Самая глубокая впадина Центральной Азии -- Турфанская (--154 м).

Высокогорная система Восточного Тянь-Шаня подвергается влиянию воздушных масс различных направлений. В западную часть ее еще поступают влажные атлантические ветры, восточная находится под влиянием сухих воздушных масс центральноазиатских пустынь. Поэтому разные части Восточного Тянь-Шаня в климатическом отношении существенно различаются. Зима в горах довольно продолжительная и холодная, лето короткое и нежаркое. Количество осадков увеличивается с высотой, а также по направлению к западу и северу; в высокогорьях формируются мощные ледники, длиной до 30 км. Основными узлами оледенения являются Ирен-Хабирга и Богдо-Ула. Котловины отличаются крайней континентальностью климата. Например, в Турфанской впадине отмечался зимний минимум --40 º, летний максимум +51 °С. Западная часть Восточного Тянь-Шаня лучше обводнена. Северные склоны гор здесь прорезаны многочисленными, но короткими реками, южные почти безводны. В западной части северные хребты от подножия до высоты 1600 м покрыты степными формациями на каштановых почвах. Здесь растут ковыль, типчак, солянки. До высоты 2700 м произрастают хвойные леса на горных подзолистых почвах. Видовой состав лесов однообразен, доминирует тянь-шаньская ель. Южные склоны гор лишены лесной растительности, она встречается лишь небольшими пятнами по долинам рек (ильм, тополь). На высоте 2700--3600 м распространены альпийские луга. В их составе преобладают отдельные виды злаков (костер, мятлик), ксерофильные полыни, осоки, а также гигантские зонтичные.

Ландшафты восточной части ‑ типичные полупустыни. Лишь на высоте 2000--2500 м встречаются полынно-злаковые степи, сменяющиеся вверх по склонам кобрезиевыми лугами, характерными только для осевой зоны гор. Предгорные равнины заняты солянковыми пустынями.

Природные ресурсы Восточного Тянь-Шаня изучены недостаточно. Известны месторождения нефти, урановых руд, выходы горячих источников. Однако освоению полезных ископаемых мешает удаленность от основных экономических центров Китая. Население сосредоточено в оазисах и занимается земледелием, в горах развито пастбищное скотоводство.

Кашгария. Это одна из величайших бессточных впадин Центральной Азии, несколько напоминающая по структуре Джунгарию, но отличающаяся от нее большей географической изоляцией. Основную часть ее территории занимает песчаная пустыня Такла-Макан, обрамленная предгорными шлейфами, тянущимися вдоль Куньлуня, Кашгарского хребта и Восточного Тянь-Шаня. В рельефе выражены древние погребенные долины рек Хотан, Яркенд и Черчен. Абсолютные высоты составляют 800--1400 м; территория наклонена к северо-востоку.

Поверхность Кашгарии сложена четвертичными, преимущественно аллювиальными отложениями, почти полностью перекрывшими ее древнее основание. Лишь на северо-западе возвышается несколько кряжей, сложенных коренными породами (хребет Музтаг).

Покровные отложения отличаются по литологическому составу. Значительная территория покрыта сыпучими древнеаллювиальными песками, где ярко выражены формы эолового рельефа. Так, в центральной и северо-восточной частях пустыни, известных под названием Кумтаг, преобладают грядовые пески; в западной части (Белькум) господствуют барханные образования, достигающие местами 150 м. Самыми высокими формами эоловых песков являются пирамидальные дюны, поднимающиеся на 200--300 м. Общая площадь незакрепленных сыпучих песков составляет 300 тыс. км².

У подножия окружающих Таримскую равнину горных систем простирается полоса подгорных равнин, наиболее широких в предгорьях Куньлуня. Между галечниково-каменистыми песчаными пустынями расположена полоса лёссовидных суглинков с формами рельефа типа ярдангов. Это своеобразный тип дефляционно-останцового рельефа, возникающего в результате развевания горизонтально залегающих лёссовых отложений высотой до 10 м.

Климат Кашгарии отличается крайней сухостью. Годовое количество осадков составляет менее 70 мм, испаряемость превышает годовую сумму осадков в 10--25 раз. Зима холодная, со средними январскими температурами ‑8, ‑11º при минимальных --27 °С. Снег выпадает редко и лежит обычно несколько дней, реки и озера замерзают на три месяца. Лето жаркое (средняя температура июля +25, максимальная + 40 °С).