Ситуация актуальна для отношений, возникших до 2008 г.
Налоговый кодекс РФ не содержит разъяснений по данному вопросу.
По данному вопросу есть две точки зрения.
Официальная позиция налоговых органов заключается в том, что после применения упрощенной системы налогообложения организация сможет применять освобождение от уплаты НДС (ст. 145 НК РФ) не сразу, а после истечения трех последовательных календарных месяцев. Есть работа автора, в которой содержится аналогичная точка зрения.
Автор высказывает иное мнение: перейти на применение ст. 145 НК РФ можно сразу же после прекращения использования УСН. Есть решение, в котором суд признает право организации применять освобождение от уплаты НДС (ст. 145 НК РФ) сразу после возвращения с УСН.
Подробнее см. документы
Позиция 1. После применения УСН организация не может сразу начать применять освобождение от уплаты НДС
Письмо МНС России от 13.05.2004 N 03-1-08/1191/15@ "Свод писем по применению действующего законодательства по НДС за II полугодие 2003 года - I квартал 2004 года"
Налоговые органы разъясняют, что у лиц, применяющих упрощенную систему налогообложения, нет возможности представить все документы, которые необходимы для подтверждения права на освобождение. Связано это с тем, что налогоплательщики, применяющие УСН, не ведут книгу продаж и журнал полученных и выставленных счетов-фактур. Таким образом, освобождение от обязанностей плательщика НДС такие лица могут получить только по прошествии трех месяцев после утраты права на применение УСН.
Аналогичные выводы содержит...
Статья: Изменения порядка исчисления НДС с 2008 года ("Налоговая политика и практика", 2008, N 1)
Позиция 2. После применения УСН организация может сразу же начать применять освобождение от уплаты НДС
Постановление ФАС Западно-Сибирского округа от 17.10.2007 N Ф04-7264/2007(39334-А67-14) по делу N А67-2288/2007
Суд указал, что в ст. 145 НК РФ нет запрета на использование освобождения после применения УСН, и признал неправомерным отказ в применении освобождения, если нет выписки из книги продаж и копии журнала полученных и выставленных счетов-фактур. Эти документы отсутствовали у налогоплательщика, потому что он не обязан был их оформлять.
Консультация эксперта, 2007
Автор разъясняет, что ограничений для применения освобождения после перехода организации с УСН налоговым законодательством не установлено. При этом организация должна представить выписку из Книги учета доходов и расходов организаций и индивидуальных предпринимателей, применяющих УСН. В подтверждение данной точки зрения автор приводит примеры судебных решений.
