Другим подклассом изомераз являются внутримолекулярные трансферазы – ферменты, катализирующие перенос функциональных групп в молекуле субстрата. В зависимости от переносимой функциональной группы различают 5 подподклассов:
КФ 5.4.1 переносящие ацильные группы
КФ 5.4.2 фосфотрансферазы (фосфомутазы)
КФ 5.4.3 переносящие аминогруппы
КФ 5.4.4 переносящие гидроксигруппы
КФ 5.4.99 переносящие другие группы
Например, образование глюкозы-6-фосфата из глюкозы-1-фосфат происходит под действием трансферазы. Фосфоглюкомутаза (КФ 5.4.2.2), являющаяся одним из ферментов гликогенолиза катализирует реакцию изомеризации моносахаров:
α-D-глюкозо-1-фосфат ® D-глюкозо-6-фосфат
При катаболизме жирных кислот с нечетным числом углеродных атомов, аминокислот с разветвлённым углеродным скелетом на одной из заключительной стадии происходит изомеризация метилмалоновой кислоты в янтарную. Эта реакция необходима для включения разветвлённых углеводородных скелетов в общий путь катаболизма. При этом изомеризации подвергается не сама кислота, а её производное кофермента А.
Процесс катализируется метилмалонил-КоА-мутазой (КФ 5.4.99.2). Этот фермент, как и некоторые другие ферменты, катализирующие изомеризацию углеродного скелета, использует в качестве кофактора метилкобаламин – активную форму витамина В12.
КФ 6. ЛИГАЗЫ
Главной особенностью этого класса ферментов является сопряженность синтеза с распадом веществ, способных поставлять энергию для осуществления биосинтетических процессов. Лигазы – ферменты, катализирующие реакции конденсации или присоединения, сопряжённые с гидролизом одной из пирофосфатных связей в молекуле АТФ или ГТФ. Деление на подклассы основано по типу образуемой связи: лигазы, образующие С-О связи, образующие С-S связи, образующие С-N связи, образующие С-С связи и другие. Этот класс ферментов состоит из 6 подклассов:
Номер | Название подкласса |
КФ 6.1 | Формирующие С-О связи |
КФ 6.2 | Формирующие С-S связи |
КФ 6.3 | Формирующие С-N связи |
КФ 6.4 | Формирующие С-С связи |
КФ 6.5 | Формирующие эфиры фосфорной кислоты |
КФ 6.6 | Формирующие связи между азотом и металлом |
КФ 6.1. Формирующие С-О связи
Этот подкласс состоит из единственного подподкласса (КФ 6.1.1), в который входят многочисленные аминоацил-тРНК-синтетазы, формирующих аминоацил-t-РНК. Эти ферменты катализируют реакцию конденсации аминокислоты, приводящую к присоединению её в виде аминоацильного остатка по оксигруппе 3'-концевого аденозина одной или нескольких транспортных РНК (тРНК).
Аминокислота + тРНК + АТФ ® аминоацил-тРНК + АМФ + пирофосфат
В результате таких реакций, происходящих с каждой из 20 аминокислот, входящих в состав белков, аминокислоты оказываются рассортированными по соответствующими тРНК. Это имеет важное значение для последующего отбора аминокислот в синтезе белка на рибосомах.