Различают три основных этапа ферментативного катализа

 

1 этап.

 

Ориентировочная сорбция субстрата на активном центре фермента с образованием обратимого фермент-субстратного комплекса. На этом этапе происходит взаимодействие адсорбционного центра фермента с молекулой субстрата. При этом и субстрат подвергается конформационной перестройке. Кинетическая характеристика 1-го этапа ферментативного катализа - константа Михаэлиса (Км).

 

2 этап.

 

Химические превращения молекулы субстрата в составе фермент-субстратного комплекса с образованием комплекса фермента с химически преобразованным субстратом. На этом этапе разрываются одни ковалентные связи и возникают новые. Поэтому этот этап протекает значительно медленнее, чем 1-й и 3-й этапы. Именно скорость второго этапа определяет скорость всей ферментативной реакции в целом. Кинетическая характеристика 2-го этапа - максимальная скорость (Vmax).

 

3 этап.

 

Десорбция готового продукта из его комплекса с ферментом. Этот этап протекает легче, чем 2-й. Он, как и 2-й этап, тоже необратим. Исключение - обратимые ферментативные реакции.

 

4. Фермент сахараза относится к классу гидролаз. Фермент сахараза катализирует реакцию гидролитического расщепления дисахарида сахарозы с образованием глюкозы ифруктозы. Наличие конечного продукта реакции – глюкозы определяют спомощью реакции Троммера.

Ход работы. В 2 пробирки наливают по 1 мл раствора сахаразы (вытяжки из дрожжей). В 1-й пробирке раствор кипятят в течение 2-х минут, во2-й - оставляют без кипячения. Затем в обе пробирки добавляют по 2 мл сахарозы, перемешивают, оставляют при 37ºС. Через 10 минут с содержимымпробирки проводят качественную реакцию на глюкозу – реакцию Троммера.Под действием сахаразы в растворе появится глюкоза и фруктоза. Полученные результаты объясняют и делают вывод о зависимости активности фермента от температуры.

5. (ниже)

 

 

БИЛЕТ 15

В основу принятой классификации положен принцип – тип катализируемой реакции, который является специфичным для действия любого фермента. Этот принцип логично использовать в качестве основы для классификации и номенклатуры ферментов.Таким образом, тип катализируемой химической реакции в сочетании с названием субстрата (субстратов) служит основой для систематического наименования ферментов.

По этому принципу все ферменты делят на 6 классов.

1. Оксидоредуктазы — ускоряют реакции окисления — восстановления. Окисление протекает как процесс отнятия атомов Н (электронов) от субстрата, а восстановление — как присоединение атомов Н (электронов) к акцептору. Например, лактат: НАД+ оксидоредуктаза для лактатдегидрогеназы (ЛДГ).
2. Трансферазы — ускоряют реакции переноса функциональных групп и молекулярных остатков. Например: метил- и формилтрансферазы, ацетилтрансферазы, амино-трансферазы, фосфотрансферазы и др.
3. Гидролазы — ускоряют реакции гидролитического распада. К ним относятся: зстеразы – ферменты, катализирующие реакции гидролиза и синтеза сложных эфиров; гликозидазы, ускоряющие разрыв гликозидных связей; фосфатазы и пептидгидролазы, катализирующие гидролиз фосфоангидридных и пептидных связей; ами-дазы, ускоряющие разрыв амидных связей, отличных от пептидных, и др.
4. Лиазы — ускоряют негидролитическое отщепление от субстратов определенных групп атомов с образованием двойной связи (или присоединяют группы атомов по двойной связи). Например, фумарат-гидратаза (систематическое название «L-малат-гидролаза») катализирует обратимое отщепление молекулы воды от яблочной кислоты с образованием фумаровой кислоты. В эту же группу входят декарбоксилазы (карбокси-лиазы), амидин-лиазы и др.
5. Изомеразы — ускоряют пространственные или структурные перестройки в пределах одной молекулы. К этому же классу относят рацемазы и эпимеразы, действующие на амино- и оксикислоты, углеводы и их производные; внутримолекулярные оксидоредуктазы, катализирующие взаимопревращения альдоз и кетоз; внутримолекулярные трансферазы, переносящие ацильные, фосфорильные и другие группы, и т.д.

6. Лигазы — ускоряют реакции синтеза, сопряженные с распадом богатых энергией связей. В качестве примера можно назвать L-глутамат: аммиак лигазу (рекомендуемое сокращенное название «глутаминсинтета-за»), при участии которой из глутаминовой кислоты и аммиака в присутствии АТФ синтезируется глутамин.

