вычету.
Аналогичные выводы содержит...
Постановление ФАС Восточно-Сибирского округа от 15.12.2006 N А19-9501/06-43-Ф02-6691/06-С1 по делу N А19-9501/06-43 (Определением ВАС РФ от 11.04.2007 N 3790/07 отказано в передаче данного дела в Президиум ВАС РФ)
Позиция 2. В счете-фактуре в качестве продавца указывается обособленное подразделение
Постановление ФАС Северо-Кавказского округа от 07.07.2008 N Ф08-3526/2008 по делу N А32-21024/2007-3/399 (Определением ВАС РФ от 06.11.2008 N 14211/08 отказано в передаче данного дела в Президиум ВАС РФ)
Суд отметил, что указание в счете-фактуре филиала в качестве продавца не является основанием для признания сведений о продавце недостоверными.
