После выхода в свет работ Дарвина сравнительная анатомия получила новую теоретическую базу для развития. Сравнительно-анатомические исследования второй половины Х1Х века в свою очередь внесли большой вклад в развитие Дарвинизма.
Большую роль сыграло установление гомологии органов, имеющее первостепенное значение для выяснения филогенетического родства между организмами. В частности, была определена гомология ядовитых желез змей со слюнными железами других животных, обнаружено, что молочные железы гомологичны потовым, челюсти ракообразных - их конечностям, жало пчелы - яйцекладку других насекомых, волосы млекопитающих - чешуе акулы, слуховые косточки среднего уха млекопитающих (стремя, молоточек, наковальня.) - костям висцерального черепа рыб, амфибий, рептилий и птиц, части цветка (пестик, тычинки, лепестки) -листьям.
Одним из доказательств эволюции являются также атавистические и рудиментарные органы.
АТАВИЗМ (лат.atavus - прародитель) - это появление признаков, присущих далеким предкам и в норме не встречающихся у современных форм. Естественно, что такие признаки говорят о филогенетическом родстве между различными организмами: теми, у кого такие признаки присутствуют как норма, и теми, у кого они появляются лишь как атавизм, атавистические признаки представляют собой ценное доказательство эволюционной теории. Примерами атавизма служат появление боковых пальцев у лошади, полосатость у домашних свиней, шейная фистула (образование, гомологичное жаберной щели), хвостовой придаток, обильная волосатость всего тела, наличие более двух молочных желез и т.д.- у человека.
РУДИМЕНТАРНЫМИ (лат.rudimentum-pfxfnjr) называются органы, утратившие свою функцию, но сохраняющиеся у взрослых животных. Обычно они остаются в зачаточном состоянии. Рудиментами являются остатки тазовых костей у безногой ящерицы желтопузика и китообразных. Они служат доказательством происхождения этих животных от предков, имевших развитые конечности.
У человека рудиментарными органами являются: копчик - остаток хвостовых позвонков, зачаточные ушные мышцы, свидетельствующие о том, что предки человека обладали подвижной ушной раковиной, зачаточное третье веко - гомолог мигательной перепонки наших далеких предков и т.п.
Сравнительно-анатомические исследования современных прогрессивных и примитивных форм позволяют представить облик их предков. Среди современных млекопитающих известны однопроходные, сумчатые и плацентарные. Сравнение их указывает, что эволюция млекопитающих шла от животных, откладывающих яйца, к живородящим формам с еще неразвитой плацентой и, наконец, к животным, рождающим уже хорошо сформированных детенышей.