2.Особую группу ферментов составляют надмолекулярные (или мульти-молекулярные) ферментные комплексы, в состав которых входят не субъединицы (в каталитическом отношении однотипные протомеры), а разные ферменты, катализирующие последовательные ступени превращения какого-либо субстрата. Отличительными особенностями подобных муль-тиферментных комплексов являются прочность ассоциации ферментов и определенная последовательность прохождения промежуточных стадий во времени, обусловленная порядком расположения каталитически активных (различных) белков в пространстве («путь» превращения в пространстве и времени). Типичными примерами подобных мультиферментных комплексов являются пируватдегидрогеназа и α-кетоглутаратдегидрогеназа, катализирующие соответственно окислительное декарбоксилирование пиро-виноградной и α-кетоглутаровой кислот в животных тканях (см. главу 10), и синтетаза высших жирных кислот (см. главу 11). Молекулярные массы этих комплексов в зависимости от источника их происхождения варьируют от 2,3•106 до 10•106. Ассоциация отдельных ферментов в единый недиссо-циирующий комплекс имеет определенный биологический смысл и ряд преимуществ. В частности, при этом резко сокращаются расстояния, на которые молекулы промежуточных продуктов должны перемещаться при действии изолированных ферментов. Ряд таких мультиферментных комплексов, иногда называемых ферментными ансамблями, структурно связан с какой-либо органеллой (рибосомы, митохондрии) или с биомембраной и составляет высокоорганизованные надмолекулярные системы, обеспечивающие жизненно важные функции, например тканевое дыхание (перенос электронов от субстратов к кислороду через систему дыхательных ферментов).

3. САХАРАЗА (инвертин), секретируемый железами тонкого кишечника фермент, который катализирует гидролиз сахарозы на составные части (глюкозу и фруктозу),относится к группе гидролаз. Чрезвычайно распространена в различных видах дрожжей и в других тайнобрачных и высших растениях; в животном организме находится в слизистой оболочке тонких кишок, а также вероятно в кишечном соке и в лейкоцитах;

Наличие конечного продукта реакции – глюкозы определяют с помощью реакции Троммера.

Ход работы. В 2 пробирки наливают по 1 мл раствора сахаразы (вытяжки из дрожжей). В 1-й пробирке раствор кипятят в течение 2-х минут, во2-й - оставляют без кипячения. Затем в обе пробирки добавляют по 2 мл сахарозы, перемешивают, оставляют при 37ºС. Через 10 минут с содержимым пробирки проводят качественную реакцию на глюкозу – реакцию Троммера Полученные результаты объясняют и делают вывод о зависимости активности фермента от температуры.

.4 К этой группе принадлежат ферменты, катализирующие окислительно-восстановительные реакции, происходящие при дыхании и брожении. К дегидразам относятся ферменты, катализирующие реакцию дегидрирования, т. е. отнятие водорода от какого-либо вещества.

В зависимости от природы акцептора водорода, которому восстановленные дегидразы способны передавать водород, они делятся на анаэробные и аэробные дегидразы.

Анаэробные дегидразы не могут отдавать водород, отнятый ими от окисляемого вещества, кислороду воздуха, а передают его другим акцепторам (флавиновым ферментам, цитохромной системе и др.). Иногда их называют первичными дегидразами.

По химической природе анаэробные дегидразы являются двухкомпонентными ферментами, состоят из белка и активной группы — кофермента, который раньше часто называли козимазой или кодегидразой I. Более правильно называть этот ко-фермент в соответствии с его химической структурой никотинамид-аденин-динуклеотид (сокращенно НАД). В состав кофермента входит витамин РР—амид никотиновой кислоты. Этот кофермент — исключительно реакционноспособная окислительно-восстановительная система, играющая важную роль в процессе спиртового и молочнокислого брожения.

Коферментом других анаэробных дегидраз является кодегидраза II (НАДФ—никотинамид-аденин-динуклеотид-фосфат). Анаэробные дегидразы окисляют (дегидрируют) самые разнообразные субстраты: молочную, яблочную и глютаминовую кислоты, глюкозу, различные углеводы и спирты. Специфичность их действия зависит от особенностей белка, с которым связан данный кофермент.

К группе аэробных дегидраз принадлежат ферменты, в состав активной группы которых входит витамин В2. Эти ферменты представляют собой соединение витамина с белком. Способность таких флавиновых ферментов отнимать водород от окисляемого вещества и передавать его другим соединениям или непосредственно кислороду связана с тем, что их активная группа легко подвергается обратимому окислению и восстановлению.

5.. Согласно этой теории, свободная энергия транспорта электронов в дыхательной цепи затрачивается на перенос из митохондрий через митохондриальную мембрану на ее наружную сторону ионов Н⁺. В результате на мембране возникает разность электрич. потенциалов и разность хим. активностей ионов Н⁺ (внутри митохондрий рН выше, чем снаружи). В сумме эти компоненты дают трансмембранную разность электрохимических потенциалов ионов водорода между матриксом митохондрий и внешней водной фазой, разделенными мембраной:

Райкин

где R -универсальная газовая постоянная, T -абсолютная температура, F- число Фарадея. Величина обычно составляет около 0,25 В, причем основная часть (0,15-0,20 В) представлена электрической составляющей . Энергия , выделяющаяся при движении протонов внутрь митохондрий по электрическому полю в сторону меньшей их концентрации (рис. 2, процесс 2), используется АТФ-синтетазой для синтеза АТФ. Т. обр., схему окислительное фосфорилирование, согласно этой концепции, можно представить в следующем виде:

Перенос электронов (дыхание) АТФ