Краткий словарь терминов, используемых в биотехнологии

(за основу взят список по Б. Глику, Дж. Пастернаку)

 

1. Адаптер. 1. Синтетический двухцепочечный олигонуклеотид с од­ним тупым концом и одним липким концом. После пришивания адап­тера тупым концом к ДНК-мишени последнюю можно встраивать в подходящий вектор, используя приобретенный ею липкий конец. 2. Синтетический одноцепочечный олигонуклеотид, у которого после самогибридизации появляются липкие концы и внутренний сайт для рестрицирующей эндонуклеазы. Когда адаптор встраивают в клони­рующий вектор, у вектора появляется новый сайт рестрикции.

2. Аденин. Пуриновое основание, комплементарное тимину и урацилу. Одно из азотистых оснований, входящих в состав ДНК и РНК.

3. Активатор. 1. Вещество, стимулирующее транскрипцию специфи­ческого гена и оперона. 2. Белок, связывающийся с опероном и уско­ряющий транскрипцию; используется также название «активаторный белок».

4. Актин. Белок мышечных волокон; входит в состав актомиозина - основного сократительного мышечного белка.

5. Аллель. Одна из двух (или нескольких) альтернативных структур­ных форм гена.

6. Аллостерическая регуляция. Регуляция активности фермента, осуществляемая эффекторной молекулой, которая связывается с участ­ком в молекуле фермента, удаленным от активного центра.

7. Альгинат. Полисахарид, синтезируемый различными водорослями и бактериями; состоит из остатков β-D-маннуроната и a-L-гулуроната.

8. Альтернативный сплайсинг. Соединение экзонов данного гена в разных комбинациях с образованием различающихся зрелых молекул мРНК.

9. Аминоацил-тРНК. Молекула тРНК, к 3'-концу которой присоеди­нена специфическая аминокислота.

10. Аминоацильный сайт, А-сайт. Участок рибосомы, связывающий аминоцил - тРНК в процессе трансляции.

11. Аминокислота. Мономерная единица («строительный блок») бел­ковых молекул.

12. Ампликон. Плазмидный вектор вируса простого герпеса типа 1.

13. Анаэробные микроорганизмы. Микроорганизмы, растущие в отсут­ствие кислорода.

14. Антибиотик. Вещество, синтезируемое одним микроорганизмом и оказывающее ингибирующее действие на другие микроорганизмы и раковые клетки.

15. Антиген. Вещество, воспринимаемое организмом как чужеродное и вызывающее специфический иммунный ответ - выработку антител.

16. Антикодон. Триплет нуклеотидов в молекуле тРНК, комплемен­тарный нуклеотидам специфического кодона в молекуле мРНК.

17. Антипараллельная ориентация. Противоположная направлен­ность (5' —> 3' и 3' —> 5') цепей в двухцепочечных молекулах нуклеино­вых кислот.

18. «Антисмысловая» цепь. 1. Транскрибируемая (кодирующая) цепь в молекуле хромосомной ДНК. 2. Одна из нитей в двухцепочечной моле­куле ДНК, нуклеотидная последовательность которой комплементарна таковой у соответствующей мРНК.

19. Антисыворотка. Жидкая составляющая крови, содержащая анти­тела.

20. Антитело. Белок (иммуноглобулин), синтезируемый В-лимфоцитами в ответ на попадание в организм различных антигенов и специфи­чески с ними взаимодействующий.

21. Антифризный белок. Богатый аланином белок, вырабатываемый в печени некоторых водных организмов и предотвращающий замерзание плазмы крови. Обнаружен также в клетках некоторых насекомых, рас­тений, бактерий, где он регулирует образование кристаллов льда при низких температурах.

22. Аптамер. Синтетический полинуклеотид, связывающийся с бел­ком, в норме не взаимодействующим с нуклеиновыми кислотами.

23. Аттенуированная (ослабленная) вакцина. Вакцина, приготовлен­ная с использованием ослабленных тем или иным образом микроорга­низмов.

24. Аутологичные клетки. Клетки, взятые от данного организма, куль­тивированные, возможно, генетически измененные и вновь введенные в организм-донор.

25. Аутосома. Любая хромосома, не являющаяся половой. В соматиче­ских клетках человека присутствуют 22 пары аутосом и одна пара поло­вых хромосом.

26. Аутосомное наследование. Несцепленное с полом наследование какого-либо признака.

27. Ацилпереносящий белок. Низкомолекулярный белок, компонент более крупного комплекса, участвующего в биосинтезе жирных кислот или поликетидов.

28. Аэробные микроорганизмы. Микроорганизмы, растущие только в присутствии кислорода.

29. Бакмида. Челночный вектор на основе генома AcMNPV, способный существовать в клетках Е. coli и клетках насекомых.

30. Бактериофаг. Вирус, инфицирующий бактерии.

31. Бактериоцин. Вещество, синтезируемое одним микроорганизмом и убивающее клетки другого микроорганизма.

32. Баллистическая трансфекция. Введение ДНК в растительные и животные клетки или органеллы с помощью вольфрамовых или золо­тых шариков. ДНК осаждают, покрывают ею шарики и «обстреливают» ими клетки.

33. G-белки. Мембранные белки, активизирующиеся после взаимодей­ствия с GTP. Участвуют в передаче сигнала от клеточных рецепторов к ферментам на внутренней поверхности мембран.

34. Белки теплового шока. Белки, синтезируемые в ответ на резкое по­вышение температуры.

35. Бетаин. Низкомолекулярное соединение, служащее донором ме­тальной группы при биосинтезе метионина.

36. Библиотека кДНК. Коллекция клонов кДНК, синтезируемых in vi­tro на матрицах мРНК, происходящих из одной ткани или клеточной популяции.

