Она включает в себя окисление начинающиеся в матриксе митохондрий при участии НАД (НАДФ) зависит от дыхательных цепей. По длинным цепям окисляется изолимонная кислота, яблочная кислота, жирные кислоты, молочная кислота.
Первый этап: в матриксе происходит дегидрирование с переносом электронов и протонов на кофермент НАД (НАДФ).
НАДФ зависимая дегидрогиназа выполняет роль коллектора электронов и протонов от окисляемых веществ. Образуется восстановленная форма НАД (НАДФ) затем включается в длительную дыхательную цепь и в ней НАДН2 окисляется при участии флавопротеидов.
Схема:
В последующем восстановленная форма флавопротеида переносит электрон на Fe-S комплекс.
Электрон с FeS при участии флавопротеида перебрасывается на следующий компонент: КоQ.
Второй этап: КоQН2 оказывается системой цитохромов, на которые с КоQ перебрасываются только электроны, а протоны выделяются в м/мембранное пространство:
Под действием цитохромоксидазы на молекулу кислорода перебрасываются 4 электрона, получается два О2. Этот кислород в последующем заимствуется с 4Н+→ Н2О т.о. можно воедино свести дыхательную цепь:
