Налоговый кодекс РФ не содержит разъяснений по данному вопросу.
Официальная позиция заключается в том, что документом, подтверждающим льготу при сдаче помещений в аренду филиалу иностранной организации, может являться выписка из реестра филиалов и представительств международных и иностранных некоммерческих организаций. Кроме того, льготу можно также подтверждать и копией свидетельства о внесении в Сводный государственный реестр аккредитованных на территории Российской Федерации представительств иностранных компаний (либо копией разрешения на открытие представительства иностранной организации), а также договором аренды, содержащим указание на то, что арендуемое помещение предоставляется иностранному арендатору. Есть пример судебного решения и работа автора, подтверждающие данный подход.
Подробнее см. документы
Письмо Минфина России от 25.10.2010 N 03-07-07/69
Ведомство разъяснило, что применение льготы по п. 1 ст. 149 НК РФ при сдаче в аренду помещений иностранной организации подтверждается копией свидетельства о внесении в сводный государственный реестр аккредитованных на территории Российской Федерации представительств иностранных компаний, выданного Государственной регистрационной палатой, а также договором аренды, заключенным с иностранной организацией.
Аналогичные выводы содержит...
Письмо УМНС России по г. Москве от 16.09.2004 N 24-08/60108
Письмо УМНС России по г. Москве от 21.06.2004 N 24-14/4/41004 "Рекомендации по проведению проверки правомерности предоставления освобождения от налогообложения в соответствии со статьей 149 НК РФ"
Письмо УМНС России по г. Москве от 18.06.2003 N 24-11/31591
Письмо УМНС России по г. Москве от 23.08.2002 N 24-11/38939
Консультация эксперта, 2008
Письмо Минфина России от 15.04.2010 N 03-07-08/112
Разъяснено, что применение льготы при сдаче помещения в аренду филиалу иностранной организации можно подтвердить выпиской из реестра филиалов и представительств международных и иностранных некоммерческих организаций, выданной Минюстом России. Форма выписки утверждена Приказом Минюста России от 25.03.2009 N 84.
Письмо Минфина России от 04.03.2004 N 04-03-11/31
Финансовое ведомство разъясняет, что для подтверждения права на получение освобождения от обложения НДС в налоговые органы можно представить копию свидетельства о внесении в сводный государственный реестр аккредитованных на территории РФ представительств иностранных компаний, выданного Государственной регистрационной палатой, а в отношении физических лиц - копию документа, подтверждающего соответствующее гражданство иностранного физического лица.
Постановление ФАС Северо-Западного округа от 16.05.2006 N А56-29329/04
Суд указал, что налогоплательщик может использовать льготу по п. 1 ст. 149 НК РФ, только если подтвердит наличие аккредитации представительств иностранных компаний и филиалов иностранных юридических лиц на территории РФ. Поскольку общество представило выданное его арендатору Торгово-промышленной палатой РФ разрешение на открытие представительства на территории РФ, суд признал применение льготы правомерным.