37. Бинарная векторная система. Двухплазмидная система Agrobacterium, предназначенная для переноса участка тДНК, несущего клониро­ванные гены в растительные клетки. Гены вирулентности локализованы на одной плазмиде, а встроенный участок тДНК - на другой.

38. Бинарное деление. Прямое, не связанное с половым процессом раз­деление прокариотической клетки на примерно одинаковые по разме­рам дочерние клетки.

39. Биодеградация. Разрушение загрязняющих веществ, попавших в окружающую среду, с помощью живых микроорганизмов.

40. Биоконтроль. Процесс, в котором используется живые организмы для ограничения роста и развития патогенных микроорганизмов.

41. Биомаркер. Биологический признак, позволяющий судить о прогрессировании патологического процесса или об эффективности лече­ния.

42. Биомасса. 1. Клеточная масса, образующаяся в результате жизне­деятельности живых организмов. 2. Органическое вещество, которое может использоваться как источник энергии или химических соедине­ний.

43. Биореактор, ферментер. Устройство, в котором протекают биохи­мические реакции при участии живых микроорганизмов, клеточных экстрактов или ферментов. Часто этот термин относится к сосуду, в ко­тором растут микроорганизмы.

44. Блоттинг. Перенос разделенных молекул из одной среды (напри­мер, геля) на твердый носитель (бумагу, нетроцеллюлозный фильтр).

45. Брошь, пробел. Отсутствие одного или нескольких нуклеотидов в одной из цепей двухцепочечной ДНК.

46. Вакцинация. Введение в организм антигена с тем, чтобы индуциро­вать в нем выработку антител к возможному инфицирующему агенту.

47. Вариабельные домены. Участки полипептидных цепей антитела, имеющие неодинаковую аминокислотную последовательность у моле­кул разных антител; отвечают за специфичность последних.

48. Вектор. Самореплицирующаяся молекула ДНК (например, бакте­риальная плазмида), используемая в генной инженерии для переноса генов от организма-донора в организм-реципиент, а также для клониро­вания нуклеотидных последовательностей.

49. Вестерн-блоттинг. Перенос белковых молекул, разделенных с помощью гель-электрофореза, на твердую подложку.

50. Вирион. Вирусная частица.

51. Вирулентность. Характеристика патогенности микроорганизма.

52. Вирус-помощник. Вирулентный штамм вируса, в присутствии ко­торого дефектный вирус может размножаться в клетке-хозяине.

53. Время генерации. Время, за которое в популяции одноклеточных организмов удваивается число клеток; называется также временем уд­воения.

54. Вставка. Сегмент ДНК, встроенный в клонирующий вектор.

55. Вторичный метаболит. Вещество, не являющееся обязательным для роста или функционирования клетки, но синтезирующееся в ста­ционарной фазе (обычно участвует в защите клеток или микроорганиз­мов от тех или иных воздействий).

56. Гамета. Репродуктивная гаплоидная клетка многоклеточного орга­низма.

57. Гаплоидный. Термин, характеризующий организм (клетку), у кото­рого имеется один набор хромосом.

58. Ген. Транскрибируемый участок хромосомы, кодирующий функ­циональный белок либо тРНК или рРНК.

59. Ген «самоубийства», «суицидальный» ген. Ген, вызывающий при определенных условиях гибель собственной клетки.

60. Генетический код. Система записи генетической информации в виде последовательности нуклеотидов, в которой каждые три нуклеотида, составляющие кодон, кодирует одну аминокислоту. Состоит из 64 кодонов, кодирующих все 20 аминокислот и три терминирующих кодона.

61. Ген-кандидат. Структурный ген в геноме человека, мутация в ко­тором предположительно является причиной конкретного наследствен­ного заболевания.

62. Ген-мишень. 1. Клонированный ген. 2. Ген, подвергаемый специ­фическому воздействию. 3. Ген, интересующий исследователя.

63. Генная иммунизация. Индукция у организма иммунного ответа без введения антигена, путем включения в клетки гена, кодирующего бе­лок-антиген.

64. Генная терапия ex vivo. Введение гена (или генов) в изолирован­ные клетки больного. После культивирования и трансформации клетки вводят в организм больного с помощью трансфузии, инфузии или инъ­екции. Эта процедура позволяет устранять генетические дефекты.

65. Генная терапия in vivo. Введение гена (генов) непосредственно в ткань или орган с целью устранения генетического нарушения.

66. Геном. Совокупность генов гаплоидного набора хромосом данного организма.

67. Геномная библиотека, банк генов. Набор клонированных фраг­ментов ДНК, в совокупности составляющих индивидуальный (группо­вой, видовой) геном. Если речь идет о крупном геноме (млекопитаю­щие), то получают хромосомоспецифичные библиотеки.

68. Генотип. Генетическая конструкция организма, набор всех его ал­лелей (альтернативных форм).

69. Гетерозигота. Организм, в геноме которого имеются одна или не­сколько пар различающихся аллелей.

70. Гибридный белок, химерный белок. Продукт клонированных со­вместно двух или более кодирующих последовательностей из разных генов; представляет собой одну полипептидную цепь.

71. Гибридный ген. Ген, состоящий из частей двух или нескольких ге­нов и экспрессирующийся как единое целое с образованием гибридного (химерного) белка.

72. Гибридома. Гибридная клеточная линия, полученная при слиянии нормальных антителообразующих клеток (лимфоцитов) и миеломных клеток. Обладает способностью к неограниченному росту и синтезу моноклональных антител.

73. Гомологичные. Происходящие из одного источника или имеющие сходную структуру или эволюционное происхождение.

