Вопросы к контрольной работе № 1:
- Нуклеиновые кислоты, состав, свойства. Правила Чаргаффа
- Формы ДНК, их основные параметры
- Триплексные и квадруплексные спирали, образование шпилек
- Суперспираль ДНК, её параметры, особенности
- Топоизомеразы I и II. Механизм действия
- Репликация ДНК: репликативные ДНК-полимеразы, общие характеристики полимераз
- Домены ДНК-полимеразы. Их функции
- Холоэнзим ДНК-полимеразы III – компоненты, их функции
- Ведущая и отстающая цепи – особенности процессинга.
- Инициация репликации у прокариот. oriC, DnaA, DnaB, SSB
- Общие чертырепликации у эукариот и прокариот
- PCNA – функция
- Процессинг фрагментов Оказаки у эукариот. РНКаза H и FEN1
- Компоненты репликационной машины эукариот: DNA pol α + primase; DNA pol δ and ε, PCNA, RFC, RFA
- Инициация репликациии у эукариот: где она начинается
- Инициация репликациии у эукариот: факторы, участвующие в инициации репликации
- Инициация репликациии у эукариот: последовательность событий
- Факторы Cdt1 и Cdc6 – функция в сборке пререпликативного комплекса
- Тайминг репликации (ранние и поздние ori, активные имолчащие гены)
- Когезины: функция и их процессинг (механизм удаления) в анафазе
- Что такое клеточный цикл
- Фазы клеточного цикла
- Фазы митоза
- Что такое «сверочные» точки (Checkpoints)? Опишите их
- Понятие «циклин», CDK, активные сайты CDK (сайты фосфориллирования)
- Ингибиторы комплекса «циклин-CDK». p27: механизм действия
- Транзиция от метафазы к анафазе. Комплекс APC/C, механизм деградации М-циклинов
- События в S-фазе. Сборка пререпликативного комплекса.
- Механизм предотвращения повторной активации preRC в S-фазе
- Конденсины. Их активация и функция
- Митотическое веретено: структурный состав центросомы, механизм дупликации центросом
- Кинетохор: структура
- Митотическое веретено: основные моторные белки
- Митотическое веретено: механизм захвата хромосом микротрубочками
- Механизм обеспечения би-ориентации хромосом
- Силы, действующие на веретено
- Расхождение сестринских хроматид, проверочная точка сборки веретена
- Телофаза. Цитокинез. Бороздка дробления. Механизм образования контрактильного кольца
- Ассиметрично делящиеся клетки, пример
- Образование синцития на примере оплодотворенного яйца дрозофилы
- Мейоз: образование хиазм
- Синаптонемальный комплекс
- Фазы профазы 1 мейоза
- Схема расхождения гомологов и хроматид в мейозе.
- Особенности удаления когезинов в мейозе 1 и 2
- Ошибки мейоза
- Митогены, ростовые факторы и факторы выживания. Пример активации Ras-каскада ростовым фактором
- Белок pRb: механизм действия
- Киназы ATR и ATM
- Белок p53 – его мишени
- Фосфоинозитол-3 киназа – механизм активации
- Причины появления повреждений в ДНК
- Апуринизация, дезаминирование, образование тиминовых димеров
- Пути репарации ДНК: BER и NER, их механизмы (эукариотические клетки)
- Исправление ошибок репликации (mismatch repair) в прокариотических клетках. Система белков Mut
- Mismatch repair у эукариот: белки MSH
- Микросателлитная нестабильность. Проскальзывание цепи
- Обход препятствия посредством смены матричных цепей
- Черезблоковые (translesion) ДНК-полимеразы: механизм работы у прокариот
- SOS-репарация (репарация двунитевых разрывов). Негомологичное соединение концов (NHEJ). Белки Ku70/80, MRN комплекс, DNA-PKcs
- SOS-репарация (репарация двунитевых разрывов). Гомологичная рекомбинация. Механизм
- Потеря гетерозиготности
- Белки BRCA 1 и 2
- Структуры Холидея, их особенности (количество на одну хромосому). Миграция ветвей, белки Ruv
- Кроссинговер и генная конверсия
- Транспозоны. Виды транспозонов.
- Транспозоны «только ДНК». Механизм транспозиции «вырезать-и-вставить»
- Механизм интеграции ретровирусов в ДНК клеток хозяина
- Ретровирус-подобные ретротранспозоны
- Неретровирусные ретротранспозоны: элементы LINE и SINE
- Консервативная сайт-специфическая рекомбинация (КССР): механизм
- Использование КССР для включения/выключения генов
- Особенности распределения генов у эукариот
- Свойства генома человека
- Нуклеосома: состав, свойства
- Особенности гистонных белков. Модификация N-концов гистонов. Гистоновый код
- Убиквитин, SUMO, изопептидная связь
- Хроматин-ремоделирующий комплекс. Динамичная структура нуклеосомы.
- Гистоновые шапероны
- Гетеро- и эухроматин. Эффект положения гена. Самораспространение гетерохроматина, наследование распределения гетерохроматина клеточными клонами
81. Гетеро- и эухроматин. Эффект положения гена. Самораспространение гетерохроматина, наследование распределения гетерохроматина клеточными клонами.
82. РНК-полимеразы эукариот. Регуляция транскрипции полимеразой II.
83. Цис- и трансрегуляция транскрипции.
84. Базальная транскрипция и её факторы. TBP и TAF факторы.
85. Узнавание ДНК фактором TBP.
86. Ковалентная модификация факторов транскрипции.
87. Фосфорилирование субъединиы РНК-полимеразы II и элонгация транскрипции.
88. Белки - активаторы транскрипции
89. Типы доменов, узнающих регуляторные цис-действующие элементы.
90. Коактиваторы и корепрессоры Энхансеры и энхансеосома.
91. Принцип “дальнодействия” в регуляции транскрипции. Локус-контролирующие районы и "инсуляторы".
92. Полимеразы I и III. Особенности структуры промоторов генов, транскрибируемых с помощью этих полимераз.
93. Процессинг РНК. Кепирование, сплайсинг и полиаденилирование транскриптов, синтезируемых полимеразой II.
94. Механизмы сплайсинга. Роль малых ядерных РНК и белковых факторов.
95. Альтернативный сплайсинг. Энхансеры сплайсинга. Каскады альтернативного сплайсинга. Биологическая роль альтернативного сплайсинга, примеры.
96. Роль белков, связывающихся с РНК-полимеразой на промоторе, в определении специфичности сплайсинга.
97. Сплайсинг и его роль в определении специфичности функционирования мРНК в цитоплазме.
98. “Контроль качества” пре-мРНК в ядре. Ядерные поры.
99. Транскрипционные факторы как морфогены в развитии многоклеточных организмов.
100. Понятие о позиционной информации. Механизмы возникновения пространственно ограниченных морфогенетических градиентов факторов транскрипции.
101. Особенности структуры промоторов генов, ответственных за сегментную экспрессию белков-морфогенов в развитии дрозофилы.
102. Поток генетической информации ДНК→РНК→Белок.
103. Кодирующие и некодирующие РНК. Первичная, вторичная и третичная структура РНК.
104. А-форма двойной спирали РНК.
105. Тетрапетли, псевдоузлы и тройные взаимодействия.
106. Спираль-спиральные взаимодействия, формирование крупных доменов.
107.Структуры тРНК и рРНК.
