Налоговый кодекс РФ не содержит разъяснений по данному вопросу.
По этому вопросу есть две точки зрения.
Согласно официальной позиции компенсация заказчиком командировочных расходов облагается НДС, несмотря на то что в заключенных договорах такие расходы могут указываться отдельно от стоимости выполняемых работ. Есть примеры судебных решений и работы авторов, подтверждающие данную точку зрения.
Противоположная точка зрения заключается в том, что суммы компенсации не облагаются НДС, так как при возмещении расходов не происходит реализации товаров (работ, услуг) и, соответственно, не возникает объекта налогообложения. Есть примеры судебных решений и работы авторов, подтверждающие данный вывод.
Подробнее см. документы
Позиция 1. Компенсация командировочных расходов облагается НДС
Письмо Минфина России от 02.03.2010 N 03-07-11/37
Финансовое ведомство разъясняет, что компенсация исполнителю услуги расходов, связанных с командировками сотрудников к месту расположения заказчика, должна включаться в налоговую базу по НДС.
Аналогичные выводы содержит...
Письмо Минфина России от 26.02.2010 N 03-07-11/37
Письмо Минфина России от 09.11.2009 N 03-07-11/288
Письмо Минфина России от 14.10.2009 N 03-07-11/253
Разъяснено, что компенсация командировочных расходов включается в налоговую базу по НДС, даже если по договору она не входит в стоимость услуг (работ).
Письмо Минфина России от 19.09.2003 N 04-03-11/75
Финансовое ведомство разъясняет: суммы компенсаций командировочных расходов, получаемые организацией, включаются в налоговую базу по НДС, несмотря на то что в договорах данные расходы указываются отдельно от стоимости выполняемых работ.
Аналогичные выводы содержит...
Консультация эксперта, 2007
Постановление ФАС Западно-Сибирского округа от 12.03.2009 N Ф04-1010/2009(961-А27-31), Ф04-1010/2009(962-А27-31) по делу N А27-5996/2008-6 (Определением ВАС РФ от 19.06.2009 N ВАС-7272/09 отказано в передаче данного дела в Президиум ВАС РФ)
Суд пришел к выводу, что предъявленные к оплате заказчику командировочные расходы работников подрядчика в рамках договоров подряда облагаются НДС на основании пп. 1 п. 1 ст. 146 НК РФ.
Постановление ФАС Московского округа от 05.09.2008 N КА-А40/8211-08 по делу N А40-28801/07-118-159
Суд пришел к выводу, что суммы командировочных расходов, компенсируемые заказчиком подрядчику, облагаются НДС. Это объясняется тем, что в силу ст. 709 ГК РФ командировочные расходы, понесенные подрядчиком в связи с исполнением договора и предъявленные заказчикам на основании соответствующих расчетов, включаются в цену подрядных работ, подлежащих оплате.
Статья: Издержки подрядчика, компенсируемые заказчиком ("Финансовые и бухгалтерские консультации", 2007, N 5)
По мнению автора, суммы, которые подрядчик получил в качестве компенсации командировочных расходов, облагаются по ставке, определяемой расчетным методом (18/118).
Консультация эксперта, 2006
Автор считает, что компенсация командировочных расходов включается в налоговую базу по НДС в соответствии со ст. 162 НК РФ.
Позиция 2. Компенсация командировочных расходов не облагается НДС
Постановление ФАС Волго-Вятского округа от 19.02.2007 по делу N А17-1843/5-2006 (Определением ВАС РФ от 14.06.2007 N 6950/07 отказано в передаче данного дела в Президиум ВАС РФ)
Суд установил, что при возмещении заказчиками налогоплательщику выплаченных работникам командировочных расходов не произошло передачи права собственности на товары (работы, услуги). Таким образом, денежные средства, которые общество получило в качестве компенсации командировочных расходов, объектом налогообложения по НДС не являются и не включаются в налоговую базу.
Постановление ФАС Восточно-Сибирского округа от 10.03.2006 N А33-20073/04-С6-Ф02-876/05-С1 по делу N А33-20073/04-С6
Суд пришел к следующему выводу: поскольку возмещение расходов по оплате проезда не входит в стоимость подрядных работ и не является выручкой предпринимателя, полученные от заказчика суммы он может квалифицировать как компенсационные и не включать в налоговую базу по НДС.
Постановление ФАС Северо-Западного округа от 25.08.2008 по делу N А42-7064/2007
Суд установил, что командировочные расходы, компенсируемые налогоплательщику контрагентом, не включались в стоимость услуг по договору. Следовательно, на данные суммы не начисляется НДС, так как они не являются объектом налогообложения.
Аналогичные выводы содержит...
Постановление ФАС Северо-Западного округа от 25.08.2008 по делу N А42-190/2008
Обзор: Новые документы для бухгалтера. Выпуск от 05.11.2009
Консультация эксперта, 2007
В работе автора содержится анализ позиции Минфина России и арбитражной практики по спорному вопросу обложения НДС компенсаций командировочных расходов. Автор предупреждает, что если исполнитель не включит в налоговую базу по НДС оплаченные заказчиком суммы командировочных расходов, то правомерность этого ему придется доказывать в суде.