74. Гомомерный белок. Белок, состоящий из двух или более идентич­ных полипептидных цепей (субъединиц).

75. Группа несовместимости. Группа плазмид, представители кото­рой могут сосуществовать в одной клетке.

76. Группа совместимости. Группа плазмид, члены которой не спо­собны сосущестовать в одной бактериальной клетке.

77. Гуанин. Пуриновое основание, комплементарное цитозину; одно из четырех азотистых оснований, входящих в состав ДНК и РНК.

78. Гуморальный иммунный ответ. Синтез антител В-клетками им­мунный системы в ответ на присутствие в организме чужеродных анти­тел.

79. Дегалогенирование. Отщепление атома галогена (хлора, иода, бро­ма, фтора), обычно при биодеградации.

80. Дезоксирибоза. Пятиуглеродный моносахарид, входящий в состав ДНК.

81. Дезоксирибонуклеаза 1, ДНКаза 1. Фермент, расщепляющий двух-цепочеченую ДНК. Используется для очистки препаратов РНК и бес­клеточных экстрактов.

82. Дезоксирибонуклеиновая кислота, ДНК. Полимер, состоящий из дезоксирибонуклеотидов; видоспецифичныи носитель генетической информации.

83. Делеция. Выпадение участка хромосомы из ее внутренней области.

84. Денатурация. 1. Расхождение цепей двухцепочечной молекулы ДНК или РНК. 2. Нарушение нативной конформации биологических макромолекул в результате разрушения нековалентных (водородных) связей.

85. Диплоид. Организм, клетки которого содержат два гомологичных набора хромосом.

86. Дисульфидная связь. Ковалентная связь между двумя атомами се­ры, входящими в молекулы цистеина; стабилизирует третичную струк­туру полипептидных цепей.

87. Дитиотрейтол. Низкомолекулярный тиолсодержащий восстанав­ливающий агент. Добавляется в буферные растворы в низкой концен­трации для предотвращения окисления сульфгидрильных групп в бел­ках. В высоких концентрациях используется для восстановления дисульфидных связей.

88. ДНК-зонд. Фрагмент ДНК, меченый тем или иным образом и ис­пользующийся для гибридизации со специфическим участком в моле­куле ДНК. Позволяет идентифицировать комплементарные ему нуклеотидные последовательности.

89. ДНК-лигаза. Фермент, катализирующий образование фосфорно-диэфирной связи между З'-гидроксильной группой и 5'-фосфатом со­седних нуклеотидов в месте одноцепочечного разрыва молекулы ДНК.

90. ДНК-полимераза. Фермент, катализирующий синтез полинуклеотидной цепи из отдельных нуклеотидов с использованием другой цепи в качестве матрицы и ДНК-затравки со свободной З'-ОН-группой.

91. Додецилсульфат натрия. Анионный детергент, использующийся для денатурации белков.

92. Домен. Участок полипептидной цепи, выполняющий определенную функцию (например, цитоплазматический домен, трансмембранный домен и т.д.).

93. Емкость вектора. Максимальный размер участка ДНК, который может быть клонирован в данном векторе.

94. Енолаза. Фермент, катализирующий превращение 2-фосфоглице-рата в фосфоенолпируват.

95. Енолредуктаза. Фермент, участвующий в синтезе поликетидных антибиотиков.

96. Заместительная терапия. Введение в организм метаболитов, ко­факторов, гормонов, восполняющих их дефицит, обусловленный гене­тическим дефектом.

97. Зонд. 1. Соединение, меченое тем или иным способом и исполь­зующееся для выявления родственных биохимических молекул в слож­ном образце. 2. Олигонуклеотид, использующийся для выявления ком­плементарных последовательностей с помощью гибридизации.

98. Иммунотерапия. Использование антитела или химерного белка, содержащего сайт связывания антитела, для лечения больного или об­легчения его состояния.

99. Иммунный ответ. Совокупность физиологических процессов в ор­ганизме, индуцируемых при попадании в него чужеродных антигенов.

100. Иммуноаффинная хроматография. Метод очистки, при котором фиксированное на матрице антитело связывает специфический белок, присутствующий в сложной смеси других белков.

101. Иммунологический анализ. Метод, основанный на способности ан­титела узнавать специфический компонент в биологическом образце.

102. Иммуносупрессия. Потеря способности иммунной системы орга­низма к иммунному ответу на тот или иной антиген.

103. Иммунотоксин. Химерный белок, состоящий из двух доменов, один из которых обладает свойством антитела, другой - токсина. Пер­вый домен обеспечивает связывание химерного белка со специфической молекулой или клеткой, второй инактивирует молекулу-мишень или убивает клетку.

104. Ингибирование конечным продуктом. Ингибирование фермента метаболитом - конечным продуктом метаболического пути.

105. Индолил-3-уксусная кислота. Растительный гормон, относящийся к классу ауксинов, стимулирующий рост растений.

106. Индуктор. Небольшая молекула, связывающаяся с регуляторным белком - репрессором, что приводит к дерепрессии соответствующих генов.

107. Индукция. Дерепрессия гена или группы генов под действием ин­дуктора.

108. Инициация. Начало синтеза биополимера.

109. Инициирующий кодон. Сигнал инициации трансляции.

110. Инициирующий комплекс. Структура, необходимая для инициации синтеза полипептидной цепи рибосомами.

111. Интеграция. Встраивание чужеродной ДНК (обычно с помощью гомологичной рекомбинации) в хромосому хозяйской клетки.

112. Интегрирующий вектор. Вектор, специально сконструированный для того, чтобы с его помощью можно было встраивать (интегрировать) клонированную ДНК в геном клетки-хозяина.

