Федеральная служба по надзору в сфере транспорта осуществляет функции по контролю и надзору в сфере воздушного, морского (включая обеспечение безопасности мореплавания и порядка в морских рыбных портах), внутреннего водного, железнодорожного, автомобильного и городского электрического (включая метрополитен), промышленного транспорта и дорожного хозяйства, а также функции по техническому надзору за спортивными судами, и осуществляет свою деятельность непосредственно и через свои территориальные органы.
Федеральное агентство воздушного транспорта осуществляет функции по оказанию государственных услуг, управлению государственным имуществом и правоприменительные функции в сфере воздушного транспорта и гражданской части Единой системы организации воздушного движения.
Федеральное дорожное агентство осуществляет функции по оказанию государственных услуг, по управлению государственным имуществом и правоприменительные функции в сфере автомобильного транспорта и дорожного хозяйства.
На автомобильном транспорте и в дорожном хозяйстве существенный объем контрольно‑надзорных функций выполняется органами и подразделениями ГИБДД МВД.
Федеральное агентство железнодорожного транспорта осуществляет функции по оказанию государственных услуг, управлению государственным имуществом, а также правоприменительные функции в сфере железнодорожного транспорта.
Федеральное агентство морского и речного транспорта осуществляет функции по оказанию государственных услуг, по управлению государственным имуществом, а также правоприменительные функции в сфере морского и речного транспорта, в том числе в отношении морских рыбных портов, в целях развития транспортного комплекса; издание индивидуальных правовых актов в сфере деятельности; ведение реестров, регистров и кадастров.
Федеральное агентство геодезии и картографии осуществляет функции по оказанию государственных услуг и управлению государственным имуществом в сфере геодезической и картографической деятельности, а также наименований географических объектов.
В ведении Минтранса России находится Федеральная аэронавигационная служба. Она: 1) разрабатывает федеральные авиационные правила; 2) выдает: разрешения на транзитные полеты иностранных воздушных судов через воздушное пространство России; разрешения на выполнение разовых полетов; 3) оказывает государственные услуги по аэронавигационному обслуживанию пользователей воздушного пространства России; 4) организует единую систему авиационно‑космического поиска и спасания; 5) обеспечивает руководство функционированием Единой системы организации воздушного движения и т. д.
