Согласно Налоговому кодексу РФ вычеты предоставляются на основании счетов-фактур (п. 1 ст. 172).
По данному вопросу есть две точки зрения.
Официальной позиции нет.
Есть примеры судебных решений, в которых указывается на возможность применения вычета, если счета-фактуры отсутствуют по объективным причинам. Аналогичной позиции придерживается и автор.
В то же время есть примеры противоположных судебных решений.
Подробнее см. документы
Позиция 1. Право на вычет есть
Постановление ФАС Восточно-Сибирского округа от 12.04.2006 N А19-17774/05-20-Ф02-1512/06-С1 по делу N А19-17774/05-20
Суд указал, что отсутствие по объективным причинам в момент проведения налоговой проверки счетов-фактур (они были изъяты в рамках уголовного дела и утеряны органами внутренних дел) не может свидетельствовать об отсутствии у налогоплательщика права на применение налоговых вычетов в соответствующих налоговых периодах.
Аналогичные выводы содержит...
Постановление ФАС Поволжского округа от 17.02.2006 по делу N А12-22360/04-С50
Постановление ФАС Восточно-Сибирского округа от 10.05.2006 N А19-3677/05-5-Ф02-2166/06-С1 по делу N А19-3677/05-5
Суд при рассмотрении дела установил, что предприниматель по не зависящим от него причинам при проведении выездной налоговой проверки не смог представить налоговому органу документы для подтверждения налоговых вычетов, заявленных им в соответствующих налоговых декларациях, так как они были похищены. Это, по мнению суда, дает налоговому органу право определить НДС расчетным путем. Но при этом инспекция обязана определить и сумму вычета.
Аналогичные выводы содержит...
Консультация эксперта, 2006
Позиция 2. Права на вычет нет
Постановление ФАС Уральского округа от 19.04.2006 N Ф09-2887/06-С2 по делу N А50-655/05
Суд указал, что условием, которое определяет право налогоплательщика на вычет сумм НДС по приобретенным товарам (работам, услугам), является, в частности, наличие счетов-фактур (п. 1 ст. 169 НК РФ), выставленных поставщиками с выделенной отдельной строкой суммой налога. При несоблюдении указанного условия налогоплательщик не может реализовать право на применение вычетов по НДС. При этом на вывод суда не повлиял тот факт, что счета-фактуры были изъяты органами внутренних дел в рамках расследования уголовного дела.
Постановление ФАС Уральского округа от 16.03.2006 N Ф09-188/06-С2 по делу N А47-15071/04
Суд указал следующее: поскольку документы, подтверждающие право на налоговый вычет по НДС (ст. ст. 169, 171, 172 НК РФ), обществом не представлены, требование о представлении запрашиваемых документов им не исполнено, доначисление НДС правомерно. Ссылку на невозможность представления документов, свидетельствующих о наличии права на налоговый вычет, ввиду их утраты в результате дорожно-транспортного происшествия суд не принял.