113. Интерлейкин-2. Лимфокин, секретируемый некоторыми Т-лимфоцитами и стимулирующий пролиферацию Т-клеток.

114. Интрон. Транскрибируемый участок гена, не содержащий кодонов и вырезаемый из первичного транскрипта в ходе процессинга с образо­ванием функциональной РНК.

115. Ионный канал. Трансмембранный белок, облегчающий транспорт определенных ионов.

116. Исключение. Вырезание сегмента ДНК из хромосомы или клони­рующего вектора, осуществляемое in vivo или in vitro с помощью спе­цифического фермента.

117. Искусственная бактериальная хромосома. Векторная система на основе F-плазмиды Е. coli, используемая для клонирования длинных последовательностей.

118. Капсид. Белковая оболочка вирусной частицы.

119. Картирование генов. Определение положения данного гена на хромосоме относительно других генов.

120. В-клетки. Лимфоциты из клеток костного мозга, продуцирующие антитела.

121. Клеточная линия. Группа клеток, поддерживаемая в культуре пу­тем процессов.

122. Клеточно-опосредованный (клеточный) иммунитет. Иммунные реакции, инициируемые клетками, а не антигенами или другими гумо­ральными факторами.

123. Клон. Популяция клеток или молекул, идентичных одной родоначальной клетке или молекуле.

124. Клонирование. Совокупность процедур, использующихся для полу­чения клонов.

125. Клонирование генов. Система методов, использующаяся для полу­чения клонированных ДНК: выделение нужного гена из какого-либо организма, встраивание его в плазмиду (вектор), введение в клетку ор­ганизма-хозяина, многократная репликация.

126. Клонирующий вектор. Молекула ДНК (плазмидная или вирусная ДНК), предназначенная для клонирования ДНК-мишени.

127. Кодон. Три соседних нуклеотида, кодирующих определенную ами­нокислоту. Всего существует 64 сочетания нуклеотидов в кодонах; 61 из них кодирует 20 аминокислот, 3 являются нонсенс-кодонами.

128. Компетенция. Способность бактериальных клеток воспринимать трансформирующую ДНК (обычно плазмиду).

129. Комплемент. Белковый комплекс сыворотки крови, один из со­ставляющих врожденного иммунитета. Принимает участие в регуляции воспалительных процессов, активации фагоцитоза и литическом действии на клеточные мембраны; активизируется взаимодействием с им­мунным комплексом.

130. Комплементарная ДНК, кДНК. Молекула ДНК, синтезированная на РНК-матрице с участием РНК-зависимой ДНК-полимеразы (обрат­ной транскриптазы).

131. Комплементарные нуклеотидные последовательности. Поли-нуклеотидные последовательности, которые взаимодействуют между собой в соответствии с правилами спаривания оснований: аденин обра­зует пару с тимином (или урацилом), гуанин - с цитозином.

132. Конститутивный синтез. Постоянно происходящий в клетке или целом организме синтез РНК или какого-либо белка.

133. Конформационный полиморфизм одноцепочечной ДНК. Различиев конформации одноцепочечных ДНК, отличающихся одна от другой всего одним нуклеотидом. Анализируемые ДНК подвергают денатура­ции. Денатурированные цепи принимают разную конформацию и при гель-электрофорезе мигрируют с разной скоростью.

134. Конъюгативные плазмиды. Плазмиды, способные передаваться от одной клетки другой во время конъюгации.

135. Конъюгация. Форма полового процесса. У бактерий - однонаправ­ленный перенос ДНК из одной контактирующей клетки в другую.

136. Кофактор. Низкомолекулярное вещество, необходимое для проте­кания определенной ферментативной реакции.

137. Коферментация. Одновременный рост двух микроорганизмов в одном биореакторе.

138. Ксилоза. Пятиуглеродный сахар, основной компонент гемицеллюлозы.

139. Культура. Популяция клеток или микроорганизмов, выращиваемых в контролируемых условиях in vitro..

140. Культуральная среда. Твердая или жидкая среда, использующаяся для выращивания микроорганизмов in vitro.

141. Лигирование. Соединение двух молекул ДНК с помощью фосфодиэфирных связей; in vitro катализируется ферментом ДНК-лигазой.

142. Лигноцеллюлоза. Комплекс лигнина, гемицеллюлозы, целлюлозы, составляющий структурный каркас клеточной стенки растений.

143. Лизис. Разрушение клеточных стенок под действием ферментов, содержащихся в лизосомах, или других агентов.

144. Линкер. Синтетический олигонуклеотид, содержащий сайт рест­рикции. Используется для соединения векторной и клонируемой ДНК, к концам которого по методу сшивания тупых концов присоединены линкеры.

145. Липаза. Фермент, расщепляющий липиды.

146. Липкие концы. Взаимно комплементарные одноцепочечные участ­ки ДНК, выступающие по концам двухцепочечной молекулы; образу­ются в результате ступенчатых разрезов двухцепочечных ДНК.

147. Липополисахарид. Соединение, содержащее липид, связанный с полисахаридом. Один из компонентов клеточной стенки бактерий.

148. Липосома. Пузырек, образуемый одно- или двухслойной мембра­ной, состоящей из липидных молекул. Гидрофобная часть этих молекул обращена внутрь пузырька, гидрофильная - наружу. Внутри пузырька могут находиться нуклеиновые кислоты, лекарственные и др. вещества, адресно доставляемые липосомой.

149. Литический цикл. Размножение вируса в клетке-хозяине, оканчи­вающееся лизисом клетки.

150. Локус. Место на хромосоме, где находится специфический ген.

151. Макрофаг. Крупный лейкоцит, обладающий способностью к фаго­цитозу.

