В настоящее время существует 2 типа названий ферментов: рабочее, или тривиальное и систематическое.
Рабочее название фермента простое и чаще употребляемое. Оно складывается из названия субстрата, типа катализируемой реакции и окончания –аза.
Например:
Систематическое название фермента более сложное.
Лекция №2
Классификация ферментов
Все ферменты разделены на 6 классов:
1. Оксидоредуктазы
2. Трансферазы
3. Гидролазы
4. Лиазы
5. Изомеразы
6. Лигазы (синтетазы)
Оксидоредуктазы – это ферменты, которые катализируют окислительно-восстановительные реакции.
I. Окисление субстрата. Окисление субстрата возможно:
1. Отщеплением от субстрата атомов водорода
Акцептором атомов водорода могут быть:
a) Коферменты – НАД+ или ФАД (редко НАДФ+). В данном случае фермент носит название «дегидрогеназа».
|
b) Кислород (О2). В данном случае фермент называется «оксидаза» и в результате реакции образуется перекись водорода.
2. Присоединение к субстрату атомов кислорода. В данном случае фермент носит название «оксигеназа». Если к молекуле субстрата присоединяется один атом кислорода, то фермент называется «монооксигеназа», если два, то «диоксигеназа».
Например:
II. Восстановление субстрата. Восстановление субстрата возможно путем присоединения к нему водорода (Н2). Донором водорода чащевсего выступает НАДФН2.
Трансферазы
Трансферазы – это ферменты, которые катализируют реакции переноса различных групп от одного вещества (донора) к другому (акцептору). В организме осуществляется перенос следующих групп: метильных, ацетильных, ацильных, фосфорных и т.д. Рабочее название фермента складывается по принципу: акцептор + переносимая группа + трансфераза.
Например:
Трансферазы, которые катализируют реакции переноса фосфорных групп принято называть киназами. Рабочее название киназ складывается из названия акцептора + термин «киназа». Донором фосфатной группы является АТФ.
Например:
Гидролазы
Гидролазы – это ферменты, которые катализируют реакции разрыва связей в субстратах с присоединением воды. Рабочее название фермента в этом классе складывается из названиясубстрата + окончание аза
|
Все пищеварительные ферменты и ферменты лизосом являются гидролазами. В этом классе много исторически сложившихся или тривиальных названий. Такие названия не подчиняются правилам «Классификации и номенклатуры ферментов». Например, пепсин, трипсин, гастриксин и т.д.
Лиазы
Лиазы – это ферменты, катализирующие реакции разрыва связей в субстратах путем негидролитического отщепления различных групп (СО2, NH2, Н2О и др.) или присоединения воды по месту двойной связи. Названия ферментов складываются следующим образом: субстрат + отщепляемая или присоединяемая группа + окончание аза
1. Декарбоксилазы – это ферменты, катализирующие отщепление СО2 от субстрата
|
|
2. Гидратазы – это ферменты, катализирующие присоединение Н2О к субстрату.
|
|
|
3. Синтазы – это ферменты, катализирующие реакции синтеза без участия АТФ (за счет энергии субстрата)
4. Альдолазы – это ферменты, катализирующие разрыв связей в субстрате, при котором один из продуктов реакции обязательно является альдегидом.
Изомеразы
Изомеразы – это ферменты, катализирующие реакции изомеризации, происходящие в пределах одной молекулы. В зависимости от вида изомерии ферментам дают соответствующие названия: рацемазы – катализируют превращения стереоизомеров, эпимеразы – эпимеров, таутомеразы – таутомеров. Мутазы катализируют реакции переноса функциональных групп в пределах одной молекулы. Название этих ферментов складываются следующим образом: название субстрата + название переносимой группы + мутаза.
Некоторые ферменты имеют название изомеразы (например, при цис – транс изомерии).
Лигазы
Лигазы – это ферменты, катализирующие синтетические реакции, которые происходят с участием энергии АТФ или др. нуклеозидтрифосфатов.
|
|
Название фермента складывается следующим образом: продукт реакции + синтетаза.
К этому классу относят карбоксилазы. Присоединение карбоксильной группы к субстрату происходит с затратой энергии АТФ. Название фермента будет состоять из названии исходного субстрата + термин «карбокилаза»
|
|