Причины сепаратизма многообразны.

Рассмотрим их подробнее.

1) Экономико-географические факторы. Стремление более развитых регионов отделиться от отсталых. Например, Лига Севера в Италии, радикальные партии Каталонии. Часто бедствующие регионы тоже охвачены сепаратизмом. Их сообщества надеются, что в отдельном государстве будут жить лучше (Косово в Югославии, тамильские районы в Шри-Ланка, южные провинции Судана и многие другие).

2) Расовые факторы. Например, сепаратизм белого меньшинства в ЮАР, движения индейцев в Перу и Колумбии.

3) Этнические факторы. Стремление получить автономию или расширить её, добиться статуса независимого государства. Это самая распространённая группа причин. Примеры: Страна Басков в Испании, северо-восточные штаты Индии, Ачех в Индонезии, Абхазия и Южная Осетия в Грузии, восточные районы Демократической Республики Конго и др. Разновидность этносепаратизма — ирредентизм, т.е. стремление этноса воссоединиться, разрушая былые государственные границы либо перейдя в состав соседнего государства. Например, проект «Великой Албании» посягает на земли Югославии, Македонии и Греции. Независимость Курдистана потребовала бы перекройки границ Турции, Ирака, Ирана и Сирии. В 1973–1974 гг. южная часть Кипра пыталась воссоединиться с Грецией, а северная — с Турцией.

4) Религиозные факторы. Классический пример — Ливан, где доминирующее арабское население расколото на массу территориально замкнутых общин. В Югославии, как и в Таджикистане, религиозный фактор преобладал над языковым.

5) Религиозно-этнические факторы порождают борьбу разных идентичностей, в результате чего может усиливаться непринятие субъективно «чужого» государства. Так, в Ольстере ирландцы-католики стремятся воссоединиться с Ирландской Республикой, а мусульмане Кашмира — с Пакистаном. Религиозный и этнический факторы неразрывно сплетены во многих странах Африки: в кровопролитных войнах за раздел Судана, Сомали, Конго, Анголы, Либерии и др.

6) Внутриполитические факторы. Стремление региональных элит к власти, партийный и идеологический раскол страны (КНР и Тайвань, Северная и Южная Корея, ГДР и ФРГ).

7) Внешнеполитические факторы. Поддержка сепаратистов со стороны «сверхдержав» и более сильных соседних стран. Мотивы поддержки разнообразны — ослабить конкурента, овладеть геополитически важными районами и экономикой отделяемых местностей, нажиться на торговле оружием и наёмниками с участниками конфликта. Примеры внешнего контроля над зонами сепаратизма: Панама в начале ХХ в., ныне — Косово.

В 1886 году эта конституция была заменена новой, более консервативной и централистской; штаты были преобразованы в департаменты, а страна получила название Республика Колумбия. Однако меры по централизации страны только ухудшили политическую ситуацию, и многие департаменты стали выражать недовольство центральным правительством. Кроме того, неудачная экономическая политика консерваторов, выпуск ими в большом количестве бумажных денег ухудшили экономическое положение и вызвали в стране высокую инфляцию. Президент Мануэль Антонио Санклементе был слишком стар и болен, чтобы удерживать власть.

8) Фактор родоплеменной обособленности в традиционных обществах Тропической Африки и Океании (трайбализм). Подчас затруднительно само государственное строительство, так как архаичные сообщества стремятся монополизировать власть и распределять её по родоплеменному, земляческому принципу. Таковы конфликты на Фиджи, Соломоновых островах, в Папуа Новой Гвинее, Коморских островах, Сомали.

Развитию сепаратизма могут благоприятствовать географические условия: — неравномерность развития территорий страны; — слабая территориальная интегрированность: затрудненные транспортные и информационные коммуникации, анклавы, притяжение соседних стран; — компактное размещение сторонников сецессии; — «реликтовые» внутренние границы: сепаратисты сознательно культивируют чувство ненависти к «оккупантам» и желание территориального реванша, создают картографию своих притязаний к соседям, которая служит важным средством политической мобилизации.

На постсоветском пространстве к числу сепаратистских формально и народно-освободительных фактически относятся движения в Абхазии, Южной Осетии, Нагорном Карабахе, Приднестровье, Гагаузии, Чечне, Дагестане, Ингушетии, Татарстане, Туве, так как имевшие исторический опыт государственности данные регионы были включены в состав союзных республик СССР, ставшими независимыми, без воли на то их населения, однако ООН это в расчёт не принимает. В первых 4-х из них (а также ранее в Гагаузии, Татарстане, Крыму в 1991—1994 гг., Чечне (Ичкерии) в 1991—1999 гг., и в 2014 г. на востоке Украины) сепаратизм достиг относительно больших успехов, организовав непризнанные и частично-признанные государства так же, как в остальном мире это сделали Косово, Сомалиленд, Северный Кипр, Вазиристан. Столкнувшаяся с проявлениями реального сепаратизма (помимо менее организованного в других регионах) Россия контроль над территорией, на которую претендовала Чеченская Республика Ичкерия, восстановила силовым путёмв 2000 году, а контроль над Татарстаном, ранее также провозгласившим полный суверенитет и международную субъектность и также не подписавшим федеративный договор, — в результате договорно-объединительного процесса в 1994 году и (окончательно) после приведения республиканского законодательства в соответствие федеральному в 1999—2000 годах. В результате сепаратизма на Украине (менее выраженного в конфессионально-отличных западных регионах и в русино-венгерском Закарпатье) в 2014 году преимущественно руссконаселённая Автономная Республика Крым провозгласила независимость, после чего была признана Россией и вошла в её состав, а также в значительной мере русско-русскоязычных восточных регионах возникли самопровозглашённые государственные образования Донецкая и Луганская народные республики, против которых были предприняты силовые контрмеры. В Грузии сепаратисты, поддержанные и признанные Россией (Абхазия и Южная Осетия) достигли своей цели (сецессии-отделения) и стали частично-признанными государствами, а менее активные прочие остались под контролем центральной власти. В Азербайджане отделение ставшего непризнанным государством де-факто Нагорного Карабаха было поддержано (в том числе военным путём) Арменией, самопровозглашённая Талыш-Муганская республика была подавлена силовым путём и расформирована, а ирридентисткий сепаратизм лезгин не смог достичь автономии (как и в России, где они имеют б́ольшую численность и историческую территорию). В Узбекистане также имеется некоторый сепаратистский потенциал. Во-первых, это автономная республика Каракалпакстан, на две трети населённая этнически близкими каракалпаками и казахами. Во-вторых, значительное таджикское население Самарканда и Бухары.