152. Маркерный ген. Ген с известной хромосомной локализацией, имеющий четкое фенотипическое проявление (устойчивость к антибио­тику, ферментативная активность и т.д.).

153. Маркерный пептид. Участок гибридной белковой молекулы, об­легчающий идентификацию или очистку белка.

154. Матричная РНК, мРНК. Молекула РНК, в которой заключена ин­формация об аминокислотной последовательности определенной бел­ковой молекулы.

155. Матричная цепь. Цепь ДНК или другой полинуклеотид, исполь­зуемый ДНК-полимеразой в качестве матрицы для синтеза комплемен­тарной цепи.

156. Мезофильные микроорганизмы. Организмы, способные расти при температуре от 20 до 50 °С; оптимальная температура роста 37 °С.

157. Меристема. Ткань растений, обладающая способностью к актив­ному делению. У молодых растений обычно находится у кончиков кор­ней и побегов.

158. Метаболизм. Совокупность физических и химических процессов, протекающих в организме и обеспечивающих его существование. Про­дукты метаболизма называются метаболитами.

159. Метаболическая перегрузка. Нарушение метаболизма организма-хозяина в результате введения в его геном и экспрессии чужеродной ДНК.

160. Мицелий. Вегетативное тело гриба, состоящее из тонких ветвящих­ся нитей.

161. Мишень. В самом широком смысле - биологический объект (ткань, молекула, клетка, микроорганизм), которая интересует исследователя.

162. Молекулярная диагностика. Выявление молекулярно-биологическими методами патогенного микроорганизма, специфического веще­ства или измененной нуклеотидной последовательности, ответственных за то или иное заболевание.

163. Моноклональные антитела. Однотипные антитела; строго специ­фичные в отношении одного эпитопа (антигенной детерминанты). Син­тезируются гибридомами - клеточными гибридами, полученными при слиянии нормальных антителообразующих клеток с миеломной опухо­левой клеткой, способной к неограниченному росту. Некоторые миеломные клетки синтезируют моноклональные тела самостоятельно.

164. Мутагенез. Искусственное введение мутаций с помощью физиче­ских или химических агентов.

165. Мутант. Организм, измененный в результате мутации; как прави­ло, отличается от исходной формы (дикого типа).

166. Мутация. Спонтанное или индуцированное изменение структуры гена.

167. Нарушение комплементарности. Наличие в двухцепочечной мо­лекуле ДНК одной или нескольнких пар некомплементарных осно­ваний.

168. Неомицинфосфотрансфераза. Фермент, инактивирующий анти­биотики неомицин и канамицин; используется как селективный маркер для трансгенных растений.

169. Непрерывная ферментация. Культивирование микроорганизмов при непрерывном добавлении в биореактор среды и выведении такого же объема суспензии.

170. Нуклеаза S1. Фермент, специфически деградирующий одноцепочечную ДНК.

171. Нуклеозид. Пуриновое или пиримидиновое азотистое основание, ковалентно связанное с пятиуглеродным сахаром (пентозой). Если са­харом является рибоза, то вещество называется рибонуклеозид, а если дезоксирибоза - дезоксирибонуклеозид.

172. Нуклеотид. Нуклеозид, к которому присоединена одна или более фосфатных групп, присоединение происходит по 5'-углеродному атому сахарного кольца. Нуклеозиды, связанные с рибозой называются рибонуклеозидмонофосфатами, рибонуклеозиддифосфатами или рибонукле-озидтрифосфатами. Для нуклеозидов, связанных с дезоксирибозой, соотвествующие названия таковы: дезоксирибонуклеозидмоно-, ди-, и трифосфаты.

173. N-конец. Первая аминокислота (или несколько аминокислот) в бел­ковой молекуле.

174. Обратная транскриптаза. РНК-зависимая ДНК-полимераза, ис­пользующая молекулу РНК в качестве матрицы для синтеза комплемен­тарной цепи ДНК.

175. Обратная транскрипция - полимеразная цепная реакция. Способ получений в большом количестве кДНК, состоящий из двух этапов. Вначале in vitro синтезируют кДНК, используя обратную транскрипта-зу, мРНК в качестве матрицы, затем кДНК амплифицируют полимераз-ной цепной реакцией (ПЦР).

176. Олигонуклеотид, олигомер. Короткий (6-10 нуклеотидов) сегмент одноцепочечной ДНК; обычно получают химическим путем.

177. Онкоген. Ген, экспрессия которого приводит к неконтролируемой пролиферации (трансформации) клеток.

178. Оператор. Участок ДНК, непосредственно примыкающий к струк­турному гену и регулирующий его транскрипцию при участии репрессора или активатора.

179. Оперон. Участок ДНК, содержащий несколько структурных генов, транскрибируемых с образованием одной полицистронной мРНК.

180. Отжиг. Процесс образования двухцепочечных молекул (ДНК-ДНК или ДНК-РНК) из одиночных полинуклеотидных комплементарных цепей.

181. Пассивный иммунитет. Форма иммунитета, возникающая при введении в организм сыворотки, содержащей антитела, выработанные другим организмом в результате активной иммунизации.

182. Пептид. Короткая цепочка аминокислот, соединенных пептидными связями.

183. Пептидил-тРНК. Молекула тРНК с присоединенной к ней расту­щей полипептидной цепью.

184. Пептидная вакцина. Короткая цепочка из аминокислот, индуци­рующая образование антител к специфическому инфекционному агенту.

185. Пептидная связь. Ковалентная связь между свободной карбок­сильной группой при ά-углеродном атоме одной аминокислоты и сво­бодной карбоксильной группой при таком же атоме соседней амино­кислоты в полимерной цепи.

186. Первичная культура. Культура клеток или тканей, взятых непо­средственно от организма.

187. Периодическая ферментация. Культивирование микроорганизмов в течение ограниченного интервала времени. Свежую среду инокулируют посевным материалом и проводят культивирование в непрерыв­ном режиме, не добавляя новых порций среды и не удаляя продуктов, пока процесс не завершится сам собой.

188. Периодическая ферментация с добавлением субстрата. Культи­вирование микроорганизмов в течение ограниченного интервала време­ни с периодическим добавлением субстрата и сбором продукта только по завершении процесса.

189. Периплазматическое пространство. Пространство между плазма­тической мембраной бактериальной клетки и наружной мембраной или клеточной стенкой.

190. Перимидины. Один из двух типов азотистых оснований, входящих в состав нуклеиновых кислот; к пиримидинам относятся тимин цитозин, урацил. Второй тип оснований - пурины; к ним относится аденин гуанин.

191. Плазмида. Внехромосомный генетический элемент, способный к длительному автономному существованию и репликации.

192. Плазмидная несовместимость. Механизм регуляции числа копий плазмид одного типа в бактериальной клетке. Обеспечивает невозмож­ность внутриклеточного сосуществования плазмид, принадлежащих к одной группе совместимости.

193. Пластида. Органелла растительных клеток (например, хлоропласт). Многие пластиды имеют собственный геном.

194. Поливалентная вакцина. Вакцина, дающая иммунный ответ на не­сколько инфекционных агентов или на разные эпитопы одной молекулы.

195. Поликетидсинтетаза. Фермент, участвующий в биосинтезе поли-кетидных антибиотиков.

196. Поликетидные антибиотики. Класс антибиотиков, которые обра­зуются в результате последовательной ферментативной конденсации карбоновых кислот (ацетата, пропионата и др.).

197. Полилинкер. Короткий участок ДНК, содержащий несколько уни­кальных сайтов узнавания для эндонуклеаз; в эти сайты встраивают чу­жеродную ДНК (осуществляют клонирование).

198. Полимеразная цепная реакция (ПЦР). Метод амплификации спе­цифического сегмента ДНК с помощью термостабильной ДНК-полимеразы с использованием олигонуклеотидных ДНК-зондов, ком­плементарных последовательностям противоположных цепей ДНК, фланкирующим аплифицируемый сегмент. Процесс состоит из серии циклически повторяющихся реакций: денатурации ДНК, отжига зондов, синтеза ДНК.

199. Полиморфизм длины рестрикционных фрагментов. Вариабель­ность длины фрагментов ДНК, образующихся при ее расщеплении рестриктазами. Обусловлена мутационным изменением сайтов рестрик­ции или появлением новых сайтов. Обнаруживается при разделении фрагментов с помощью гель-электрофореза.

200. Полиморфный сайт. Участок хромосомы, представленный в попу­ляции более, чем одним вариантом и встречающийся с частотой не ме­нее 1%.

201. Полинуклеотид. Линейный полимер, состоящий из 20 и более нуклеотидов, соединенных друг с другом фосфодиэфирными связями. По-линуклеотидами являются, например, молекулы ДНК и РНК.

202. Полипептид. Линейный полимер, состоящий из аминокислот, со­единенных друг с другом пептидными связями. Полипептидом являет­ся, например, белковая молекула.

203. Полицистронная мРНК. Молекула мРНК, кодирующая более од­ного белка. Образуется при транскрипции двух или более соседних ге­нов, входящих в состав одного оперона.

204. Посттрансляционные модификации. Изменение структуры бел­ковых молекул после завершения их синтеза рибосомами. К таким мо­дификациям относятся: фосфорилирование, гликозилирование, окисле­ние цистеина, отщепление сигнальных последовательностей и т.д.

205. Праймер. Короткий олигонуклеотид, который гибридизируется с матрицей и служит затравкой при ее копировании.

206. Прокариоты. Организмы, у которых нет ограниченных мембрана­ми ядра и органелл. К прокариотам относятся все бактерии.

207. Промотор. Участок молекулы ДНК, с которым связывается РНК-полимераза, что сопровождается инициацией транскрипции соответст­вующих генов.

208. Протеиназы, протеолитические ферменты. Ферменты, расщеп­ляющие пептидные связи в белковых молекулах.

209. Протеолиз. Ферментативное расщепление белков.

210. Протопласт. Бактериальная, дрожжевая или растительная клетка, стенка которой разрушена ферментативным или химическим путем.

211. Процессинг. Совокупность процессов образования зрелых молекул РНК и белков в клетке. Включает ряд последовательных расщеплений молекулы-предшественника эндонуклеазой или протеиназами.

212. Психрофилы. Микроорганизмы, способные расти при температуре 0-5 °С.

213. Пурины. Один из двух типов азотистых оснований, входящих в со­став нуклеиновых кислот; к пуринам относятся аденин и гуанин. Вто­рой тип оснований - пиримидины; к ним относятся тимин, урацил, ци-тозин.

214. Реактор с механическим перемешиванием. Биореактор, в котором для равномерного распределения газа по всему объему используются мешалки.

215. Регуляторный белок. Белок, «включающий» или «выключающий» транскрипцию.

216. Рекомбинантная ДНК. Молекула ДНК, полученная объединением in vitro разнородных, вместе нигде в природе не существующих фраг­ментов ДНК.

217. Рекомбинантная плазмида. Плазмида, измененная методами ген­ной инженерии. Состоит из участков разных плазмид либо содержит сегменты ДНК других организмов.

218. Рекомбинантный белок. Белок, кодируемый клонированной рекомбинантной ДНК.

219. Ренатурация. Воссоединение цепей двухцепочечной ДНК, разо­шедшихся при денатурации.

220. Репликация. Процесс самовоспроизведения (синтеза) ДНК.

221. Репрессия. Один из альтернативных (наряду с индукцией) механиз­мов регуляции генов. Состоит в подавлении транскрипции или трансля­ции путем связывания белка-репрессора с опероном.

222. Репрессор. Белок, связывающийся с оператором или промотором данного гена и блокирующий связывание с этими элементами ДНК-полимеразы.

223. Рестриктаза, рестрицирующая эндонуклеаза. Бактериальный фермент, расщепляющий двухцепочечную молекулу ДНК в специфиче­ских сайтах.

224. Рестрикционная карта. Диаграмма расположения на молекуле ДНК сайтов узнавания рестриктазами.

225. Ретровирусы. Группа РНК-содержащих вирусов, содержащих об­ратную транскриптазу; синтезированная на РНК-матрице двухцепочечная ДНК может встраиваться в хромосому инфицированной этим виру­сом клетки.

226. Рибоза. Пятиуглеродный моносахарид; входит в состав РНК.

227. Рибозим. Молекула РНК, обладающая ферментативной активно­стью.

228. Рибонуклеиновая кислота, РНК. Нуклеиновая кислота, состоящая из рибонуклеотидов, у которых сахаром является рибоза, а одним из пиримидинов - урацил (вместо тимина).

229. Рибосома. Клеточная органелла, рибонуклеопротеидная частица, при участии которой осуществляется синтез белка (трансляция). Состо­ит из двух субчастиц, большой и малой.

230. Рибосомная РНК, рРНК. РНК, входящая в состав рибосом.

231. РНК-полимераза. Фермент, осуществляющий синтез РНК из рибонуклеозидтрифосфатов. Матрицей может служить ДНК или РНК, соот­ветствующие РНК-полимеразы называют ДНК- и РНК-зависимыми.

232. Сайт встраивания (клонирования). Специфический участок век­торной молекулы, в который встраивают фрагмент чужеродной ДНК.

233. Сайт рестрикции. Нуклеотидная последовательность в молекуле ДНК, узнаваемая рестриктазой.

234. Самореплицирующийся элемент. Внехромосомная молекула нук­леиновой кислоты, способная к независимой от хромосомной ДНК-реп­ликации. Примером такого же элемента служит плазмида.

235. Секвенирующий гель. Длинная пластина полиэламидного геля, по­зволяющая проводить электрофоретическое разделение олиго- и полинуклеотидов, различающихся по длине всего на 1 нуклеотид.

236. Секреция. Выведение веществ из клетки во внешнюю среду.

237. Сигма-фактор. Бактериальный белок, обеспечивающий узнавание ДНК-полимеразой ее участка связывания в молекуле ДНК и инициацию транскрипции.

238. Сигнальная последовательность. Нуклеотидная последователь­ность в гене, служащая местом связывания белка (фактора транскрип­ции), который регулирует транскрипцию.

239. Сигнальный пептид, сигнальная последовательность, лидерный пептид. TV-концевой участок белковой молекулы длиной 15-30 амино­кислот, обеспечивающий секрецию белка. После секреции этот участок отщепляется от белковой молекулы.

240. Симбиоз. Сосуществование разных организмов, при котором каж­дый из них выполняет свои функции. В некоторых случаях взаимовы­годно.

241. Система комплемента. Серия последовательных процессов акти­вации комплемента (сложного белкового комплекса сыворотки крови) и ферментативных реакций, запускаемая в ответ на образование комплек­са антиген-антитело.

242. Соматическая клетка. Любая неполовая клетка многоклеточного организма.

243. Сплайсинг. Вырезание из предшественника мРНК интронов и ковалентное соединение экзонов с образованием зрелых молекул мРНК.

244. Стационарное состояние. Состояние непрерывного процесса ферментации, при котором число клеток, удаляемых из ферментера и поступающих в него, одинаково.

245. Стволовые клетки. Митотически активные стволовые клетки, в ре­зультате деления которых в многоклеточном организме происходит за­мещение погибших клеток в многоклеточном организме.

246. Структурный ген. Ген, кодирующий какой-либо белок.

247. Ступенчатый разрыв. Разрезание двухцепочковой ДНК, при кото­ром разрывы в комплементарных цепях располагаются не строго один напротив другого, а немного смещены.

248. Субклонирование. Перенос части уже клонированной молекулы ДНК в другой клонирующий вектор.

249. Субстрат. Вещество, превращение которого катализируется спе­цифическим ферментом.

250. Субъединичная вакцина. Вакцина, содержащая лишь отдельные компоненты патогенного микроорганизма.

251. Супрессия. Восстановление утраченной генетической функции, обусловленное подавлением эффекта одной мутации под действием второй.

252. Тандемный повтор. Нуклеотидная последовательность, состоящая из нескольких одинаковых элементов, соединенных «голова к хвосту».

253. Терминация. Остановка синтеза макромолекулы.

254. Терминирующий кодон. Кодон, определяющий окончание (терминацию) синтеза полинуклеотидной цепи.

255. Тимин. Пиримидиновое основание; одно из четырех азотистых ос­нований, входящих в состав ДНК.

256. Тканевой активатор плазминогена. Белок, участвующий в разру­шении сгустков крови.

257. Т-клетки. Лимфоциты, играющие ключевую роль в иммунном от­вете.

258. Т_н-лимфоциты, Т-хелперы. Т-лимфоциты, играющие основную роль в узнавании чужеродного антигена.

259. Трансгенный организм. Организм, геном которого содержит чуже­родный генетический материал, включенный методами генной инже­нерии.

260. Трансгеноз. Введение чужеродного гена в растительную или жи­вотную клетку и его передача в ряду поколений.

261. Транскрипция. Процесс синтеза РНК, катализируемый РНК-полимеразой, в котором в качестве матрицы используется одна из цепей ДНК.

262. Транслокация. 1. Хромосомная перестройка, заключающаяся в пе­реносе участка хромосомы в новое положение на той же или на другой хромосоме или в переносе целой хромосомы на другую хромосому. 2. Перемещение молекулы мРНК во время трансляции на один кодон.

263. Трансляция. Синтез полипептидной цепи рибосомой с использова­нием в качестве матрицы мРНК.

264. Транпозаза. Фермент, участвующий в транспозиции (перемещении из одного сайта в другой) некоторых мобильных генетических элементов.

265. Транспортная РНК, тРНК. Молекула РНК, выступающая в роли адаптора при специфическом переносе аминокислот к растущей поли­пептидной цепи в процессе трансляции.

266. Трансфекция. Искусственное введение в эукариотичиские клетки изолированных молекул ДНК.

267. Трансформация. 1. Перенос генетической информации в бактери­альные клетки с участием плазмид или без них, но всегда - без участия вирусов. 2. Превращение нормальных клеток животных в опухолевые.

268. Тупой конец. Конец двухцепочечной молекулы ДНК, у которого не выступает ни одна из цепей.

269. Урацил. Пиримидиновое основание; одно из четырех азотистых ос­нований, входящих в состав РНК.

270. Устойчивые клеточные линии. Культуры клеток, способные к не­ограниченному росту in vitro. Получаются из перевиваемых клеточных культур, часть клеток которых приобретают селективные преимущества и обладают повышенной скоростью роста.

271. Фактор транскрипции. Белок, помогающий РНК-полимеразе пройти все этапы транскрипции и обеспечивающий избирательность этого процесса.

272. Фенотип. Совокупность всех признаков особи, формирующаяся в процессе взаимодействия ее генотипа и внешней среды.

273. Ферментация. В промышленной микробиологии - крупномас­штабное культивирование микроорганизмов в специальных емкостях (ферментерах, биореакторах).

274. Хромосома. Структура, основу которой составляет конденсирован­ная молекула ДНК; носитель генетической информации. Хромосома способна к воспроизведению с сохранением структурно-функцио­нальной индивидуальности в ряду поколений. У эукариот находится в ядре клетки, у прокариот - непосредственно в цитоплазме.

275. Хромосомный сайт интеграции. Место в хромосоме, куда может встроиться чужеродная ДНК, часто без всяких последствий для орга­низма-хозяина.

276. Центрифугирование в градиенте плотности сахарозы. Метод разделения макромолекул по форме и размеру, основанный на различии их коэффициентов седиментации.

277. Цитозин. Одно из четырех азотистых оснований, входящее в состав ДНК и РНК.

278. Цитокинины. Растительные гормоны, индуцирующие деление клеток.

279. Частота трансформации. Доля клеток в клеточной популяции, получивших чужеродную ДНК; выражается числом трансформантов к общему числу клеток.

280. Челночный вектор. Плазмидная ДНК, способная реплицироваться в клетках двух разных типов (например, E.coli и клетках дрожжей).

281. Штамм. Культура генетически однородных микроорганизмов.

282. Экзогенная ДНК. ДНК, выделенная из организма-донора и встро­енная в вектор или хромосомную ДНК организма-хозяина; называется также чужеродной и гетерологичной ДНК.

283. Экзон. Участок гена, входящий в состав первичного транскрипта, который остается в нем после процессинга (вырезание интронов). Вме­сте с другими экзонами образует зрелую мРНК.

284. Экспрессирующий вектор. Плазмидный вектор, сконструирован­ный таким образом, чтобы клонированный ген экспрессировался только в определенной фазе клеточного цикла и только в течение определенно­го времени. Для этого в плазмиду встраивают сильный регулируемый промотор.

285. Экспрессия. Транскрипция и трансляция гена.

286. Электропорация. Образование пор в клеточных мембранах под действием электрического тока. Через эти поры в клетки проникает чу­жеродная ДНК.

287. Электрофорез. Метод разделения заряженных молекул (ДНК, РНК или белков), основанный на разной скорости их перемещения в элек­трическом поле.

288. Элонгация. Последовательное присоединение мономеров к поли­мерной цепи.

289. Эндонуклеаза. Фермент, гидролизующий внутренние фосфодиэфирные связи и расщепляющий молекулы ДНК и РНК. Эндонуклеазы участвуют в рекомбинации, репарации и рестрикции; в последнем слу­чае называются рестриктазами (рестрицирующими эндонуклеазами).

290. Эндотоксин. Токсин, не выделяемый клеткой в окружающую сре­ду, а входящий в состав клеточной стенки; многие эндотоксины выра­батываются грамотрицательными бактериями и вызывают воспаление.

291. Эрлифтный биореактор. Цилиндрический биореактор, в котором перемешивание осуществляется потоком газа, подаваемого снизу.

292. Эукариоты. Организмы, у которых: 1) имеется ядро, где содержат­ся хромосомы; 2) в цитоплазме присутствуют различные органеллы -митохондрии, хлоропласта и т.д. К эукариотам относятся животные, растения, грибы, некоторые водоросли.

293. «Эффект свидетеля». Уничтожение немодифицированных опухо­левых клеток цитотоксичным продуктом, синтезируемым соседними генетически трансформированными клетками.

294. Эффектор. Небольшая молекула, связывающаяся с репрессором или ферментом и приводящая к их ингибированию или активации.

295. Эффекторные клетки. Клетки иммунной системы, разрушающие антигены.

 

Докт.мед. наук, профессор В.В. Россихин

 

Для студентов-слушателей курса «ВСТУП до ФАХУ»